[Genetics] sekvensointi

[Minna Ruokonen]

Moi,

Auli Karhu pyysi kyselemään sekvensointiongelmista meillä. Biomedicumissa
useammalla ryhmällä ja ilmeisesti myös Viikissä on kiinnitetty huomiota
vääriin heterotsygootteihin suorasekvensoinnissa (esim. sama näyte
ajettu 4 kertaa, eri nukleotideja heterotsygoottisena eri toistoissa:
lähes joka kerta eri tulokset) ja tuplapiikkeihin klooneissa. Usein
muutos on ollut G=>A tai C=>T (kirottua!), ja ongelma viittaa siihen, että
vika on kemikaaleissa. Siellä on käytössä v3.1 kuten useimmilla meistäkin
kai on. Jos olette huomannut jotain vastaavaa täällä, ottakaa yst.
yhteyttä Auliin (auli.karhu@helsinki.fi) mahd. pian, aikovat pitää
palaveria asiasta huomenna firman kanssa.

Minna

    = = = = = = = = = = = = = = = = = =
    =  Minna Ruokonen                 =
    =  Department of Biology          =
    =  University of Oulu             =
    =  POB 3000                       =
    =  FIN-90014 University of Oulu   =
    =  FINLAND                        =
    =                                 =
    =  minna.ruokonen@oulu.fi         =
    =  +358-(0)8-553 1802 (office)    =
    =  +358-(0)8-553 1061 (fax)       =
    =  +358-(0)40-7355770 (mobile)    =
    = = = = = = = = = = = = = = = = = =