Biolaitos January 2024

biolaitos@lists.oulu.fi

14 participants
29 discussions

Yearly lab cleanup date
by Petri Sundqvist 17 Oct '24

17 Oct '24

Hello Everybody, Here is the long promised calendar voting link for the yearly lab cleanup, which will be arranged on the last two weeks of September: https://webapp.oulu.fi/framadate/studs.php?poll=dzJVegtsQJ23KIzT I will close this vote in 7 days on 13th of September, which is next weeks Wednesday. This year we will focus on Molecular Labs, Cardboard Box Storage (which is the second floor storage near microbe laboratory) and Multipurpose laboratory (where I sit nowadays). We will be printing a blueprint of the molecular labs where every user can reserve the table space of molecular lab corridors/slots for your group a few weeks at a time. This way we can maximize the use of table space which has been running low. We are also asking for every group who works in the molecular labs to join the cleanup day, because we have to clear the cabins and shelves of long term storage items and move those to the cardboard box storage, or the more often used things to the storage next to deep freezer room. We are also hoping to transfer all the empty pipette tip boxes to cardboard box storage, since they need to be refilled in order to be valuable in the laboratory. We also encourage everybody to go through the Cardboard Box Storage and renew the names and dates on the boxes. If the date is older than 2 years, the boxes will be evaluated by our lab people, taken to common use (which might mean keeping them in storage for future) or discarded if there is nothing valuable there. Currently there are quite many boxes labelled to year 2021 so after the turn of year 2024 they will be evaluated. We will also be cleaning the Multipurpose laboratory. We will be placing all the unmarked stuff that is stored here also in cardboard boxes and transfer them into the cardboard box storage. The boxes will be labelled Multipurpose Lab and the labels will not be renewed in the coming years, so if you have a feeling your stuff is here, please join the laboratory cleaning day. BR, Petri Sundqvist

1 14

Töihin Ötökkäakatemian koordinaattoriksi?
by Heikki Helanterä 31 Jan '24

31 Jan '24

Ötökkäakatemia etsii uutta määräaikaista koordinaattoria! Hei sinä tiedeviestinnästä innostunut ötökkäfani! Jos olet elementissäsi somen, tieteen, organisoinnin ja viestinnän parissa, hae meille määräaikaiseksi koordinaattoriksi. Ötökkäakatemia (www.ötökkäakatemia.fi<http://www.ötökkäakatemia.fi>) on tiedeviestinnän hanke, jonka tarkoitus on kansantajuistaa Suomessa tehtävää selkärangattomien tutkimusta ja tuoda esille ötököiden ekologiaa. Nykyinen tutkijaverkostomme kattaa melkein kaikki Suomen yliopistot sekä tutkijoita Suomen Ympäristökeskuksesta ja Luonnonvarakeskuksesta. Teemme yhteistyötä mm. koulujen, varhaiskasvattajien ja hyönteisharrastajaryhmien kanssa. Haemme nyt joukkoomme uutta koordinaattoria. Koordinaattorin tehtäviin kuuluu muun muassa: ● hankkeiden suunnittelu, koordinointi ja toteutus yhdessä ötökkäakatemialaisten kanssa ● somekanaviemme (Facebook, Instagram, X, YouTube) ylläpitäminen ja kehittäminen ● videoiden ja podcast-jaksojen tekeminen ● blogitekstien kirjoittaminen ● sidosryhmien ja tutkijoiden kanssa vuorovaikuttaminen o mm. somevuorojen ja blogitekstien organisointi ● kuukausittaisten kokousten vetäminen ● apurahahakemusten kirjoittamisessa avustaminen ● tapahtumiin osallistuminen Ötökkäakatemian edustajana (työ voi sisältää matkustamista) Tehtävässä auttavat: ● korkeakoulututkinto liittyvältä alalta (esim. biologia, viestintä) ● kiinnostus tiedeviestintään ja ötököihin ● viestintäkokemus tai -opinnot ● organisointikyky ● kokemus graafisesta suunnittelusta ja videoiden / äänen editoinnista ● innokas asenne ja halu oppia uutta ● ymmärrys akateemisen maailman toiminnasta (tutkimusten tekeminen, julkaisutoiminta, rahoitus ym.) Tarjoamme: ● mahdollisuuden vaikuttaa ja kehittää ainutlaatuista tiedeviestintäprojektia ● mahdollisuuden verkostoitua alan asiantuntijoiden kanssa ● joustavan työaikataulun ● käytännön kokemusta tiedeviestinnästä Työ alkaa maaliskuussa ja jatkuu kesäkuun loppuun. Jatko on mahdollista, jos saamme seuraavaan projektiimme rahoituksen. Työsuhde on Oulun yliopiston kanssa (etätyö mahdollista). Työ sopii myös opiskelijalle, koska työaika on joustavaa ja osa-aikaista (50 %). Työtehtäviä voidaan räätälöidä osaamisen mukaan, ja tekemällä oppii! Peruspalkka 50%:lla työntekijällä on n. 1200 € / kk, jonka lisäksi palkkaan kuuluu henkilökohtaisen suoriutumisen mukaan laskettava osuus (tyypillisesti 10-20%) Jos työnkuva kiinnostaa, hae rohkeasti, vaikkei kaikista tehtävistä olisikaan vielä kokemusta! Tärkeintä on aito kiinnostus tiedeviestintään, tieteeseen ja ötököihin. Hakuaika loppuu 15.2.2024 Hakemukset ja lisäkysymykset: jasmin.nevala(a)oulu.fi<mailto:jasmin.nevala@oulu.fi> ja heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> " Terveisin Heikki / Ötökkäakatemia =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358 50 4700 545

1 0

Slides from yesterdays presentation of PhD studies
by Laura Kvist 31 Jan '24

31 Jan '24

Hei, Please find attached the slides I presented yesterday about the Biology doctoral studies and some changes to come. In relation to the topics presented on the slides, we discussed some additional things: - Publication targets and costs: o We of course aim to as high-class journals as possible with the publications included in the thesis. For choosing the journals, you may find the JUFO classification helpful in addition to impact factors: https://www.tsv.fi/julkaisufoorumi/haku.php?lang=en o Our university is a part of FinELib, which has agreements with several publishers that allow for discounts and free-of-charge open publishing: https://libguides.oulu.fi/openpublishing/discounts - Kaamos preparations are about to get started; a kick-off meeting will happen soon. This year, the Kaamos symposium will take place on 4.-5.12. - A peer support group among PhD students will be formed: regular informal meetings to socialize and help each other with various topics related to life as a PhD researcher Cheers, Laura ******************************************* Dr. Laura Kvist Docent in Molecular ecology and evolution Ecology and Genetics Research Unit University of Oulu

1 0

Sterilization oven is broken in solvent lab
by Petri Sundqvist 30 Jan '24

30 Jan '24

Hello, I took the stuff out on the table from the oven, I encourage to check it out if some are yours. I will so some troubleshooting and hopefully repair the oven within coming weeks. BR, Petri S LähetettyOutlook for Android<https://aka.ms/AAb9ysg>

1 0

Unit meeting / Yksikkökokous: Development discussions / kehityskeskustelut
by Heikki Helanterä 30 Jan '24

30 Jan '24

Dear colleagues,, this week's unit meeting will be the kick-off for this year's development discussions, "goal discussion" (tavoitekeskustelu) where according to the guidelines " operations, results and goals of the unit are discussed... At the same time the results of the well-being questionnaire and development target can be discussed." https://patio.oulu.fi/en/services-and-instructions/personnel/competence-dev… https://patio.oulu.fi/fi/palvelut-ja-ohjeet/henkilosto/osaamisen-kehittamin… Hope to see as many of you as possible online on Friday, Heikki Heikki Helanterä is inviting you to a scheduled Zoom meeting. Join Zoom Meeting https://oulu.zoom.us/j/63772475981?pwd=QnJvcmpIVEN2VnJmT1dIVEZ3Z1VtUT09 Meeting ID: 637 7247 5981 Passcode: 026437 --- Join by SIP 63772475981(a)109.105.112.236 . 63772475981(a)109.105.112.235 --- Join by H.323 . 109.105.112.236 . 109.105.112.235 Meeting ID: 637 7247 5981 Passcode: 026437

1 0

Lisäys FW: Opintojaksokuvausten laatiminen Peppiin (DL 31.1.2023)/ Preparing course descriptions into Peppi (DL 31.1.2023)
by Minna Vanhatalo 30 Jan '24

30 Jan '24

Hei, ohessa opintojaksokuvausten päivityksen vastuuhenkilöille avuksi vastuuopet-tiedosto niistä opintojaksoista, joiden kuvauksen vastuuhenkilöksi teidät on nimetty Peppiin. Hakekaa sukunimi -sanahaulla oma nimenne. Lumi Viljakainen on nimennyt yhteisten kurssien kuvausten päivittäjäksi yhden henkilön (työnjakoa). Tällaisilla opintojaksoilla varmistakaa kollegoiltanne, että esim. kirjakuulustelulistat ovat ajan tasalla. Opintojaksolistatiedosto auttaa myös löytämään oikean opintojakson Pepissä kun teette kuvauksen päivityksen. Opettajan työpöytä -> [cid:image002.png@01D924FB.67450CB0] -> Opintojaksot -> tunniste kohtaan kirjoita opintojakson koodi Opintojakson kuvausta pääsette päivittämään muokkaa -painikkeella. Osassa kursseista on edelleen käytössä A/s kooditus, joten näiden kurssien kohdalla kurssikuvauksen joutuu päivittämään molemmille koodeille (löytyvät oheisesta doc -tiedostosta) Kurssikuvauksiin päivitetään myös Esitietovaatimukset (edentävät opintojaksot) ja muut kurssisuositukset. Oheisesta biologian tutkinto-ohjelmatoimikunnan vahvistamasta liitetiedostosta löydätte ne kurssit, joiden koodi tai nimi muuttuu seuraavalle lukuvuodelle tai ovat poistumassa ensi syksynä. Opintojaksojen kuvauksiin on periytynyt Oodiajoilta Lisätietoja -kenttä, jossa voi olla vanhentunutta tekstiä esim. opettajien nimet ja suorituskielen voi poistaa siltä kohdalta, koska nimet ovat ajan tasalla opintojakson järjestelmätiedoissa. Tässä kentässä on kuitenkin tärkeitä lisätietoja opiskelijoille, joita ei saa poistaa, kuten ajoitus ja kohderyhmä: [cid:image001.png@01D924FB.0D551010] Kun olette päivittäneet kuvauksen (on vielä avoinna), merkatkaa ensin väkäset kahteen ao. kohtaan ja vasta sen jälkeen painakaa sinistä kuvauksen tallennus -namikkaa. [cid:image003.png@01D924FD.948C78A0] Opintojaksokuvauksen vasemmassa reunassa olevista muista kohdista teidän ei tarvitse välittää: Liitokset, vastaavuudet yms. Siellä näkyy myös hämäävästi Tarkistus-välilehti, joka ei ole käytössä. terv. Minna From: kopa-bounces(a)lists.oulu.fi <kopa-bounces(a)lists.oulu.fi> On Behalf Of opetuksenpalvelut(a)oulu.fi Sent: tiistai 10. tammikuuta 2023 13.09 To: 'yo-opettajat' <yo-opettajat(a)lists.oulu.fi> Cc: to-vastuuhenkilot(a)lists.oulu.fi; kopa(a)lists.oulu.fi Subject: [Kopa] Opintojaksokuvausten laatiminen Peppiin (DL 31.1.2023)/ Preparing course descriptions into Peppi (DL 31.1.2023) Hyvät opintojakson vastuuhenkilöt, Hyvää uutta vuotta kaikille. Tästä viestistä löydät ohjeet ja aikataulut opintojaksokuvausten päivittämiseen. Opintojaksokuvausten laatimisen vastuut ja ohjeet Kuten aiempinakin vuosina, opintojakson vastuuhenkilö laatii tai tarkistaa opintokuvaukset uudelle lukuvuodelle 2023–2024 tammikuun aikana (9.-31.1.2023). Tällä kierroksella opintojakson vastuuhenkilö päivittää opintojakson tiedot suoraan Pepin opettajan työpöydällä. Ohje opintojaksokuvauksen päivittämiseen löytyy Patiosta Opintojakso- ja toteutuskuvauksen laatiminen<https://patio.oulu.fi/fi/palvelut-ja-ohjeet/koulutuksen-palvelut/opintojaks…> -sivulta. Tuolta sivulta löydät myös linkit, miten opintojaksokuvaus käytännössä päivitetään Pepissä. Kun olet laatinut tai tarkistanut opintojaksokuvauksen, kuittaa Pepissä, että kuvaus ja sen käännös on tarkistettu. Opintojakso- ja toteutuskuvausten laatimisen ja lukujärjestystietojen tarkistamisen aikataulu Opintojakso- ja toteutuskuvausten laatimisen, tarkistamisen ja muokkaamisen sekä lukujärjestystietojen tarkistamisen aikataulu kokonaisuudessaan lukuvuodelle 2023–2024 on seuraava: * Opintojaksojen vastuuhenkilöt (ml avoimen yliopiston opintojaksot) lukuvuodelle 2023–2024 nimetään 15.12.2022. * Opintojakson vastuuhenkilö päivittää opintojaksokuvauksen aikavälillä 9.–31.1.2023. * Koulutuksen lähipalvelut kerää lukujärjestystyön tiedot opintojaksojen vastuuhenkilöiltä (koko lukuvuoden 2023-2024 osalta) 2.–31.1.2023. * Oulun yliopiston opinto-opas julkaistaan 15.2.2023. * Opintojakson vastuuhenkilö tarkistaa opintojaksokuvauksen opinto-oppaalta aikavälillä 15.2.–31.5.2023. * Opintojakson vastuuhenkilö tarkistaa opintojakson toteutuksen lukujärjestystiedot ja täydentää toteutuksen kuvaustiedot syyslukukauden 2023 osalta 3.4.–31.5.2023. * Opintojakson vastuuhenkilö tarkistaa opintojakson toteutuksen lukujärjestystiedot ja täydentää toteutuksen kuvaustiedot kevätlukukauden 2024 osalta 6.–30.11.2023. Tukipyynnöt Jos tarvitset neuvoja opintojakson, toteutuksen tai lukujärjestystietojen päivittämisessä, ota yhteyttä koulutuksen lähipalveluihin. Iloa ja tsemppiä kevätlukukauden opetukseen! Terveisin, Jatkuvan oppimisen ja opetuksen palvelut *** Dear persons in charge of the courses, Happy New Year to all. In this message, you will find instructions and schedules for updating course descriptions. Responsibilities and instructions for preparing course descriptions Similar to previous years, the person in charge of the course prepares and checks the course descriptions of the upcoming academic year 2023–2024 in January (between 9.–31.1.2023). During this cycle the person in charge of the course updates the course’s information directly in Peppi Teacher’s desktop. Instructions for updating course descriptions can be found on the Preparing course and implementation descriptions<https://patio.oulu.fi/en/services-and-instructions/education-services/cours…> page in Patio. From there, you can also find links to instructions on how to update the course descriptions into Peppi in practice. After preparing and checking the course description, please mark both the description and the translation as checked in Peppi. The schedule for preparing course and implementation descriptions and checking timetable information For the academic year 2023–2024 the schedule for preparing, checking and editing course and implementation descriptions at the University of Oulu is as follows: * The persons in charge of the courses for the academic year 2023–2024 (including Open University courses) will be appointed by 15.12.2022. * The persons in charge of the courses will update the course descriptions within 9.–31.1.2023. * Academic Affairs Service Teams collect the timetable planning information from the persons in charge of the course (for the entire academic year 2023-2024) within 2.–31.1.2023. * The Study Guide of the University of Oulu<https://opas.peppi.oulu.fi/en/index?period=2022-2023> is published on 15.2.2023 * The person in charge of the course checks the course descriptions on the Study Guide between 15.2.–31.5.2023. * The person in charge of the course checks the course's implementation's timetable information and fills in implementation's description information for the Autumn term 2023 and makes needed changes between 3.4.–31.5.2023. * The person in charge of the course checks the course's implementation's timetable information and fills in implementation's description information for the Spring term 2024 and makes needed changes between 6.–30.11.2023. Support requests In case you need advice with updating the course, implementation, or timetable information, contact the Academic Affairs Service Teams. Have fun and cheers for spring semester teaching! Best regards, Services for Continuous Learning and Teaching

1 2

LUKUJÄRJESTYS 2024-2025: tiedot toimitettava 31.1. mennessä
by Minna Vanhatalo 30 Jan '24

30 Jan '24

Hei, toimittakaa minulle 31.1.2024 mennessä lukuvuoden 2024-2025 opetustiedot lukujärjestysten laatimista varten. Mitä nopeammin saan tiedot, sen nopeammin pääsen suunnittelemaan opetusta järjestelmään. Nopeus tietojentoimituksessa on erityisen tärkeää, sillä Pepissä lukujärjestystyö on aina aloitettava alusta (varaukset eivät kopioidu seuraavalle lukuvuodelle kuten aikoinaan). Opintojakson vastuuopettaja toimittaa tiedot kootusti ja ilmoittaa myös muiden opintojaksolla opettavien nimet. Jos on tiedossa tarkasti, kuka opettaja hoitaa kunkin luento/harjoitusosuuden (opintojakso, jolla monta opettajaa), niin ilmoittakaa tarkasti tunnit (esim. 5 ensimmäistä luentoa se ja se, sitten jne.), jottei turhan takia kaikkia opetustunteja tarvitse laittaa kaikille opettajille (hankaloittaa opetuksen suunnittelua, jos kaikki tunnit merkitään kaikille opettajille). Kesän 2025 kenttäkurssien päivämäärät pitää ilmoittaa jo nyt. Uusina kaikille opintojaksoille kysyttävänä tietona on: * Laitetaanko Ilmoittautumisten automaattinen hyväksyntä (järjestelmä hyväksyy opiskelijat automaattisesti ilmoittautumisjärjestyksessä)? Suosittelen, että tätä toimintoa käytetään ainoastaan massaluennoilla (ei ole pakko). En suosittele käytettävän kursseilla, joissa on harjoitusryhmiä. Esim. käy niin, että ryhmä täyttyy toisten tutkinto-ohjelmien opiskelijoista, joille kurssi ei ole pakollinen (Peppi hyväksyy kurssille), samaan ryhmään hieman myöhemmin ilmoittautuneet biologian opiskelijat (kurssi pakollinen) hylätään ryhmästä ilmoittautumisajan päätyttyä <- Aiheuttaa turhaa viestitulvaa, jälkiselvittelyä ja lisätyötä opettajalle jos ryhmät tulevat täyteen ja hylättyinä on biologian opiskelijoita. Pepissä ei ole toimintoa, joka estää ilmoittautumiset ryhmäkoon täytyttyä. * Opetusmuoto? 1.Kampus-/ lähiopetus 2. Joustava opetus/ monimuoto-opetus vai 3. Etä-/ verkko-opetus Liitteissä tarkemmat ohjeet: * yleiset ohjeet (mm. periodien opetuspäivät) * opintojaksolista 2024-2025 opetuksesta (tarkentakaa/korjatkaa/lisätkää) * Word -pohja opintojaksotietojen ilmoittamiseen TAI Kopan Excel-pohja tietojen ilmoittamiseen <- tutustukaa myös tuohon excel-pohjaan ja täyttäkää joko se tai Word-lomake, johon otatte huomioon tarvittaessa excelissä olevia asioita terv. Minna

1 1

Maisteriseminaari keskiviikkona 24.1. / Master's seminar on Wednesday 24.1
by Veli-Matti Pakanen 29 Jan '24

29 Jan '24

Heippa kaikille, Seuraava maisteriseminaari on keskiviikkona 24. tammikuuta. Muistakaa kirjautua zoomiin omalla nimellä. Suoritusta ei voida kirjata muuten. Hello everyone, The next master’s seminar will be on Wednesday 24th of January. Remember to use your name in zoom. https://oulu.zoom.us/j/64668752013 24.1.2024 Wednesday Time Speaker Title Opponent Plan/ Result Professor Supervisors 14.15–16.00 Erika Ojala DNA saannon optimointi ammuttujen messinkihylsyjen pinnalta Katri Sipola Results Heikki Helanterä Lauri Vaahtera, Heikki Helanterä

1 1

FW: Dekaanien vierailu tutkinto-ohjelmissa/biologia
by Lumi Viljakainen 25 Jan '24

25 Jan '24

Tervetuloa keskustelemaan tutkinto-ohjelman ajankohtaisista asioista yhdessä dekaani Maarit Järvenpään ja koulutusdekaani Saana-Maija Ahon kanssa 13.2.2024 klo 13.00-15.00 luentosaliin L10. Tilaisuus on avoin koko tutkinto-ohjelman/tutkimusyksikön henkilökunnalle, erityisesti opetushenkilöstön osallistumista toivotaan!

1 1

Biology Thursday seminar today at 14:15 in room IT113: Prof. Janne Soininen on Diatom island biogeography
by Heikki Helanterä 25 Jan '24

25 Jan '24

Dear colleagues, a reminder: Biology Thursday seminar today 25th Jan with an on-site seminar at 14:15 in room IT113 - note unusual time! Our speaker is Prof. Janne Soininen from the university of Helsinki, on "Diatom island biogeography" Island biogeography has traditionally been investigated for larger organisms such as plants, birds or insects while biodiversity patterns and drivers for micro-organisms on islands are poorly understood. In this seminar, I will talk about diatom biodiversity on islands globally and how it relates to similar sized continental areas. The results show that island diatoms do not show species-area relationships and biodiversity is lower on islands than continental areas. However, such findings may be explained by island environmental conditions rather than dispersal limitation. The ongoing BIOISLAND project will further reveal various aspects of island biodiversity and how they relate to ecosystem functions. More on Janne's research at: https://blogs.helsinki.fi/jhsoinin/ and https://scholar.google.fi/citations?user=tXDldfgAAAAJ&hl=fi&oi=ao Also note that Janne will be the opponent of Jacqueline Malazarte's PhD defence tomorrow, Fri 26th Jan - more info here: https://www.oulu.fi/en/theses/microbial-metacommunities-subarctic-streams The seminar program for this semester is still taking shape - the program will be updated here as it develops: https://thursdayseminarbiology.wordpress.com/ Cheers, Heikki =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358 50 4700 545

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

2003

Biolaitos January 2024