Crc June 2021

crc@lists.oulu.fi

14 participants
39 discussions

Kemiallinen ja biologinen riskiarviointi 2020 / Chemical and biological risk assessment 2020
by Antti Haapalainen 27 Jan '26

27 Jan '26

Hei, Vuoden 2020 riskiarvioinnit pitäisi tehdä (kemiallinen ja biologinen). ASA-aineille altistumiset pyydän myöhemmin. Tehkää riskiarvioinnit kuten aiemmin ja tallentakaa riskiarvioinnit kansioon: ltk-yhteiset\KLIIN\CRC\Riskiarviointi Risk assessment Ko riskiarvioinnit pitäisi tehdä viimeistään 15.2.2021. Lisäinfoa riskienarvioinneista löytyy: https://patio.oulu.fi/fi/palvelut-ja-ohjeet/henkilosto/tyosuojelu/tyosuojel… Hi, It is time to do risk assessments (chemical and biological) for 2020. Exposures to ASA chemicals I will ask later. Do these risk assessments as previously and save your risk assessments in a folder: ltk-yhteiset\KLIIN\CRC\Riskiarviointi Risk assessment The risk assessments should be done no later than 15.2.2021. More information of risk assessments can be found: https://patio.oulu.fi/en/services-and-instructions/personnel/occupational-s… Terv. Antti Haapalainen

1 8

Bio-Rad CFX Connect qPCR
by Antti Haapalainen 21 Aug '25

21 Aug '25

Hei, Bio-Rad CFX Connect qPCR laitteelle tehdään vuosihuolto tiistaina 28.5. Huoltoon menee maksimissaan yksi päivä. Hi, Bio-Rad CFX Connect qPCR will have annual maintenance service on Tuesday 28.5. This will take one day. Terv. Antti

1 14

Päivitetty rahoitusmahdollisuuslista - Updated funding opportunities list
by Jaana Liimatainen 18 Sep '23

18 Sep '23

Hyvät tutkijat - Dear researchers, olen päivittänyt rahoitusmahdollisuuslistan, ja se löytyy Google Drivestä (Klick<https://drive.google.com/file/d/1CLABEx7_yjuJg-6MiKF3xGefAjUeztwZ/view?usp=…>). Huom! Lista päivittyy silloin tällöin myös sähköposti-ilmoitusten välillä. I have updated the link for Funding opportunities list today and it can be found in Google Drive (Klick<https://drive.google.com/file/d/1CLABEx7_yjuJg-6MiKF3xGefAjUeztwZ/view?usp=…>). Note! I update the list occasionally also between e-mail notifications. Terveisin - Cheers, Jaana Jaana O. Liimatainen, PhD Coordinator Faculty of Medicine Aapistie 5A FIN-90230 University of Oulu tel. +358 294 487 459 mobile +358 50 590 4561 Jaana.Liimatainen[at]oulu.fi

1 11

CRC palaveri ja seminaari kevät 2021 / CRC meeting and seminar spring 2021
by Antti Haapalainen 10 Jan '23

10 Jan '23

Hei, Liitteenä CRC palaveri- ja seminaaripäivät keväälle 2021. Hi, Attached are the CRC meeting and seminar dates for the spring term 2021. Terv. Antti

1 1

Thelma Mäkikyrön säätiön apurahahaku on auki [In Finnish Only]
by Jaana Liimatainen 02 Nov '21

02 Nov '21

Hyvä syöpätutkija Thelma Mäkikyrön säätiön apurahahaku syöpätutkimukseen pohjoissuomalaisille tutkijoille on auki. Thelma Mäkikyrön säätiö julistaa haettavaksi 2-3 10.000 euron suuruista apurahaa sekä 1-2 2.000 euron suuruista matka-apurahaa. Apurahat on tarkoitettu edistämään syöpätautien tutkimusta. Apurahaa voivat hakea pohjoissuomalaiset tutkijat tai tutkimusryhmät. Säätiö tukee erityisesti post doc -vaiheen tutkimusta. Vapaamuotoiset hakemukset (3 kappaleena) toimitetaan säätiön toimitusjohtajalle osoitteeseen: varatuomari Jorma Heino, Hankasentie 1 C 3, 90560 Oulu, viimeistään ma 9.11.2020. Myönnetyistä apurahoista ilmoitetaan saajille henkilökohtaisesti kuluvan vuoden loppuun mennessä. Lisätietoja antavat säätiön toimitusjohtaja varatuomari Jorma Heino puh. +358 400 581 553, s-posti: jorma.heino(a)hotmail.com<mailto:jorma.heino@hotmail.com> ja säätiön hallituksen puheenjohtaja emeritusprofessori Martti Sorri puh. +358 405 489 744, s-posti: martti.sorri(a)oulu.fi<mailto:martti.sorri@oulu.fi> Thelma Mäkikyrön säätiön sr hallitus Terveisin Jaana Jaana O. Liimatainen Koordinaattori, FT Oulun yliopisto Lääketieteellinen tiedekunta PL 5000 90014 Oulun yliopisto puh. 0294 487 459 mobiili 050 590 4561 Jaana.Liimatainen[at]oulu.fi

1 2

Horizon Europe Health calls Info and Brokerage days
by Emma Pirilä 14 Oct '21

14 Oct '21

Dear researchers, to those of you who are interested in the Horizon Europe Health-cluster calls. In the beginning of July, the commission has an info day on the Health cluster and after that a brokerage (partnering) event for those looking for partners. Both events are online. The Health cluster info day on July 2nd is open to everyone and requires no registration: https://www.horizon-europe-infodays2021.eu/event/cluster-1-health The brokerage (partnering) event on July 5 requires registration: https://healthbe2021.b2match.io/ How the brokerage days work: - Register for the event and create a profile. The organizer needs to activate your profile, this will take some time. - If you are looking for partners, you can make a project description (highly recommended!) which can be on a general level. - In the agenda-section you can find the general sessions open to everyone - In the Marketplace-section, you can find everyone who are looking for partners and who are interested in discussing collaboration. If you find interesting profiles you can ask for a one-to-one online session and those will be timed for the afternoon on July 5. If a participant is already fully booked, just send them a message and ask for an online meeting outside of the brokerage event. Just send me a message if you have any questions or problems. Best regards, Emma ************************ Emma Pirilä, PhD Research Funding Specialist Faculty of Medicine Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine Biocenter Oulu Aapistie 5A, 2nd floor FIN- 90230 University of Oulu Finland Phone: +358503426428 e-mail: emma.pirila(a)oulu.fi<mailto:emma.pirila@oulu.fi> ************************

1 1

FW: SHVM 2021 hybrid meeting
by Reetta Hinttala 30 Jun '21

30 Jun '21

The 1st virtual meeting of the Society for Heart and Vascular Metabolism (SHVM) will be held on 23-24 September 2021. https://shvm2021.azuleon.org<https://shvm2021.azuleon.org/> We are asking for abstracts and posters and, this is new, a 1-min pitch. On day 2, the 6 top-rated pitches will be picked for a 10-min presentation with a good chance to win one of the young investigator awards. Fyi, not the student/postdoc should win that can handle terabytes of data. We seek students/postdocs with creativity and/or cool performance, e.g., using Prezi, plasticine, scraps of paper, lego bricks, .... Looking forward to meeting you hopefully in September. Best wishes from a Corona-free Jena, - Marten ——————————— Department of Cardiothoracic Surgery Center for Sepsis Control and Care (CSCC) Jena University Hospital Friedrich-Schiller University of Jena Marten Szibor, MD Adjunct professor in molecular medicine Tampere University Fachphysiologe Deutsche Physiologische Gesellschaft Street address: Am Klinikum 1 DE-07747 Jena GERMANY Work - +49 (0) 3641 9 322982 Mobile - +49 (0) 176 40431136 E-mail - Marten.Szibor(a)med.uni-jena.de<mailto:Marten.Szibor@med.uni-jena.de> Skype - mszibor -- Universitätsklinikum Jena - Bachstrasse 18 - D-07743 Jena Die gesetzlichen Pflichtangaben finden Sie unter https://www.uniklinikum-jena.de/UKJ_Pflichtangaben.html

1 0

FW: Kysely Oulun yliopiston apurahatutkijoille / Survey for UniOulu grant researchers
by Antti Haapalainen 24 Jun '21

24 Jun '21

From: Seija Jalagin <Seija.Jalagin(a)oulu.fi> Sent: keskiviikko 23. kesäkuuta 2021 14.05 To: LTK <ltk-staff(a)oulu.fi>; LTK-idm <LTK-idm(a)oulu.fi>; ltk-all <ltk-all(a)oulu.fi>; bco(a)lists.oulu.fi; yo-opettajat-bounces(a)lists.oulu.fi; tutkijat(a)lists.oulu.fi; TTK <TTK(a)oulu.fi>; hutk.henkilokunta(a)lists.oulu.fi; ktk-tutkimus(a)lists.oulu.fi; ktk-ktk(a)lists.oulu.fi; ktk-jatko(a)lists.oulu.fi; itee(a)lists.oulu.fi; mantsa(a)lists.oulu.fi; ktk-kasope(a)lists.oulu.fi; Taloustiede(a)oulu.fi; hutk.tohtoriopiskelijat(a)lists.oulu.fi Cc: Tanja Riekkinen <Tanja.Riekkinen(a)oulu.fi>; Pauli Väisänen <Pauli.Vaisanen(a)oulu.fi> Subject: Kysely Oulun yliopiston apurahatutkijoille / Survey for UniOulu grant researchers Kysely apurahatutkijoille Oulun yliopistossa kehitetään parhaillaan apurahatutkijoiden asemaa. Mikäli olet toiminut apurahatutkijana kuluneiden neljän (4) vuoden aikana, vastaisitko ystävällisesti tähän kyselyyn 8.8. mennessä. Kyselyyn vastaaminen vie noin 5 minuuttia. Apurahatutkijoiden kokemuksia ja näkemyksiä hyödynnetään yliopiston työryhmässä, joka laatii esitystä apurahatutkijoiden aseman parantamiseksi. Tietoja käytetään anonyymisti ja kyselyn tulokset tuhotaan, kun tekijät ovat käsitelleet ne. Kysely on saatavilla osoitteessa https://link.webropolsurveys.com/S/6D45A10809E99129 Kyselyn ovat laatineet työryhmän jäsenet Seija Jalagin, Tanja Riekkinen & Pauli Väisänen. Survey for grant researchers The University of Oulu is currently working to improve the position of the grant researchers. In case you have worked as a grant researcher over the past four (4) years, would you please reply to this survey by August 8. It takes approximately 5 minutes to answer the survey. The experiences and views of grant researchers are used in the University of Oulu working group, which formulates a proposal for improving the position of grant researchers. Replying to the survey is anonymous. The survey results will be destroyed after the data analysis is complete. The survey is available at https://link.webropolsurveys.com/S/6D45A10809E99129 The survey was drafted by the members of the working group Seija Jalagin, Tanja Riekkinen & Pauli Väisänen. Kiitokset etukäteen ja hyvää kesää! / We appreciate your contribution and wish you a very good summer! Seija Jalagin Yliopistonlehtori, FT, dosentti Historia & Japani-opinnot Historiatieteet, PL 1000, 90014 Oulun yliopisto Puh. 040 778 9021 PhD, University Lecturer Department of History, P.O. Box 1000, FIN-90014 University of Oulu, Finland http://www.oulu.fi/university/researcher/seija-jalagin Research Project: REBEL / Recognition and belonging: forced migrations, troubled histories and memory cultures (2017-2021) / https://recognitionandbelonging.com/ Latest publications: Nimble Nationalism: Transgenerational Experiences of East Karelian Refugees in Finland and Sweden. In Ville Kivimäki, Sami Suodenjoki & Tanja Vahtikari (eds.) Lived Nation as the History of Experiences and Emotions in Finland, 1800-2000, pp. 267-293. Palgrave Macmillan, 2021. Open access in: https://www.palgrave.com/gp/book/9783030698812 Pelon ja toivon rajalla. Itäkarjalaisten pakolaisuus Suomesta Ruotsiin toisen maailmansodan jälkeen. Historiallinen Aikakauskirja 119(1), 2021: 22-35. With English absract: Border of Fear and Hope. The Forced Migration of East Karelians from Finland to Sweden in 1944-1949. Confined by Conflict, Run by Relief: Arabs, Jews, and the Finnish Mission in Jerusalem, 1940-1950. In Inger Marie Okkenhaug & Karène Sanchez Summerer (eds.) Christian Missions and Humanitarianism in the Middle East, 1850-1950. Leiden: Brill, 2020 (pp. 233-252). Open-access in: https://brill.com/view/title/54485

1 0

Open PhD student position in the Pihlajaniemi group, University of Oulu
by Anne Heikkinen 23 Jun '21

23 Jun '21

Open PhD student position at the Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine, University of Oulu<https://www.oulu.fi/english/> Description Applications are invited for a full-time Doctoral student (max. 4 years) position, starting at the earliest on 1.10.2021 in a research project<https://www.oulu.fi/university/researcher/taina-pihlajaniemi> headed by Professor Taina Pihlajaniemi in the Extracellular matrix & Hypoxia Research Unit, operating at the Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine<https://www.oulu.fi/en/university/faculties-and-units/faculty-biochemistry-…>. Molecular and environmental basis for lifelong health is one of the strategic focus areas of the University. The doctoral student is enrolled in the Health and Bioscience Doctoral Programme of the University of Oulu Graduate school<https://www.oulu.fi/uniogs/dp/hbsdp>, which provides support in theoretical and practical training. We are now looking for a motivated Doctoral student in a project addressing the roles and molecular interactions of collagen XIII (ColXIII) in the neuromuscular junction (NMJ). Using murine models we have shown that ColXIII is an essential NMJ component and others have recently shown that mutations in the human gene cause congenital myasthenic syndrome type 19 (CMS19). Using mouse and cell culture models we will identify the network of molecules and the events whereby ColXIII operates in the normal NMJ and the developmental events that lead to CMS19. We will also determine the occurrence of anti-ColXIII autoimmune antibodies in patients with acquired generalized and ocular myasthenia gravis and assess their effects on the NMJ. The studies provide unique opportunities to enhance the understanding of critical motor synapse molecules and facilitate personalized therapies in genetic and acquired myasthenia. The position is fixed-term for 4 years in an Academy of Finland-funded project and it targets to completion of a Doctoral thesis and multiple publications in high-ranked international journals. Besides research, the position includes some teaching duties in an international Master's Programme<https://www.oulu.fi/university/masters/biochemistry> in Biochemistry. Qualification requirements The successful candidate for the Doctoral student position must possess a M.Sc. degree in the field of biochemistry, molecular or cell biology, medical science or related fields. We also invite applications from pre-graduate students from these fields of university studies. In this case, to be eligible for application, the candidate must demonstrate that he/she will graduate at home University not later than 31.12.2021 and also provide 1) an official statement from the home University attesting that all the courses, exams and other qualifications needed for graduation have already been obtained, 2) an official statement from the home University attesting that thesis has been submitted for evaluation and, 3) a letter of support from the candidate's Supervisor (the minimum acceptable level for supervision is docent / assistant professor). Prior experience in molecular biology and cell culture-based experiments is required, and proficiency in microscopy is expected. Prior experience in generating or working with experimental mouse models, and knowledge of the research field in question is considered an advantage. Good communication and teamwork skills are appreciated. Fluency in both written and spoken English is required. Most importantly, we expect the candidate to have a high motivation to conduct high-level biomedical research. What we offer We offer a research environment with excellent technological facilities and a motivating and supporting international community at the Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine, University of Oulu. We can also offer access to state-of-the-art facilities and special expertise through visits to collaborative laboratories outside Oulu when needed. You will have a place in a highly talented research group, working to solve globally significant research problems. University´s wide variety of support services are at disposal, allowing to focus on studies and research work. The position is fixed-term for 4 years as of 1.10.2021 or as soon as possible thereafter. A trial period of 6 months is applied in the position. Link for full recruitment call text and the electronic application form https://rekry.saima.fi/certiahome/open_job_view.html?did=5600&lang=fi&id=00… Further information For further information, please contact Prof. Taina Pihlajaniemi, e-mail: taina.pihlajaniemi (at) oulu.fi or Dr. Anne Heikkinen; e-mail: anne.heikkinen (at) oulu.fi

1 0

Soluviljelykokous/Cell culture meeting Kesä 2021
by Reetta Hinttala 22 Jun '21

22 Jun '21

Hei, tässä yhteenveto tämän päivän soluviljelykokouksesta. In English below. Aurinkoista kesää kaikille toivottaen, Reetta 1. Mykoplasmatesti Anja teki mykoplasmatestin 25. ja 26.5. Kaikki testatut näytteet olivat negatiivisia. 2. Nestetyppitankkien inventaario CRC:llä on kolme yhteistä nestetyppitankkia soluampullien säilyttämistä varten (tankki no. I, II, IV). Tämän lisäksi naistentaudeilla (V), sisätaudeilla (III, pieni), neurologialla (R2D2) ja ihotaudeilla (pieni) on omat nestetyppitankit. Kokonaisuudessaan säilytystila niin CRC:n tankeissa kuin myös säilytyshuoneessa on tällä hetkellä käytössä. Uusia soluviljelyprojekteja on käynnistymässä tai parhaillaan hyvin aktiivisessa vaiheessa, joten säilytystilaa tarvitaan lisää. Tutkimusryhmät käyvät lävitse omat näytteensä ja päivittävät näytetiedot sekä nestetyppitankkihuoneessa oleviin kansioihin että ”ltk-yhteiset\KLIIN\CRC\Nestetyppitankit Liquid nitrogen tanks” kansioon. Tämä inventaario tehdään kesän 2021 loppuun mennessä, jolloin tiedetään, että kuinka paljon vapaita paikkoja nestetyppitankeissa on. Väliaikaisia paikkoja yksittäisten tutkimusryhmien omista tankeista on käytössä kesän yli niin, että akuutissa tarpeessa olevat pärjäävät kesän yli. Elokuun kokouksessa palataan asiaan. Kokousta varten Reetta ja Antti miettivät ratkaisuvaihtoehtoja yhdessä pohdittavaksi. 3. Kesän ajan järjestelyt 1. Antti tekee ensi maanantaina, 28.6., tilauksia kesän ajalle. Ilmoittele hänelle pian jos huomaat puutoksia soluviljelyn yhteisissä kulutustarvikkeissa kuten esim. vesi, hanskat, sellu. 2. Huomioikaa, että pesuviinaa on riittävästi koko kesäksi. Antti on lomalla 1.7.-9.8. välisen ajan. 3. 341/342B soluviljelyissä on työntekijöitä koko kesän. On tärkeää, että he tarkkailevat yleistä siisteyttä ja huolehtivat inkubaattorien vesihauteista. Jokainen tutkimusryhmä huolehtii, että töihin jäävät tietävät vastuunsa ja miten toimia käytännössä (Salla/Pia, Nina/Pipsa). Kirurgian soluviljely hiljenee kesäksi viikoille 29/30 jonka aikana Lena huolehtii inkubaattorin vedestä (Riikka, Lena ja Miia). 4. Nestetyppitankkivuoro on lastentaudeilla. Mervi ja Anniina huolehtivat vastuusta Maaritin ollessa lomalla. 5. Saija ja Pirjo keräävät labratakit pesuun ti 29.6. Jos et halua tuolloin labratakkia pesuun merkitse se ja siirrä sivuun (tai mainitse asiasta S&P:lle). 4. Seuraava kokous ti 24.8. klo 10 mahdollisesti paikanpäällä Agenda 22.6.2021 (in English) 1. Mycoplasmatest Anja made the mycoplasma test on May 25th and 26th. All samples tested were negative. 2. Inventory of liquid nitrogen tanks The CRC has three common liquid nitrogen tanks for storing cell ampoules (tank no. I, II, IV). In addition to this, gynecology (V), internal medicine (III, small), neurology (R2D2) and dermatology (small) have their own liquid nitrogen tanks. In total, the storage space in both the CRC tanks and the storage room is currently in use. New cell culture projects are being started or are currently in a very active phase, so more storage space is needed. Research groups go through their own samples and update the sample data both manually to folders in the liquid nitrogen tank room and electronically in the “ltk-common \ KLIIN \ CRC \ Liquid nitrogen tanks” folder. This inventory will be carried out by the end of summer 2021, after which we know how many spots are currently available. Temporary places from individual research groups' own tanks are in temporary use so that those in acute need can cope over the summer. We will continue on this issue at the next meeting in August. Reetta and Antti will consider possible solutions for discussion. 3. Summertime arrangements 1. Antti will place orders for the summer next Monday, June 28. Notify him soon if you notice shortage in common consumables for cell culture such as water, gloves, tissue. 2. Check that there is enough 80% EtOH for the whole summer while Antti is on vacation, which is from 1 July to 9 August. 3. 341 / 342B cell cultures have activities all summer long. It is important that people at cell culture monitor general cleanliness and take care of the water baths in the incubators. Each research group takes care that the person who carries out the cell culture in summertime is aware of common tasks (Salla / Pia, Nina / Pipsa). Cell culture 357B is quiet during weeks 29/30 when Lena takes care of the water bath in incubators (Riikka, Lena and Miia). 4. The pediatrics takes care of the liquid nitrogen at the moment. Mervi and Anniina will take care of the responsibility while Maarit is on holiday. 5. Saija and Pirjo collect lab coats for washing on Tue 29.6. If you do not want/need your lab coat for washing at that time, mark it and move it to the side (and mention it to S&P). 4. Next meeting Tue 24.8. at 10 o'clock, on-site if possible

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

Crc June 2021