Crc September 2020

crc@lists.oulu.fi

12 participants
49 discussions

FW: Research ethics afternoon (online) 14th of September
by Katja Riipinen 08 Sep '20

08 Sep '20

From: Minna Ruddock <minna.ruddock(a)oulu.fi> Sent: tiistai 8. syyskuuta 2020 8.45 To: ltk-all <ltk-all(a)oulu.fi>; 'ltk-students(a)lists.oulu.fi' <ltk-students(a)lists.oulu.fi>; LTK-idm <LTK-idm(a)oulu.fi> Subject: Research ethics afternoon (online) 14th of September Research ethics afternoon: research integrity in medicine and biomedicine Monday September 14th at 12-15:30, online meeting in Zoom UniOulu Ethics Working Group organizes research ethics afternoons every year in aim to discuss on current issues in broad field of research ethics. The focal point of the following event is research integrity in medicine and biomedicine. The event consists of several brief talks and discussion on good academic practices in relation to medical and biomedical research by providing information on available guidelines and practices. Personnel and students representing all campus partners (UniOulu, Oamk, LUKE, SYKE etc.) are welcome to this event which is arranged in English. Please register by 10th September 2020 at: https://link.webropolsurveys.com/Participation/Public/fbd66ab0-6c72-4801-86… Programme – version 14.8.2020 12:00-12:10 Words of Welcome Jouko Miettunen, UniOGS Vice-Dean 12:10-12:30 TENK general introduction Iina Kohonen, TENK Senior adviser 12:30-12:50 Research integrity as an international concern Riitta Keiski, Dean of Faculty of Technology, TENK Chair of the Board 12:50-13:10 Introduction to Ethcal, Legal andSocial Aspects of Genome editing. Introduction to the work of The Advisory Board on Biotechnology and The Board for Gene Technology. Marko Ahteensuu, University Lecturer in Research Ethics, University of Helsinki 13:10-13:30 Introduction to research ethics issues in plant sciences - gene manipulation / genome editing for cultivated and domesticated plants. Alan Schulman, Professor, LUKE/BI Plant Genomics Lab, Institute of Biotechnology, University of Helsinki. 13:30-14:00 comfort break 14:00-14:20 Ethical review in human sciences Tiina Keisanen, Chair of Ethics Committee of Human Sciences at the University of Oulu 14:20-14:40 14:20-14:40 Medical Research - obtaining a statement from the Ethics Committee of the Northern Ostrobothnia Hospital District (PPSHP), Minna Mäkiniemi, Research Support Manager 14:40-15:00 ‘Personal data processing risk assessment in the research of University of Oulu / Piloting in ITEE’ Anna Rohunen, Data advisor 15:00-15:20 Comments from students. Krista Juurikka, PhD researcher Welcome, UniOulu ethics working group More information: https://www.oulu.fi/university/node/42765 Contact persons: https://www.oulu.fi/yliopisto/node/38317

1 0

MRC Oulu - väitöstilaisuus 11.9.
by Katja Riipinen 08 Sep '20

08 Sep '20

Hei, TtM Abdul Wahed Kajabi väittelee 11.9. aiheesta "Nivelruston ja nivelkierukoiden kvantitatiivinen magneettikuvaus nivelrikon edetessä. Uusien magneettikuvausmenetelmien kokeellinen ja kliininen käytettävyys". Quantitative magnetic resonance imaging of articular cartilage and meniscus during osteoarthritis progression : experimental and clinical feasibility of novel MRI methods<https://www.oulu.fi/yliopisto/node/205152> Väittelijä: Terveystieteiden maisteri Abdul Wahed Kajabi Aika: 11.9.2020, klo 16.00 Paikka: Luentosali F202, Lääketieteellinen tiedekunta (Aapistie 5B) Etäyhteys: https://oulu.zoom.us/j/67339779656 Vastaväittäjä: Apulaisprofessori Matthew F. Koff, Hospital for Special Surgery (HSS), New York, USA Kustos: Professori Miika T. Nieminen, Oulun yliopisto Väitöskirja: http://jultika.oulu.fi/Record/isbn978-952-62-2697-2 Ilmoitusta saa jakaa. Yst. terveisin, Katja ---------------------------------------------------------------- Katja Riipinen, FT, TtK Koordinaattori Medical Research Center Oulu<https://www.oulu.fi/mrc/> | MRC Oulu Oulun yliopistollinen sairaala, Oulun yliopisto Puh. 0294 48 5909, Mobiili +358 50 472 9414 PL 5000, 90014 OULUN YLIOPISTO [cid:image001.png@01D685B5.01D1CDB0]

1 0

Nobel Prize Campus Event on Monday Oct 5
by Katja Riipinen 07 Sep '20

07 Sep '20

Kontinkangas Campus Event Oct 5, 2020 Join the exciting moment of the announcement of the Nobel Prize in Physiology or Medicine 2020 together with your colleagues on October 5th online in Zoom! We start with a lecture given by Prof. Johanna Myllyharju presenting the finding rewarded last year´s Nobel Prize in Physiology or Medicine. Thereafter we connect to Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden, to follow as a live webcast the official announcement of the Nobel Prize in Physiology or Medicine 2020, and a presentation of the topic by Members of the Nobel Committee. Can you guess who wins the Nobel Prize? You can participate in The Nobel Laureate Guessing Game here: Guessing Game<https://link.webropolsurveys.com/Participation/Public/d94f534e-e1b3-455a-93…> The winner(s) of the Game will be published after the webcast and will receive a nice small award. Where: Zoom<https://oulu.zoom.us/j/63188552578#success> When: Oct 5, 11:45 - 13 To whom: University and Hospital personnel, researchers and students Programme 11.45 Opening (Prof. Peppi Karppinen, Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine) Introduction to the Nobel Prize 2019 (Prof. Johanna Myllyharju, Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine) ~12.30- Nobel Prize in Physiology or Medicine 2020, live webcast of the Prize announcement in Karolinska Institutet ~12:50 Announcement of the winner(s) of the Nobel Laureate Guessing Game and closing Welcome everybody! Great science and get-together-event for us all online this time! Organizers: Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine Faculty of Medicine Health and Biosciences Doctoral Programme Biocenter Oulu Medical Research Center Oulu https://www.oulu.fi/sites/default/files/content/Nobel%20Ad%202020.pdf Yst. terveisin, Katja ---------------------------------------------------------------- Katja Riipinen, FT, TtK Koordinaattori Medical Research Center Oulu<https://www.oulu.fi/mrc/> | MRC Oulu Oulun yliopistollinen sairaala, Oulun yliopisto puh. 0294 48 5909, Mobiili +358 50 472 9414 PL 5000, 90014 OULUN YLIOPISTO (Aapistie 5A, huone 347B) [cid:image001.png@01D68528.A7ED9680]

1 0

AH:n vuositarjous
by Antti Haapalainen 07 Sep '20

07 Sep '20

Hei, Liitteenä AH Diagnostics:in vuositarjous ajalle 25.8.2020-24.8.2021. Terv. Antti

1 0

HUSin eettisten toimikuntien seminaari 29.10.
by Katja Riipinen 04 Sep '20

04 Sep '20

Hei, Tiedoksi HUSin eettisten toimikuntien seminaari: HUSin eettiset toimikunnat järjestävät kaksi kertaa vuodessa seminaarin, joka tarjoaa ajankohtaista tietoa tutkimuksen eettisestä ennakkoarvioinnista tutkimusta tekeville sekä tutkimustoiminnasta kiinnostuneille ihmisille. Aika: to 29.10.2020 klo 14.30 - 16.30. Suora linkki seminaariin: https://vimeo.com/453239428 Ohjelma (liitteenä) 14.30 Tilaisuuden avaus HUSin tutkimusjohdon tutkimusylilääkäri, dos. Karin Blomgren 14.35 -14.55 HUSin tutkimusraatitoiminta HUSin hoitotyön johdon kehittämispäällikkö, FT, Heli Bäckmand 14.55 -15.25 Suostumus lääketieteellisessä tutkimuksessa uudistuvassa lainsäädännön ympäristössä Sareco Oy, OTT, dos. Marjut Salokannel 15.25 -15.55 Sähköinen suostumus THL Biopankki, Biopankin johtaja, varatuomari Sirpa Soini 15.55 -16.15 Lastenlääkeasetus ja Euroopan Lastenlääkekomitean toiminta Fimean erikoistutkija, Lastenlääkekomitean jäsen, FaT, Ann-Marie Tötterman ja Fimean jaostopäällikkö kliiniset lääketutkimukset, LT, dos. Pirjo Inki 16.15 -16.30 Kansallinen lastenlääkkeiden tutkimusverkosto -FINPEDMED FINPEDMEDin toiminnanjohtaja Pirkko Lepola Seminaarin tallenne on katsottavissa 2.11.2020 lähtien osoitteessa: https://vimeopro.com/user39826906/husin-eettisten-toimikuntien-seminaari-to… Terveisin, Katja ---------------------------------------------------------------- Katja Riipinen, FT, TtK Koordinaattori Medical Research Center Oulu<https://www.oulu.fi/mrc/> | MRC Oulu Oulun yliopistollinen sairaala, Oulun yliopisto puh. 0294 48 5909, Mobiili +358 50 472 9414 PL 5000, 90014 OULUN YLIOPISTO (Aapistie 5A, huone 347B) [cid:image001.png@01D682BD.63B4EE40]

1 0

Academy of Finland info 8.9
by Emma Pirilä 04 Sep '20

04 Sep '20

Dear researchers, Please remember to sign up for this info event. Also, please send in your application drafts to me as soon as possible. The Kontinkangas Academy of Finland autumn info will be on 8th of September at 14-16. The info is open and suitable for everyone. The info is fully remote and will be held via Teams or Zoom, a link will be provided closer to the event. Program: 14.00 - 14.25 The Academy of Finland autumn call - Emma Pirilä 14.25 - 14.45 Data management - Jaana Liimatainen 14.45 - 15.10 Academy of Finland budget - Emilia Kokko 15.10 - 15.30 Sustainable development in research proposals - Kirsi Ojutkangas 15.30 -16.00 A successful academy project application - Juhani Junttila If you want to participate, please sign up via the link below. You may also submit questions that you have in advance. https://link.webropolsurveys.com/S/ACA61E9DAAA84888 Best regards, Emma ************************ Emma Pirilä, PhD Research Funding Specialist Faculty of Medicine Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine Biocenter Oulu Aapistie 5A, 2nd floor FIN- 90230 University of Oulu Finland Phone: +358503426428 e-mail: emma.pirila(a)oulu.fi<mailto:emma.pirila@oulu.fi> ************************

1 0

FW: Tietohallinnon tutkimuksen palveluista / Information about Science-IT Services
by Katja Riipinen 03 Sep '20

03 Sep '20

From: Jaana Liimatainen <jaana.liimatainen(a)oulu.fi> Sent: torstai 3. syyskuuta 2020 14.56 To: LTK <ltk-staff(a)oulu.fi>; LTK-idm <LTK-idm(a)oulu.fi> Subject: Tietohallinnon tutkimuksen palveluista / Information about Science-IT Services In english, see below. Hei Tänä syksynä tapahtuu tutkimuksen IT-rintamalla aika lailla. Tietohallinto on saanut käyttöön uusia resursseja, jotka auttavat tutkijoita huomattavasti. Niinikään tieteellisen laskennan palvelu (CSC) on saanut käyttöön uusia supertietokoneita, joten laskentakapasiteetti on kasvanut huomattavasti. Nyt olemme kiinnostuneita toiveistanne koskien tutkimuksen IT-aiheita. Paikallisista ja CSC:n palveluista on mahdollista järjestää zoom-koulutusten sarja, jossa käsitellään eniten toivottuja aiheita. Pyrimme toteuttamaan koulutukset demo-henkisesti, eli pyrimme näyttämään yksityiskohtaisesti kuinka joku tehtävä voidaan suorittaa. CSC on luvannut esitellä omia ympäristöjään etäkokouksissa. Alla olevassa listassa on esimerkkejä tulevista muutoksista. 1. Oulussa otetaan käyttöön yksi CSC:n entisen Taito-supertietokoneen noodi. Sille on tarjolla useita rooleja. Tästä koneesta on erityisesti apua eräajotyyppisissä, rinnakkaistuvissa tehtävissä. 2. Kataja-laskentaklusteri laajenee. Tämä edellistä pienempi laskentapalvelimien sarja käy hyvin keskikokoisten tehtävien laskuun, ja monissa palvelimissa on GPU-kortit mukana, mikä kyllä tehostaa laskentaa paljon, jos ohjelmisto vain osaa niitä käyttää. 3. Tutkimuksen Windows-palvelimet. Tutkijoille on otettu käyttöön jalava1-palvelin windows-tehtävin laskuun. Ohjelmistoja lisätään tarpeen mukaan. Opiskelijoille on oma Salava1-palvelin. 4. Windowsin ja linuxin eriävät kotihakemistot. Uuden levyjärjestelmän teknisten seikkojen myötä tietohallinto on päätynyt ratkaisuun, jossa linux-käyttäjille tulee omat kotihakemistot sekä windows- että linux-käyttöön. Windows-käyttäjille tämä muutos ei näy. 5. RedCap-palvelu. Oulun yliopistolla on käytössä RedCap-palvelin sensitiivisen tiedon keräämiseen. 6. Konttipalvelut. Palveluja voidaan kääriä ns. kontteihin (containers), jolloin niiden hallinta ja ylläpito on helpompaa. 7. Datan hallinta ja arkistointi. Tutkimusdataa kertyy nykyään enemmän kuin koskaan. On tärkeää, että data kerätään, käsitellään, julkaistaan ja arkistoidaan kestävällä tavalla. 8. Pilvipalvelut. Yhä suurempi osa tiedoista on mahdollista tallettaa ja saavuttaa pilvipalveluista. Lisäksi CSC:n palveluista voisi mainita vaikkapa 9. CSC:n virtuaalipalvelinten automaattinen käyttöönotto ja klusterointi (cPouta ja ePouta). Tietohalinto haluaa edistää CSC:n palvelujen käyttöä, ja sen vuoksi autamme tutkijoita näiden palvelujen käyttöönotossa ja skaalaamisessa. 10. CSC:n uudet superkoneet ja niiden käyttöönotto 11. Allas-objektivarasto ja sen käyttö. CSC:n palveluista lisätietoa löytyy mm https://eur01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Fdocs.csc.… Pyydämme palautettanne osoitteessa: https://link.webropolsurveys.com/S/328FB915C33BECF1 Tai sitten suoraan: Ari-Pekka.Kvist(a)oulu.fi<mailto:Ari-Pekka.Kvist@oulu.fi> *** There are a lot of new activities on IT-services that concern research and teaching. IT-administration has got new resources that help research a lot. Furthermore the Center of scientific computing (CSC) has installed new supercomputers that increase the available computing capacity considerably. Today we are interested about your wishes and comments concerning the research-IT. It is possible to arrange a set of Zoom-meetings concerning both local and CSC's services based on your wishes. We try to make those sessions by using a demo-based approach, explaining one or few wishes at a time. CSC has agreed to demonstrate their services online as well. Below there are few examples of the forthcoming changes. The list is not complete and you can suggest your own ideas as well. 1. We got one of the nodes from the former CSC's supercomputer that will start this autumn here in Oulu. There are several roles on this computing cluster but the main usage will be batch-jobs, especially if the code could be parallelized. 2. Kataja-server cluster is expanding. This set of calculation servers is smaller than the previous one but it is suitable for medium-range tasks and many of those servers also has GPU-cards installed. 3. There are two new Windows-based calculation servers, Jalava1 for staff and Salava1 for students. 4. Central disk repository is moving and due to technical reasons there will be a separate home directory for Linux-users. There will be no visible changes for Windows-users. 5. RedCap-service. Univ. Oulu has started a RedCap-service that is suitable for collecting sensitive information. 6. Container-services. IT-services tests a possibility to wrap services into so called containers to ease up administration. 7. Data management and administration. Research data is accumulating faster than ever. Therefore it is important to manage data collection, processing, publication and archiving. 8. Cloud services. Cloud-based services are becoming more and more common in our everyday life. Furthermore CSC has several new developments. For example: 9. Automatic management of CSC's virtual servers ePouta and cPouta. IT-administration wants to facilitate more efficient usage of CSC's services. Therefore IT-services helps researchers to start and scale those services. 10. CSC's new supercomputers 11. Allas-object storage. More info about CSC services can be found at https://eur01.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Fdocs.csc.… Please, give us your feedback at: https://link.webropolsurveys.com/S/328FB915C33BECF1 Or directly: Ari-Pekka.Kvist(a)oulu.fi<mailto:Ari-Pekka.Kvist@oulu.fi> Ari-Pekka Kvist, PhD/Med. biochem., MSc/Genetics, MSc/Information security Research Information Systems Specialist ICT Services, Support for Science mail: PO BOX 8000, FI-90014 Univ. Oulu, Finland visit: Pentti Kaiteran katu 1, Linnanmaa t. + 358-(0)294-48 1165 e. Ari-Pekka.Kvist(a)oulu.fi<mailto:Ari-Pekka.Kvist@oulu.fi> o. ST345 Click for details : https://helpdesk.oulu.fi/WorkOrder.do?woMode=viewWO&woID=1136348&PORTALID=1

1 0

European Research and Innovation days registration
by Emma Pirilä 03 Sep '20

03 Sep '20

Dear researchers, The registration for the fully virtual European Research and Innovation Days in now open. European Research and Innovation Days is the European Commission's annual flagship Research and Innovation event, bringing together policymakers, researchers, entrepreneurs and the public to debate and shape the future of research and innovation in Europe and beyond. This year it is a fully virtual event on September 22.-24. The programme includes next funding programme Horizon Europe incl. its missions, Digital Europe, Green Deal, European Research Area, discussions surrounding Synergies, the EIC, the EIT and ERC. Check out the programme, speakers and register here<https://research-innovation-days.ec.europa.eu/>! Best regards, Emma ************************ Emma Pirilä, PhD Research Funding Specialist Faculty of Medicine Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine Biocenter Oulu Aapistie 5A, 2nd floor FIN- 90230 University of Oulu Finland Phone: +358503426428 e-mail: emma.pirila(a)oulu.fi<mailto:emma.pirila@oulu.fi> ************************

1 0

Oulun yliopiston Tutkimus-, kehittämis- ja innovaatiotoiminnan (TKI) ohjeet poikkeusoloissa / The University of Oulu Guidelines on Research, Development and Innovation (RDI) during the State of Emergency
by Antti Haapalainen 02 Sep '20

02 Sep '20

Hei, Tärkeää informaatiota yliopistolla työskentelyn suhteen: https://patio.oulu.fi/fi/uutiset/oulun-yliopiston-tutkimus-kehittamis-ja-in… Hi, Important information concerning the work done at the University: https://patio.oulu.fi/en/news/university-oulu-guidelines-research-developme… Terv. Antti Haapalainen

1 10

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

Crc September 2020