HUOM: kaikkien luokkien tuki on siirtynyt mikrotilat@oulu.fi -palvelun alle. Lisäksi: nykyisen tiedon mukaan luokkatila säilyy käytössä syksyllä 2017, mutta koneet muuttuvat Koneet on muutettu (vdi)päätteiksi. Joitain koneita tullaan poistamaan luokasta kesän aikana, mutta päätteet asennetaan vasta elokuussa.

Luokan varaukset hoidetaan nykyisin Timmin kautta. Tämän takia koneisiin on lisätty mahdollisuus ajaa samaa etäpalvelua yliopiston VDI-luokkahuoneissa. Tämä antaa mahdollisuuden käyttää sellaisia ohjelmia joita ei ole asennettu biologian luokkana muuten toimivaan tilaan.

Käynnistämällä ohjelman VMware Horizon Client (työpöydältä tai Start > VMware -valikosta) saa - kaksoisklikkaamalla vdi.oulu.fi - käyttöönsä yliopiston palvelimella toimivia virtuaalikoneita:

• Mikrotilat. Tämä on sama Windows-asennus kuin yliopiston itseopiskelutyöasemissa tai monissa mikroluokissa. Mukana on biologian ohjelmista MEGA7 ja monia yleisiä ohjelmia kuten R, joten tätä kannattaa käyttää jos vastaa omaa tarvetta. Kovin paljon asennukseen ei voi lisätä vain yhden oppialan ohjelmia, jotta ohjelmalistasta ei tule liian sekavaa, mutta tärkeimpiä ohjelmia voi aina ehdottaa mukaan liitettäväksi.
• Biologia. Tämä on samantyyppinen biologian ohjelmilla varustettu Windows-virtuaalikone kuin käytössä ollut, pöytäkoneessa toimiva (ja alla kuvattu), virtuaalikone, mutta nyt siis luotuna vdi-alustalle. Testatkaa tässä olevien ohjelmien toimivuutta! Toki perinteinen virtuaalikone pidetään ainakin jonkin aikaa varalla.

Ohjelmat kuten MS Office ja Matlab ovat koneissa asennettuna normaaliiin tapaan. Kohdasta Start > All Programs > Virtuaalikoneet > biologia-win7-32 käynnistyy virtuaalikone, jossa ajetaan biologian ohjelmia. HUOM: virtuaalikoneelle luodut tiedostot pitää siirtää muualle ennen koneen sulkemista, koska mitään virtuaalikoneeseen tehtyjä muutoksia ei talleteta! Helpointa on siirtää tiedostoja hiirellä "retuuttamalla" virtuaalikoneen ja isäntäkoneen välillä. Testailkaa että osaatte tehdä tätä, jotta dataa ei häviä!

• Laittakaa muistitikku tietokoneeseen ennen kuin käynnistätte virtuaalikoneen. Kun kone on päällä, "retuuttakaa" tikulta (tai isäntäkoneen levyltä tai verkkolevyltä) tarvittavat tiedostot virtuaalikoneen työpöydälle, ja avatkaa ohjelmissa vain näitä jo virtuaalikoneella olevia tiedostoja. Em. kopiointi onnistuu vain kun virtuaalikoneen ikkunaa ei laajenna koko näytön suuruiseksi.
• Virtuaalikoneen genemapper tunnistaa salasanan "salasana".

Verkosta tämä sivu löytyy biologian laitoksen wikistä https://wiki.oulu.fi/display/biologia (biologien kannattaa laittaa tuo Favourite Spaces -listalle). Kyselyt koneista ja niiden ohjelmista osoitteeseen lutek@oulu.fi.

Matlabin toolboxit Population Genetics and Evolution TB ja Molecular Biology and Evolution TB on kopioitu koneisiin, ja edellisen pääohjelman saa käyntiin komennoilla

addpath 'C:\Software\MBEToolbox'
addpath 'C:\Software\PGEToolbox'
run PGEGUI

Jos rivit laittaa tekstitiedostoon startpge.m (tms.) ja käynnistää (F9) sen Matlabissa, pääsee kaikkein helpoimmalla. Matlabiin kuuluu automaattisesti myös Bioinformatics TB.