Crc June 2020

crc@lists.oulu.fi

8 participants
32 discussions

Osa soluviljelyn pipeteistä on huollossa / Some of cell culture pipettes are in maintenance
by Antti Haapalainen 23 Jun '20

23 Jun '20

Hei, Seuraavat pipetit (yhteensä 4 kpl) on tänään lähetetty puhdistettavaksi ja kalibroitavaksi: 100-1000 ul (huoneista 341B ja 342B) 10-100 ul (huoneista 341B ja 342B) Hi, The following pipettes (a total of 4 pcs) have been sent for cleaning and calibration: 100-1000 ul (from 341B ja 342B) 10-100 ul (from 341B ja 342B) Terv. Antti

1 0

CRC:n syväjääpakastimet ja "pakastekävely"
by Antti Haapalainen 23 Jun '20

23 Jun '20

Hei, Huomenna keskiviikkona 24.6. tehdään se "pakestekävely" lastentunneliin eli tällöin tulee tutuksi paikka, jossa on CRC:n ryhmien syväjääpakastimet (tämä siis hälytysten takia, jos pakastimia rikkoontuu). Kokoontuminen hissiaulassa klo 13:00. Opastus tapahtuu Saijan johdolla. Terv. Antti

1 0

Muutoksia CRC:n nestetyppitankin täyttämiseen / Changes to fill the liquid nitrogen tank in CRC
by Antti Haapalainen 22 Jun '20

22 Jun '20

Hei, Tässä muutoksia CRC:n nestetyppitankin täyttöön liittyen: - tyhjä nestetyppitankki haetaan CRC:n tiloista (343B) maanantaisin (yleensä aamupäivän aikana). - nestetyppitankki täytetään maanantaina ja tuodaan takaisin CRC:n huoneeseen 343B maanantaipäivän aikana. - jos nestetyppitankkia ei tarvitse täyttää maanantaina, tästä ilmoitetaan perjantaina viimeistään klo 12 (040-725 6353 tai timo.kokkoniemi(a)oulu.fi<mailto:timo.kokkoniemi@oulu.fi>) - nestetyppitankkia ei siis tarvitse tyhjentää heti aamulla perjantaina. - jos nestetyppeä kuluu paljon ja sitä tarvitaan viikon aikana lisää, lisätäytöt tehdään keskiviikkoisin. Pyyntö lisätäytöstä tehdään tällöin tiistaina (040-725 6353 tai timo.kokkoniemi(a)oulu.fi<mailto:timo.kokkoniemi@oulu.fi>). - nämä muutokset tulevat voimaan heti ja ovat voimassa jatkuvasti. Hi, Here are the changes related to filling the liquid nitrogen tank in CRC: - an empty liquid nitrogen tank is collected from the CRC premises (343B) on Mondays (usually during the morning). - the liquid nitrogen tank is filled on Monday and brought back to CRC room 343B during Monday. - if the liquid nitrogen tank does not need to be filled on Monday, this needs to be reported no later than noon (12:00) on Friday (040-725 6353 or timo.kokkoniemi(a)oulu.fi<mailto:timo.kokkoniemi@oulu.fi>) - it is therefore not necessary to empty the liquid nitrogen tank immediately in the morning on Friday - if liquid nitrogen is consumed a lot and more is needed during the week, additional refills will be made on Wednesdays. A request for additional filling is then made on Tuesday (040-725 6353 or timo.kokkoniemi(a)oulu.fi<mailto:timo.kokkoniemi@oulu.fi>). - these changes will take effect immediately and will stay as such permanently. Terv. Antti Haapalainen

1 0

High importance! NEW call for Flagship and Infrastructure call!
by Emma Pirilä 16 Jun '20

16 Jun '20

IN ENGLISH BELOW Suomen hallituksen lisätalousarvioesityksen mukaisesti Suomen akatemia avaa Lippulaiva- ja FIRI-haun hyvin nopealla aikataululla. Lue alla olevat tiedot/ohjeet molemmista hauista ja huomaa erittäin tiukka aikataulutus! Ehdota uutta Oulun yliopiston lippulaiva-aihetta Suomen hallitus on päättänyt vuoden 2020 neljännessä lisätalousarvioesityksessä suunnata rahoitusta uuteen lippulaiva-hakuun 25 milj. euroa. Oulun yliopiston saamien ennakkotietojen mukaan Suomen Akatemia tulee aukaisemaan nopealla aikataululla lippulaivahaun ja rahoituspäätökset tullaan tekemään vuoden 2020 aikana. Haun kriteerit tulevat olemaan saman tyyppiset kuin aikaisemmin avoinna olevissa vastaavissa haussa. Ennakkotietojen mukaan haut avautuvat 30.6.2020 ja sulkeutuvat viimeistään 31.8.2020. Yliopiston rehtoraatti käsittelee ehdotukset heinäkuun alussa, jonka jälkeen tehdään päätökset mistä ehdotuksista valmistellaan Oulun yliopiston hakemus/hakemukset. Linkki lippulaivaohjelmaan ja aikaisemmin avoinna olleeseen lippulaivahakuun: https://www.aka.fi/fi/tiedepoliittinen-toiminta/lippulaivaohjelma/ https://www.aka.fi/globalassets/10rahoitus/hakuilmoitukset/lippulaivahaku_1… Mikäli olet valmis valmistelemaan hakemuksen edellä mainitulla aikataululla ja aiheesi on sopiva hakuihin, jätä seuraavat tiedot linkissä olevan webropolin<https://webropol.com/s/Flagship> (https://webropol.com/s/Flagship) kautta viimeistään 29.6.2020: * Vastuullinen hakija (PI) * Muut PIt * Lyhyt kuvaus aiheesta (max 1000 merkkiä) * Perustelu miksi ehdottamasi aihe olisi sopiva lippulaivahakuun (max 500 merkkiä) * Lyhyt kuvaus tutkimuksen tieteellisestä tasosta (max 500 merkkiä) * Lyhyt kuvaus tutkimuksen vaikuttavuudesta (max 500 merkkiä) * Tutkimusyhteistyöorganisaatiot (kansalliset ja kansainväliset) (max 500 merkkiä) * Yhteistyöyritykset (max 500 merkkiä) * Vastuullinen hakemuksen valmistelija heinä/elokuussa Lisätietoja: Teija Kekonen (teija.kekonen(a)oulu.fi<mailto:teija.kekonen@oulu.fi>) ja Taina Pihlajaniemi (taina.pihlajaniemi(a)oulu.fi<mailto:taina.pihlajaniemi@oulu.fi>) FIRI: Suomen hallitus on päättänyt vuoden 2020 neljännessä lisätalousarvioesityksessään suunnata tutkimusinfrastruktuurin vahvistamiseen 20 miljoonaa euroa. Oulun yliopiston saamien ennakkotietojen mukaan Suomen Akatemia tulee aukaisemaan nopealla aikataululla tutkimusinfrastruktuurihaun. Rahoituspäätökset tullaan tekemään vuoden 2020 aikana. Haun kriteerit tulevat olemaan saman tyyppiset kuin aikaisemmin avoinna olleissa vastaavissa haussa. Ennakkotietojen mukaan haut avautuvat 30.6 ja sulkeutuvat viimeistään 31.8. Tulemme pyytämään hakijoilta lisätietoa hakemuksista yliopiston sitoumuksia varten heinä/elokuussa. Linkit tutkimusinfrastruktuuriohjelmaan ja aikaisemmin avoinna olleeseen tutkimusinfrastruktuuri -hakuun: https://www.aka.fi/fi/tiedepoliittinen-toiminta/tutkimusinfrastruktuurit/ https://www.aka.fi/fi/rahoitus/hae-rahoitusta/haut/tutkimusinfrastruktuurih… IN ENGLISH: According to the Finnish Government's supplementary funding the Academy of Finland will open a call for new Flagship projects as well as Infrastructure funding (FIRI) with a very short notice. Please read the information and instructions below and note the very tight time table! Propose the next flagship theme for the University of Oulu The Finnish government has agreed to direct a funding of EUR 25 million for a new flagship call on its fourth supplementary budget proposal for 2020. According to preliminary information received by the University of Oulu, the Academy of Finland will open a flagship call on a short notice. Funding decisions will be made during 2020. The call criteria will be similar to previous corresponding calls. According to advance information, the call will open on 30th June 2020 and close no later than 31st August 2020. The rectors will select the proposal(s) for which applications will be prepared at the beginning of July 2020. Links to the flagship programme and the previously open flagship call: https://www.aka.fi/en/research-and-science-policy/flagship-programme/ https://www.aka.fi/globalassets/10rahoitus/hakuilmoitukset/lippulaivahaku_1… Leave your proposal and the following information through the linked Webropol query<https://webropol.com/s/Flagship> (https://webropol.com/s/Flagship) by 29th June 2020: * Responsible Principal Investigator (PI), Research Unit * Other Principal Investigators (PIs) * A short description of the proposed Flagship theme (max. 1000 characters). * A justification for the selection of the proposed theme in question (Why the proposed theme is suitable for the Flagship funding?) (max. 500 characters). * A short description of the scientific level of the proposed theme (max. 500 characters). * A short description of the research impact of the proposed theme (max. 500 characters). * A description of the cooperation with other universities and research organisations (max. 500 characters). * A description of the cooperation with companies (max. 500 characters). * A responsible leader who is committed him- or herself to prepare an application/proposal in July-August 2020. Additional information: Teija Kekonen (teija.kekonen(a)oulu.fi<mailto:teija.kekonen@oulu.fi>) and Taina Pihlajaniemi (taina.pihlajaniemi(a)oulu.fi<mailto:taina.pihlajaniemi@oulu.fi>) FIRI: The Finnish government has agreed to direct an additional budget authority of EUR 20 million for strengthening the research infrastructure on its fourth supplementary budget proposal for 2020. According to preliminary information received by the University of Oulu, the Academy of Finland will open a research infrastructure funding call on a short notice. Funding decisions will be made by the end of 2020. The call criteria will be similar to previous corresponding calls. According to advance information the call will open on June 30th and close no later than August 31st. Applicants will be asked to provide information on the applications for the University's Commitment (required in the application) in July/August. Further information on the research infrastructure program and the previous research infrastructure call: https://www.aka.fi/en/research-and-science-policy/research-infrastructures/ https://www.aka.fi/en/funding/apply-for-funding/apply-now2/firi-2019-call-f… Best regards, Emma ************************ Emma Pirilä, PhD Research Funding Specialist Faculty of Medicine Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine Biocenter Oulu Aapistie 5A, 2nd floor FIN- 90230 University of Oulu Finland Phone: +358503426428 e-mail: emma.pirila(a)oulu.fi<mailto:emma.pirila@oulu.fi> ************************

1 0

Introduction to Artificial Intelligence for Medical Imaging
by Aleksei Tiulpin 16 Jun '20

16 Jun '20

Hi, I am organizing a course on applications of AI to medical imaging this fall (starting September). The course structure is quite inclusive and contains also a 3 ECTS track for people who have no programming background. Please find a short course advertisement attached. Cheers, - Aleksei. --------------------------------- Dr. Aleksei Tiulpin, PhD Post-doctoral fellow Research Unit of Medical Imaging, Physics and Technology Faculty of Medicine University of Oulu Aapistie 5A, 90220 Oulu, Finland AI integration Engineer Department of Diagnostic Radiology Oulu University Hospital Kajaanintie 50, 90220 Oulu, Finland Tel.: +358 40 251-59-45 Email: aleksei.tiulpin(a)oulu.fi Web-site: https://lext.github.io/ The content of this message is confidential. If you are not a recipient indicated or intended in this message or you think this message may have been addressed to you in error, please inform us by an email reply and then delete the message. In such case it is forbidden to copy, forward, or in any way reveal the contents of this message to anyone.

1 0

FW: Wileyn ”ilmaiset” open access -artikkelit käytetty vuodelta 2020
by Katja Riipinen 12 Jun '20

12 Jun '20

Tiedoksi Wileyn ”ilmaiset” open access -artikkelit käytetty vuodelta 2020 (for English please see below) Wileyn FInELib-sopimukseen sisältyvät ”ilmaiset” open access -artikkelit on nyt vuoden 2020 osalta kulutettu loppuun. Sopimukseen sisältyy, että vuonna 2020 noin 53% yliopiston artikkeleista voidaan julkaista avoimena ilman kirjoittajamaksua. Vuosina 2021 ja 2022 osuus on noin 100%. Lisätietoja avoimesta julkaisemisesta Wileyn lehdissä<http://finelib.fi/oa-julkaiseminen-wileyn-lehdissa/> Lisätietoja Wileyn sopimuksen sisällöstä<http://finelib.fi/wiley-sopimus/> Avoimen julkaisemisen opas : http://libguides.oulu.fi/avoinjulkaiseminen/alennuksia Lisätietoja: openpublishing(a)oulu.fi<mailto:openpublishing@oulu.fi> Wiley’s ”free” open access article limit reached for 2020 The limit for ”free” open access articles included in FinELib’s Wiley agreement has been reached for the year 2020. According to the agreement in 2020 approximately 53% of articles can be published open access without any extra cost, while in 2021-2022 the agreement covers approximately 100%. Further information on open access publishing under this agreement<http://finelib.fi/open-access-publishing-in-wiley-journals/> Further information on the content of the agreement<http://finelib.fi/wiley-agreement/> Library guide on open access publishing: http://libguides.oulu.fi/openpublishing/discounts Further information: openpublishing(a)oulu.fi<mailto:openpublishing@oulu.fi> Oulun yliopiston kirjasto – Julkaisupalvelut / Oulu University Library – Publishing Services ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ Mari Katvala Informaatikko / Senior Information Specialist Oulun yliopiston kirjasto<http://www.oulu.fi/kirjasto/> / Oulu University Library<http://www.oulu.fi/library/node/40442> PL 7500 / PO. Box 7500 90014 Oulun yliopisto / FI-90014 Oulu University Finland puh./ tel. 48 3558, +358 29 4483 558

1 0

FW: Tiedekunnan tekniset palvelut kesällä / Faculty technical services during the summer
by Antti Haapalainen 11 Jun '20

11 Jun '20

From: Eero Kouvalainen <eero.kouvalainen(a)oulu.fi> Sent: 11. kesäkuutata 2020 12:30 To: LTK <ltk-staff(a)oulu.fi>; LTK-idm <LTK-idm(a)oulu.fi> Subject: Tiedekunnan tekniset palvelut kesällä / Faculty technical services during the summer Hei kaikki / Dear all Lääketieteellisen tiedekunnan tekniset palvelut ovat periaatteessa käytettävissä koko kesän, mutta tiimin miehitys varsinkin heinäkuussa on minimaalinen. Toiminta kesällä on välttämättömien rutiinien lisäksi lähinnä kiireellisten tapausten ensiapua (esimerkiksi kriittisen tutkimuslaitteen rikkouduttua). Palvelupyynnöt tiimille parhaiten sähköpostitse teknisetpalvelut.ltk(a)oulu.fi<mailto:teknisetpalvelut.ltk@oulu.fi> Kiinteistöjen kunnossapitoa koskevat palvelupyynnöt (sähkö, vesi, ilmanvaihto jne. ) ISS:lle, https://patio.oulu.fi/fi/palvelut-ja-ohjeet/tilat-ja-turvallisuus/kiinteist… Medical faculty technical services will, in principle, be available all summer, but especially in July the team staff is minimal. In addition to essential routines, the summer time service will be limited mainly to the first-aid of acute problems (like critical research equipment failures). Team service requests best via email to teknisetpalvelut.ltk(a)oulu.fi<mailto:teknisetpalvelut.ltk@oulu.fi> Service requests concerning facility maintenance (electricity, water, ventilation etc.) should be directed to ISS, https://patio.oulu.fi/en/services-and-instructions/facilities-and-safety/fa… Hyvää kesää! / Have a nice summer! Eero Kouvalainen, laboratoriopäällikkö palvelutiimin esimies eero.kouvalainen(a)oulu.fi<mailto:eero.kouvalainen@oulu.fi> 0294 48 5314 Harri Hakasalmi, teknikko harri.hakasalmi(a)oulu.fi<mailto:harri.hakasalmi@oulu.fi> 0294 48 5984 Eino Kemppainen, tutkimusteknikko eino.kemppainen(a)oulu.fi<mailto:eino.kemppainen@oulu.fi> 0294 48 5461 Esa Kerttula, tutkimusteknikko esa.kerttula(a)oulu.fi<mailto:esa.kerttula@oulu.fi> 0294 48 5233

1 0

FW: Imaging webinar / Bio-Rad / THU 18.6.2020 at 10.00 AM
by Virpi Glumoff 11 Jun '20

11 Jun '20

FYI -virpi From: Mikko Kajovaara <mikko_kajovaara(a)bio-rad.com> Sent: torstai 11. kesäkuuta 2020 11.57 To: Virpi Glumoff <virpi.glumoff(a)oulu.fi>; Antti Viklund <antti.viklund(a)oulu.fi>; Richard Lagnered <richard_lagnered(a)bio-rad.com> Subject: Imaging webinar / Bio-Rad / THU 18.6.2020 at 10.00 AM Hello, You are the most welcome to our webinar 18.6.2020 at 10.00. We will tell you how to use our Imaging System ChemiDoc MP, Stain-Free technology and how to do protein normalization without house keeping proteins. Pls use this link to join our seminar: https://bio-rad.zoom.us/j/99782620528 If you are interested in pls have a look short video about our V3 workflow: V 3 workflow<https://youtu.be/RWsDtTqDW_o> See you all next week, Mikko & Richard .................. Ystävällisin terveisin | Vänliga hälsningar | Best regards, Mikko Kajovaara | Account Manager Bio-Rad Finland Oy Kutomo Business Park Kutomotie 16 00380 Helsinki Mobile: +358 400 609 361 or 09 804 2200 mikko_kajovaara(a)bio-rad.com<mailto:mikko_kajovaara@bio-rad.com> www.bio-rad.com<http://www.bio-rad.com>

1 0

Contracts in the summer
by Emma Pirilä 11 Jun '20

11 Jun '20

Dear all, The summer holidays are coming up and most services will be closed or work with very reduced capacity. If you know that you will have very urgent contracts/agreements that will need legal review and signatures in July, please contact me as soon as possible. With best regards, Emma ************************ Emma Pirilä, PhD Research Funding Specialist Faculty of Medicine Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine Biocenter Oulu Aapistie 5A, 2nd floor FIN- 90230 University of Oulu Finland Phone: +358503426428 e-mail: emma.pirila(a)oulu.fi<mailto:emma.pirila@oulu.fi> ************************

1 0

Laminaarien huolto / Service on laminars
by Antti Haapalainen 11 Jun '20

11 Jun '20

Hei, CRC:n kaikki laminaarit on tarkistettu/huollettu. Huollot tehtiin tiistaina ja keskiviikko iltana. En voinut "varoitella" teitä ko huolloista koska näistä ei ilmoitettu minulle etukäteen. Laminaareja ei tarvitse puhdistella erityisemmin, pyyhkiminen viinalla riittää. Hi, All CRC laminars have been inspected/serviced. Maintenance was done on Tuesday and Wednesday nights. I could not inform you about these services because I was not notified of these in advance. However, laminars do not need any special cleaning now, wiping with ethanol is enough. Terv. Antti

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

Crc June 2020