Biolaitos October 2021

biolaitos@lists.oulu.fi

11 participants
25 discussions

Master's seminar 20.10. including checking progress
by Juhani Hopkins 18 Oct '21

18 Oct '21

Hi, the seminar this week will be a bit different. We'll start normally with two presentations and then move on to seeing how everyone is progressing. The goal is to make sure everyone is doing well and to provide encouragement and help you sort out what to do next. Everyone working on their master's thesis or thinking of starting soonish is welcome to take part, as we'll split participants into groups of people in similar situations. The timetable will be: 14.15 Akseli Ojanperä 14.35 Adebayo Adeyemi 15.00 Luonnon monimuotoisuuden suojeleminen ja uhanalaisuuden torjuminen lukio-opiskelijoiden näkökulmasta - Arvot, asenteet sekä valmius toimia Optimization of Growth Conditions of Floating Hookmoss (Warnstorfia fluitans) in GreenHouse Condtions Checking progress Jonna Tauriainen Clement Masse Plan Plan Heikki Helanterä Annu Ruotsalainen Anna-Maria Pirttilä & Kirsi Valta-Hulkkonen Kaisa Lehosmaa & Annu Ruotsalainen Hopefully as many people as possible will be able to take part. Juhani Hopkins Degree program in Biology University of Oulu +358 (0)294 481 330

1 0

Opettajat: Kurssi-ilmoittautumislistat talteen ti 19.10. mennessä
by Minna Vanhatalo 18 Oct '21

18 Oct '21

Syksyn 1. ja 2. periodin opintojaksoille ilmoittautuneiden opiskelijoiden nimilistojen talteenotto ti 19.10 mennessä Syksyn kursseille ja tentteihin ilmoittautumiset päättyivät pe 15.10. ja huomisen jälkeen Oodi -järjestelmä poistuu käytöstä. Opintojaksojen vastuuhenkilöt, ottakaa talteen WebOodista Excel -listat kursseille ja tentteihin ilmoittautuneista. Niitä voi hyödyntää myös tentti tulosten kirjaamiseen: [cid:image001.png@01D7C40B.C4276740] Valitkaa syksyn 2021 toteutus (jos ette ole arkistoineet listasta aiempien lukuvuosien opetuksia piiloon) Kurssirivin vasemmassa reunassa on [cid:image002.png@01D7C40C.367FB630] Valitkaa Näytä opetustapahtuma Sen jälkeen opintojaksoriviltä [cid:image005.png@01D7C40D.24AF34C0]symboli Lopuksi [cid:image006.png@01D7C40D.24AF34C0] terv. Minna

1 0

Yksikköpalaveri / Unit meeting
by Jouni Aspi 15 Oct '21

15 Oct '21

Aiheita Yliopiston vaalit Influenssarokotukset Yksikön perusrahoitus ensi vuodelle ja budjetin valmistelu Topics University elections Influence vaccinations Basic funding of the unit and budgeting Jouni Aspi is inviting you to a scheduled Zoom meeting. Join Zoom Meeting https://oulu.zoom.us/j/69049641995 Meeting ID: 690 4964 1995 Join by SIP 69049641995(a)109.105.112.236 69049641995(a)109.105.112.235 Join by H.323 109.105.112.236 109.105.112.235 Meeting ID: 690 4964 1995

1 0

FW: Profi 7: yliopiston profilointiteemojen ehdottaminen
by Jouni Aspi 14 Oct '21

14 Oct '21

Subject: Profi 7: yliopiston profilointiteemojen ehdottaminen Hei Yliopisto pyytää profilointiteemaehdotuksia Akatemian profi 7 -hakua varten. Lisätietoa Patiossa ja liitteissä. Meiltä on aiemmin lähtenyt hyviä ehdotuksia ja teillä on varmasti erinomaisia ideoita myös tätä hakua varten. The University requests profiling theme proposals for the Academy's Profi 7 application. More information in Patio and appendices. We have had some good suggestions in the past and you certainly have great ideas for this search as well. Jouni

1 0

Reminder Biology Thursday seminar today: Dr. Mika Simonen: Investigating interspecies interactions
by Heikki Helanterä 14 Oct '21

14 Oct '21

Dear colleagues, a reminder on the Biology Thursday seminar today , 12:15 (zoom link below) with Dr. Mika Simonen on "Investigating interspecies interaction" Mika is currently a post doc in Dr. Pauliina Rautio's group in the Faculty of education, so this week get a slightly different view into investigating interspecific interactions! Abstract: Investigating interspecies interaction In this presentation, I am introducing ethnomethodological conversation analysis for analyzing interspecies interaction occurring between humans and dogs and showing some findings related to their social interaction. Moreover, I'll discuss a new project (CitiRats) and show how transformation from human to bird can be done in interaction. The data are gathered from videotaped materials. More on Mika's work also here: https://blogs.helsinki.fi/human-dog/ See you at noon, Heikki Heikki Helanterä is inviting you to a scheduled Zoom meeting. Topic: Biology Thursday seminar Time: This is a recurring meeting Meet anytime Join Zoom Meeting https://oulu.zoom.us/j/62917763539?pwd=WENZRy9Bb3NlSzlyeVlVamJ4RHR5Zz09 Meeting ID: 629 1776 3539 Passcode: 166151 Join by SIP 62917763539(a)109.105.112.236<mailto:62917763539@109.105.112.236> 62917763539(a)109.105.112.235<mailto:62917763539@109.105.112.235> Join by H.323 109.105.112.236 109.105.112.235 Meeting ID: 629 1776 3539 Passcode: 166151 =============================================== Heikki Helanterä Associate Professor (tenure track) Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358-40-7507 334

1 0

VL: Suurpetojen DNA-tutkimuksen webinaari ja suden DNA-näytekerääjien koulutukset lokakuussa
by Jouni Aspi 13 Oct '21

13 Oct '21

Lähettäjä: Valtonen Mia (Luke) <mia.valtonen(a)luke.fi> Lähetetty: perjantai 8. lokakuuta 2021 12.58 Aihe: Suurpetojen DNA-tutkimuksen webinaari ja suden DNA-näytekerääjien koulutukset lokakuussa Hei, Luke ja Susi-Life hakevat lisää vapaaehtoisia susien DNA-näytekeräykseen. Välittäisittekö alla olevan viestin laitoksenne opiskelijoiden ja henkilökunnan sähköpostilistoille? Yt. Mia ~~~ Mia Valtonen, Erikoistutkija Luonnonvarakeskus (Luke) PL 2 (Latokartanonkaari 9) 00791 Helsinki p. 029 532 2428 / 050 535 4605 Suurpetojen DNA-tutkimuksen webinaari ja suden DNA-näytekerääjien koulutukset ovat lokakuussa DNA paljastaa suurpedoista asioita, joita ei saada tietää millään muulla menetelmällä. Luonnonvarakeskus ja SusiLIFE-hanke järjestävät lokakuussa kaikille avoimia verkkotilaisuuksia DNA-tutkimuksesta. Tervetuloa kuulemaan, miten suurpetojen DNA:ta tutkitaan Kaikista Suomen suurpedoista, eli karhusta, ilveksestä, ahmasta ja sudesta, tehdään DNA-tutkimusta. Miksi? Miten? Ja mitä DNA kertoo pedoista? Kaikille avoimessa webinaarissa Luken viranomais- ja asiantuntijapalveluiden johtaja Katja Holmala ja tutkimusinsinööri Antti Härkälä kertovat, miten suurpetojen perimää tutkitaan ja mitä siitä on saatu tietää. Webinaari järjestetään keskiviikkona 27.10.2021 klo 17.00-18.30. Webinaarin tallenne on katsottavissa kaksi viikkoa tilaisuuden jälkeen. Ilmoittaudu mukaan viimeistään 25.10. Linkki ilmoittautumislomakkeeseen: https://www.lyyti.fi/reg/Webinaari_suurpetojen_DNAtutkimuksesta_0616 Osallistumislinkki lähetetään ilmoittautuneille päivää ennen webinaaria. Lähde mukaan suden DNA-keräykseen Suden DNA:ta analysoidaan ulosteesta. Ulostenäytteitä kerätään DNA-seurantaa varten marraskuun alusta helmikuun loppuun. Luke kouluttaa vapaaehtoisia osaksi Suomen riistakeskuksen koordinoimaa suden näytekeräysverkostoa. Verkosto koostuu vapaaehtoisista luonnossa liikkujista, kuten metsästäjistä ja muista luontoharrastajista. DNA-näytekerääjien lisäksi kullekin keräysalueelle nimetään vähintään yksi keräysvastaava, joka jakaa ohje- ja näytekeräysmateriaalin kerääjille, ottaa vastaan alueen näytteet ja toimittaa ne edelleen analysoitavaksi. Uudet koulutukset järjestetään lokakuussa verkkokoulutuksina. Koulutukseen osallistuminen ei vielä sido mihinkään. Koulutuksien yhteydessä kerrotaan, kuinka pääset alkuun näytteiden etsimisessä ja keräämisessä. Koulutukset ovat keskenään samanlaisia, mutta koulutuksen käytännön esimerkit vaihtelevat alueellisen painotuksen mukaan. Voit osallistua mihin tahansa koulutukseen riippumatta asuinpaikastasi. Ilmoittaudu mukaan viimeistään kaksi päivää ennen koulutusta! Osallistumislinkki lähetetään ilmoittautuneille päivää ennen webinaaria. Tiistai 12.10.2021 klo 18.00-19.30, esimerkit Länsi-Suomesta https://www.lyyti.fi/reg/DNAkeraajakoulutus_3523 Torstai 14.10.2021 klo 18.00-19.30, esimerkit Itä-Suomesta https://www.lyyti.fi/reg/DNAnaytekeraajakoulutus_0971 Tiistai 19.10.2021 klo 18.00-19.30 koulutus ruotsiksi https://www.lyyti.fi/reg/Insamlingen_av_vargdna_3259 Koulutuksista tulee tallenne, joka on katsottavissa kaksi viikkoa koulutuksen jälkeen.

2 1

qPCR training webinars
by Lumi Viljakainen 12 Oct '21

12 Oct '21

Lähettäjä: karttunen, sarah <sarah.karttunen(a)thermofisher.com> Lähetetty: maanantai 11. lokakuuta 2021 13.39 Vastaanottaja: Lumi Viljakainen <lumi.viljakainen(a)oulu.fi> Aihe: RE: Dear Lumi, I wonder if your team might like the attached invitations to our free qPCR training webinars, coming up in mid October? The webinars are great for new PhD students and also for experienced qPCR users to hear detailed explanations about the steps in the qPCR workflow and experimental design. Common pitfalls and problems will be discussed which can really help with experimental troubleshooting. The webinars will be held by our qPCR expert, Björn Rosén, who has vast experience in the field, and he will be available afterwards for Q & A. Björn’s biography plus the agenda of the webinars are described in the attached invitations. The webinars will occur: qPCR Training Webinar – Basic Date: 26th October 2021 Time: 11:00 -12:30 CEST/12:00-13:30 EEST Basic qPCR registration<https://thermofisher.webex.com/mw3300/mywebex/default.do?nomenu=true&siteur…> qPCR Training Webinar - Advanced Date: 28th October 2021 Time: 11:00-12:30 CEST/12:00-13:30 EEST Advanced qPCR registration<https://thermofisher.webex.com/mw3300/mywebex/default.do?nomenu=true&siteur…> You are welcome to share these invitations with your colleagues and team if you like, and registration does not cost anything, so you can always register and then just log in on the day if you have the time😊. Kind regards, Sarah Karttunen, PhD Inside Sales Representative Genetic Sciences Division Thermo Fisher Scientific Life Technologies Europe BV, Nederländerna filial Sverige Box 12650, 112 92 Stockholm Visiting address: Lindhagensgatan 76, 112 18 Stockholm Mobile: +46 (0) 790 662 703 sarah.karttunen(a)thermofisher.com<mailto:sarah.karttunen@thermofisher.com> | www.thermofisher.com<http://www.thermofisher.com/> [cid:image001.png@01D7BE9B.403BFB00]<https://www.thermofisher.com/uk/en/home/products-and-services/promotions/li…> WORLDWIDE CONFIDENTIALITY NOTE: Dissemination, distribution or copying of this e-mail or the information herein by anyone other than the intended recipient, or an employee or agent of a system responsible for delivering the message to the intended recipient, is prohibited. If you are not the intended recipient, please inform the sender and delete all copies.

1 0

Biology Thursday seminar 14th Oct: Dr. Mika Simonen: Investigating interspecies interactions
by Heikki Helanterä 11 Oct '21

11 Oct '21

Dear colleagues, Biology Thursday seminar continues on 14th Oct, 12:15 (zoom link below) with Dr. Mika Simonen on "Investigating interspecies interaction" Mika is currently a post doc in Dr. Pauliina Rautio's group in the Faculty of education, so this week get a slightly different view into investigating interspecific interactions! Abstract: Investigating interspecies interaction In this presentation, I am introducing ethnomethodological conversation analysis for analyzing interspecies interaction occurring between humans and dogs and showing some findings related to their social interaction. Moreover, I'll discuss a new project (CitiRats) and show how transformation from human to bird can be done in interaction. The data are gathered from videotaped materials. More on Mika's work also here: https://blogs.helsinki.fi/human-dog/ See you online on Thursday, Heikki Heikki Helanterä is inviting you to a scheduled Zoom meeting. Topic: Biology Thursday seminar Time: This is a recurring meeting Meet anytime Join Zoom Meeting https://oulu.zoom.us/j/62917763539?pwd=WENZRy9Bb3NlSzlyeVlVamJ4RHR5Zz09 Meeting ID: 629 1776 3539 Passcode: 166151 Join by SIP 62917763539(a)109.105.112.236<mailto:62917763539@109.105.112.236> 62917763539(a)109.105.112.235<mailto:62917763539@109.105.112.235> Join by H.323 109.105.112.236 109.105.112.235 Meeting ID: 629 1776 3539 Passcode: 166151 =============================================== Heikki Helanterä Associate Professor (tenure track) Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358-40-7507 334

1 0

Maisteriseminaari / Master of science seminar 13.10.
by Juhani Hopkins 11 Oct '21

11 Oct '21

Maisteriseminaari / Master of science seminar 13.10. https://oulu.zoom.us/j/66787207738 Starting time 14.15 15.00 15.20 Presenter Timo Piepponen Anni Heikkilä Sanni Vesala Title Kiiltomatotoukat vaarallisilla teillä Psoriaasin geneettinen epidemiologia: genominlaajuinen assosiaatioanalyysi ja riskitekijöiden kausaalisuhteet Pohjois-Savon ja Pohjois-Karjalan lehtojen kasvillisuusmuutokset 45 vuoden aikana Opponent Hugo Rauhamaa Paavo Korpelainen Anne Asikainen Result or plan Result Plan Results Professor Timo Muotka Heikki Helanterä Anna Ruotsalainen Supervisors Topi Lehtonen, Arja Kaitala & Juhani Hopkins Eeva Sliz, Lumi Viljakainen & Johannes Kettunen Risto Virtanen & Lauralotta Muurinen

1 0

Käyttökatko: marraskuussa hyväksyttävät tutkielmat
by Minna Vanhatalo 08 Oct '21

08 Oct '21

Laturi/Oodi/Peppi -käyttökatkon vaikutukset tutkielmien hyväksymiseen LuK- ja pro gradu- tutkielmat marraskuussa, ohjeet opettajille: * ohjaaja toimittaa tarkastajien nimeämislomakkeen study.science(at)oulu.fi kuten tähänkin asti * opiskelija antaa suostumuksensa opinnäytetyön julkaisua varten erillisellä lomakkeella, joka liitetään opinnäytetyön liitteeksi (yliopistotason lomake valmisteilla) * opiskelija lähettää valmiin LuK -tutkielmansa/gradunsa pfdA-luodossa study.science(at)oulu.fi, josta se edelleenvälitetään tarkastajille arviointilomakkeen kera * opinnäytetyön plagioinnintunnistus tapahtuu erikseen Moodleen kytkettävässä Turnitin -järjestelmässä (tästä tulee tarkempaa tietoa myöhemmin) * LuK-tutkielmat hyväksyy työn ohjaaja ja toinen tarkastaja * biologian gradutyöryhmän hyväksyy pdfA gradut 23.11. * opiskelijan tulee aloittaa opinnäyteprosessi uudessa Laturissa heti käyttökatkon jälkeen. Hyväksytty työ käy läpi koko Laturi-prosessin, jonka jälkeen työ julkaistaan julkaisuarkisto Jultikassa. * käyttökatkon aikana valmistuneiden opiskelijoiden (=opiskelijatunnukset eivät ole enää voimassa) hyväksytyt opinnäytteet siirretään manuaalisesti julkaisuarkisto Jultikaan. * suoritusmerkintä Pepin opintorekisteriin Pepin avautuessa Opiskelijoille 8.10. lähetetty viesti: Marraskuussa opinnäytetyön tarkastus- ja hyväksymisprosessi tapahtuu manuaalisesti: * opiskelija lähettää valmiin opinnäytetyönsä (LuK-tutkielma, pro gradu -tutkielma) pdfA-muodossa viimeistään viikolla 44 (1.-5.11) osoitteeseen study.science(at)oulu.fi * opiskelija antaa suostumuksensa opinnäytetyön julkaisua varten erillisellä lomakkeella, joka liitetään opinnäytetyön liitteeksi (yliopistotason lomake valmisteilla) * opinnäytetyön plagioinnintunnistus tapahtuu erikseen Moodleen kytkettävässä Turnitin -järjestelmässä * vaikka tutkinto-ohjelma hyväksyy työn, niin opiskelijan tulee kuitenkin aloittaa opinnäyteprosessi uudessa Laturissa heti käyttökatkon jälkeen. Hyväksytty työ käy läpi koko Laturi-prosessin, jonka jälkeen työ julkaistaan julkaisuarkisto Jultikassa. * suoritusmerkintä siirtyy Pepin opintorekisteriin joulukuussa ....____ ____ ____ The thesis review and approval process takes place manually in November: * the student sends her/his completed Pro gradu thesis in pdfA-format to study.science(at)oulu.fi latest week 44 (1.11.-5.11.) * the student gives his/her consent for the publication of the thesis on a separate form, which is attached as an appendix to the thesis (university level form is under construction) * plagiarism detection takes place in Moodle using Turnitin system * gradu thesis meeting accepts theses in 23.11. * even after the thesis is acceptance, student must start the thesis process in new Laturi once the system downtime is over. The approved thesis goes through the Laturi process and after that will be published in University of Oulu repository Jultika. * the credits will be registered to Peppi system in December terv. Minna

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

2003

Biolaitos October 2021