Crc August 2021

crc@lists.oulu.fi

14 participants
42 discussions

FW: Solution scattering course at FBMM, Oulu University, Nov 17-19 2021
by Mirja Peltola 26 Aug '21

26 Aug '21

Dear All, We are organizing a solution scattering (SAXS/SANS) course at FBMM, Oulu during Nov 17-19, 2021. There is a possibility for the registered participants to send the samples to Diamond Light Source for SAXS data collection prior to the course and work with own data during the course. Please see more details about the course in the link below. Program will be updated soon. https://www.oulu.fi/en/events/hbs-dp-course-macromolecular-small-angle-x-ra… Register for the course here!<https://link.webropolsurveys.com/S/8CE4646EBBD7F67A> (deadline Sep 20, 2021). regards Rajaram ******************************************* Rajaram Venkatesan, Ph.D., Docent Senior Research Fellow & Group Leader https://www.oulu.fi/fbmm/rajaram_venkatesan Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine University of Oulu P.O.Box 5400 | FIN-90014 | University of Oulu | Finland Room: D76C | Phone: +358 (0) 294 481185 ********************************************

1 0

Kontinkangas AoF info, program and link
by Emma Pirilä 26 Aug '21

26 Aug '21

Dear researchers, Please find below the program and link for the Kontinkangas Academy of Finland info 7.9. at 14-16 Program: 14.00 What's new in this call - Emma Pirilä 14.30 A successful Academy of Finland Project application - Caglar Elbuken 15.00 The data management - Jarkko Koivunen 15.20 Preparing the budget - Milla Miettinen 15.40 A successful Clinical researcher application - Elisa Rahikkala Everyone interested can join via this link: https://oulu.zoom.us/j/65543871321 Other infos: The Academy of Finland has several Ask&Apply Infos, more info here: https://www.aka.fi/en/research-funding/apply-for-funding/how-to-apply-for-f… University Academy of Finland info: https://patio.oulu.fi/fi/node/3493 Best regards, Emma

1 0

Syväjääpakastin Revco3 / Deep freezer Revco3
by Antti Haapalainen 25 Aug '21

25 Aug '21

Hei, Saimme eilen syväjääpakastimen Revco3 takaisin. Pakastin on nyt ollut päällä noin 24 tuntia ja se on liitetty hälytysjärjestelmään. Eli voitte alkaa tuomaan näytteitä takaisin pakastimeen. Hi, We got the deep freezer Revco3 back yesterday. The freezer has now been on for about 24 hours and is connected to the alarm system. You can start bringing samples back to the freezer. Terv. Antti

2 2

Soluviljelykokous/Cell culture meeting August 2021
by Reetta Hinttala 25 Aug '21

25 Aug '21

Hei, tässä yhteenveto tämän päivän soluviljelijöiden kokouksesta. Summary of the cell culture meeting today. Best regards, Reetta CRC:n soluviljelijät ti 24.8.2021 Yhteenveto 1. Kontaminaatio Soluviljelylaboratoriossa 342B on havaittu tällä viikolla kontaminaatio maljalla jota on viljelty ylemmässä inkubaattorissa. Kontaminaatio vaikuttaa mediumlähtöiseltä ja kyseinen malja sekä medium on tuhottu viivyttelemättä. Kontaminaatiota ei ole havaittu muilla maljoilla samassa inkubaattorissa. Sovittiin, että meneillään oleva koe suoritetaan loppuun ja sen jälkeen, ensi viikolla, kaappi steriloidaan. Sitä ennen inkubaattoriin ei kannata laittaa muiden kokeiden soluja kasvamaan. Tästä informoidaan näyttävästi ovessa. 2. Soluviljelyihin on hankittu klorillia ja etanolia varten yhteiskäyttöön pumppupulloja jotka sisältävät selkeät merkinnät sisällöistä ja niiden vaaroista. Turvalaseja on myös hankittu soluviljelyyn. Tässä yhteydessä keskusteltiin solukasvustojen inaktivoinnista. Todettiin, että pyritään siistimään soluviljelylaboratorioiden tiskipöydät vapaaksi kaikesta ylimääräisestä. Tilaa voi käyttää soluviljelmien inaktivoinnissa selkein merkinnöin (WASTE, päivämäärä) yön yli tai >30 min. Inaktivoituneet liuokset ja muovit tulee poistaa asianmukaisesti seuraavana päivänä joko saman henkilön tai toisen toimesta. Lavuaarien yhteyteen otetaan käyttöön yllä mainitut selkein merkinnöin olevat pumppupullot. Ryhmäkohtaiset pullot tms. vain selkein merkinnöin! Autoklavoitavat roskat tulee toimittaa sterilointiin vähintään kerran viikossa. Keskusteltiin myös virkonin ja klorillin ominaisuuksista. Näillä näkymin jatketaan klorillin käyttöä CRC:llä. 357B laboratorio ryhtyy mahdollisesti myös käyttämään inaktivoinnissa CRC:n yhteistä klorillia virkonin sijasta. Antti hoksautti vielä klorillin lisäämisestä EcoBioManageriin ryhmäkohtaisiin reagensseihin. Jos tarvitsette apua, Maarit Lastentaudeilta voi auttaa. 3. Kiepin laminaarikaappien pesu syksyn aikana ISS:n toimesta Antti ilmoittaa ISS:lle puhdistettavien laminaarikaappien lukumäärän ja selvittää suunnitellun siivousprotokollan. Tärkeää on huolehtia, että siivous suoritetaan soluviljelylaaminaareille ottaen huomioon kaappien erityinen puhtausaste. Tarkempaan aikatauluun palataan myöhemmin. 4. Nestetyppitankin hankinta Nestetyppitankkihuoneeseen on järjestelty tilaa yhdelle uudelle tankille, jonka hankintatiedustelut ovat meneillään Antin toimesta. Rackien rasioiden lukitusjärjestelmistä keskusteltiin, vaihtoehtoina ovat tikku- ja klipsilukitus. Mahdollisuus jälkimmäiseen selvitetään vielä Mediq:n kautta. 5. Seuraava kokous Ti 26.10. klo 10. CRC cell culture meeting Tue 24.8.2021 Summary 1. Contamination In cell culture laboratory 342B, contamination has been observed in a dish cultured in an upper incubator this week. The contamination appears to be of medium origin and the dish and medium in question have been destroyed without delay. No contamination has been observed in other plates in the same incubator. It was agreed that the ongoing experiment will be completed and then, next week, the incubator will be sterilized. Prior to that, cells from other experiments should not be placed in that incubator. This is informed clearly at the door of the incubator. 2. New pump bottles for chlorine and ethanol have been ordered for cell culture with clear labeling of the contents and their hazards. Safety glasses have also been purchased for cell culture. In this context, inactivation of cell cultures was discussed. It was noted that the surroundings of sinks needs to be cleared free of any excess bottles etc.. That space can be used to inactivate cell cultures with clear markings (WASTE, date) overnight or > 30 min. Inactivated media and plastics should be properly discarded the next day by either the same person or another. The above-mentioned clearly marked pump bottles are for common use. Group-specific bottles, etc. only with clear markings! Autoclavable plastics should be delivered for sterilization at least once a week. The properties of virkon and chlorine were also discussed. With these prospects, the use of chlorine in CRC will be continued. The 357B laboratory may also begin to use the common chlorine of the CRC instead of the virkon in the inactivation. Antti added that please add chlorine to the EcoBioManager for group-specific reagents. If you need help, Maarit from the Pediatrics group can help. 3. Cleaning laminars of Kieppi during the autumn by ISS Antti informs the ISS of the number of laminars to be cleaned and finds out the planned cleaning protocol. It is important to ensure that cleaning is properly performed on cell culture laminars maintaining the high level of sterility. We will return to a more detailed schedule later. 4. Acquisition of a new liquid nitrogen tank Space has been arranged in the liquid nitrogen tank room for one new tank. The inquiries are currently being carried out by Antti. Locking systems for rack boxes were discussed, options include stick and clip locking. The possibility of the latter is still being explored through Mediq. 5. Next meeting Tue 26.10. at 10 o'clock.

1 1

FW: QIAGENin syyskampanja
by Antti Haapalainen 24 Aug '21

24 Aug '21

From: Marja Leena Hellman - QIAGEN <MarjaLeena.Hellman(a)qiagen.com> Sent: tiistai 24. elokuuta 2021 13.12 To: Antti Haapalainen <antti.haapalainen(a)oulu.fi> Subject: QIAGENin syyskampanja Hei Antti, Toivottavasti kesä meni mukavissa merkeissä. Tiedoksesi meidän syyskampanja, jonka puitteissa saa 29-33% alennusta tuoteryhmistä, jotka listattu ohessa. Alennus on siis hieman korkeampi kuin vuositarjouksessanne. Kampanja on voimassa 5.9. asti. Tilatessa tulee käyttää BACK2LAB koodia ja alennus on kertaluonteinen. Jaathan tätä myös kollegoillesi😊 Terkuin, Marja-Leena Marja-Leena Hellman Senior Customer Solutions Manager, Life Science, Finland ________________________________ QIAGEN - Sample to Insight Mobile +358 40 5376966 marja.hellman(a)qiagen.com<mailto:marja.hellman@qiagen.com> www.qiagen.com<https://eur02.safelinks.protection.outlook.com/?url=http%3A%2F%2Fwww.qiagen…> Making improvements in life possible [cid:image001.jpg@01D798E9.9C090E00] Find a workflow to match your needs – QIAGEN Workflow Configurator A convenient tool to design experiments and find products to drive your research. Try it yourself here<https://eur02.safelinks.protection.outlook.com/?url=https%3A%2F%2Fwww.qiage…>

1 0

Kontinkangas Morning Research Seminars
by Pirkko Huhtala 24 Aug '21

24 Aug '21

Dear all, Kontinkangas Morning Research Seminars continue in Zoom during Autumn 2021 at 8.30-9.00 on given Thursdays. Welcome everybody to join! Below is the list of speakers and dates for the presentations with links. Date 8.30-9.00 in Zoom Speaker Title 16.9. 2021 https://oulu.zoom.us/j/66507885644 Mika Kaakinen, University Researcher Tissue imaging Center, Biocenter Oulu and ECM-Hypoxia research unit, FBMM PHD2 deletion in ECs or *SMCs cells reveals vascular cell type-specific responses in pulmonary hypertension and fibrosis 30.9. 2021 https://oulu.zoom.us/j/66507885644 Marita Kalaoja, Doctoral student Center for Life Course Health Research, FMED Mortality risk stratification in coronary angiography patients using a biomarker score 14.10.2021 https://oulu.zoom.us/j/66507885644 Tuula Salo, Professor Cancer and Translational Medicine Research Unit, FMED and Department of Oral and Maxillofacial Diseases, University of Helsinki Personalized cancer medicine assays: fish, chips and human tissue matrices" 21.10. 2021 https://oulu.zoom.us/j/62998563981 Tuomo Mantere, Postdoctoral researcher Academy of Finland, Laboratory of Cancer Genetics and Tumor Biology, Cancer and Translational Medicine Research Unit, FMED and Biocenter Oulu Next generation cytogenetics with optical genome mapping 11.11. 2021 https://oulu.zoom.us/j/63296176771 Ulla Petäjä-Repo, University Researcher MRC Oulu, Research Unit of Biomedicine, FMED Orphan receptors GPR37 and GPR37L1 as potential new drug targets 18.11. 2021 https://oulu.zoom.us/j/63296176771 Antti Haapalainen, University Researcher PEDEGO Research Unit and Medical Research Center Oulu, FMED, and Dept. of Children and Adolescents, Oulu University Hospital Regulation of spontaneous preterm birth 9.12.2021 https://oulu.zoom.us/j/61485838286 Reetta Hinttala, Coordinator and Anne Heikkinen, PhD Biocenter Oulu Transgenic and Tissue Phenotyping Core facility Updates on Tissue analysis services and Mouse strains in the TTP core facility Kind regards Pirkko Huhtala Pirkko Huhtala, PhD Coordinator Biocenter Oulu, University of Oulu e-mail: pirkko.huhtala(a)oulu.fi<mailto:pirkko.huhtala@oulu.fi> tel: +358-294 486101, + 358-40 1897467 Street address: Room 476B, Aapistie 5A, FIN-90220 Oulu Mailing address: PO Box 5000, FIN-90014 University of Oulu, Finland www.oulu.fi/biocenter<http://www.oulu.fi/biocenter>

1 0

Courses from IP rights and commercialization of research results
by Maarit Jokela 23 Aug '21

23 Aug '21

Hi, are you interested in * intellectual property rights (IPR): patents, copyrights, trademarks, who owns them, inventions * commercialization of your know-how / research results? If yes, please join to the trainings organized by University Innovation Centre in this autumn. We are offering following courses on: IP rights: * In Finnish: Kuka omistaa IPR:n? <https://patio.oulu.fi/fi/tapahtumat/webinaari-kuka-omistaa-iprn-2> 26.8. (1 h) * In English: Who owns the IPR?<https://patio.oulu.fi/fi/node/3483> 2.9. (1 h) * In English: Learn to use PatSeer Explorer - patent database<https://patio.oulu.fi/fi/node/3511> 22.9. (1.5h) * In English: IP rights and Research<https://patio.oulu.fi/fi/node/3486> 4. - 7.10. (total 7.5 h) * In Finnish: Milloin ja miksi patentoida? <https://patio.oulu.fi/fi/tapahtumat/webinaari-milloin-ja-miksi-kannattaa-pa…> 18.10. (1 h) * In English: Patenting - when and why?<https://patio.oulu.fi/fi/node/3485> 21.10. (1 h) * In English: Researcher, teacher, student - Get to know copyrights<https://patio.oulu.fi/fi/node/3488> 7.11. (total 6 h) * In Finnish: Patenttitietokantojen hyödyntäminen tutkimuksessa<https://patio.oulu.fi/fi/tapahtumat/opi-kayttamaan-patenttitietokantoja-1> 23. - 24.11. (total 7 h) Commercialization of know-how and research results: * In English: Entrepreneurship Bootcamp for Researchers <https://patio.oulu.fi/fi/node/3431> 31.8-28.9.(10 h) * In English: Learn to productize your own expertise 3.-4.11. (7 h, more info will come later) Welcome! Participate to the whole training or take the most interesting parts! The University Innovation Centre is a joint service by both the University of Oulu and Oulu University of Applied Sciences (Oamk). We help industries and business utilize research results and competences in developing businesses. We also help researchers and students in questions related to inventions and entrepreneurship. Best wishes, Maarit Maarit Jokela, PhD (Biochem.) Innovation Manager University of Oulu / University Innovation Centre https://www.innoblogi.com<https://www.innoblogi.com/> tel. +358-40-355 9660 https://fi.linkedin.com/in/maaritjokela [cid:image001.png@01D797FF.41B318F0] Follow us on LinkedIN<https://www.linkedin.com/company/universityinnovationcentre/> (Oulu University Innovation Centre) and Twitter<https://twitter.com/UICOulu> (UICOulu) The content of this message is confidential. If you are not a recipient indicated or intended in this message or you think this message may have been addressed to you in error, please inform us by an email reply and then delete the message. In such case it is forbidden to copy, forward, or in any way reveal the contents of this message to anyone

1 0

Viikon väitöstilaisuudet 27.8.
by Katja Riipinen 23 Aug '21

23 Aug '21

Hei, Tämän viikon perjantaina 27.8. järjestetään seuraavat väitöstilaisuudet: Alcohol-related health problems in critically ill patients<https://www.oulu.fi/yliopisto/node/212000> Väittelijä: Lääketieteen lisensiaatti Siiri Hietanen Aika: 27.8.2021, klo 12.00 Paikka: Luentosali 2, OYS (Kajaanintie 50) Etäyhteys: https://oulu.zoom.us/j/68410153745 Vastaväittäjä: Dosentti Stepani Bendel, KYS Kustos: Professori Janne Liisanantti, Oulun yliopisto ja OYS Väitöskirja: http://jultika.oulu.fi/Record/isbn978-952-62-2968-3 Oral humoral immune response to oxidized LDL epitopes and periodontal pathogens in coronary artery disease and periodontitis<https://www.oulu.fi/yliopisto/node/211914> Väittelijä: Hammaslääketieteen lisensiaatti Ramin Akhi Aika: 27.8.2021, klo 12.00 Paikka: Leena Palotie -sali 101A, Lääketieteellinen tiedekunta (Aapistie 5A) Etäyhteys: https://oulu.zoom.us/j/67635321327 Vastaväittäjä: Associate Professor Mataleena Parikka, Tampereen yliopisto Kustos: Professori Sohvi Hörkkö, Oulun yliopisto Väitöskirja: http://jultika.oulu.fi/Record/isbn978-952-62-2996-6 Yst. terveisin, Katja ---------------------------------------------------------------- Katja Riipinen, FT, TtK Koordinaattori Medical Research Center Oulu<https://www.oulu.fi/mrc/> | MRC Oulu Oulun yliopistollinen sairaala, Oulun yliopisto puh. 0294 48 5909, Mobiili +358 50 472 9414 PL 5000, 90014 OULUN YLIOPISTO (Aapistie 5A, huone 347B) [cid:image003.png@01D79801.EA8716F0]

1 0

Reminder Today HBS-DP Research Plan Seminar August 23, starting at 14:00, online
by Mirja Peltola 23 Aug '21

23 Aug '21

Reminder Today HEALTH AND BIOSCIENCES DOCTORAL PROGRAMME - RESEARCH PLAN SEMINARS<https://www.oulu.fi/uniogs/dp/hbsdp/research-plan-seminars> Time: Monday 23.8.2021, starting at 14:00 Place: online, zoom-link >>><https://oulu.zoom.us/j/66066770271> Research plan presentations by doctoral students: 14:00 - 14:20 Hoang Tuan Nguyen Research Plan: VA-on-a-chip platform for modelling vascular anomalies Research Unit: ECM and Hypoxia Supervisor: Lauri Eklund 14:20 - 14:40 Karri Parkkila Research Plan: Biomarkers and clinical parameters in comprehensive cardiovascular risk estimation Research Unit: Internal Medicine Supervisor: Olavi Ukkola 14:40 - 15:00 Mohamed Geneid Research Plan: Relationship between retinal vessel diameter with both retinal nerve fiber layer thickness and optic nerve head parameters in middle-aged Caucasians: the Northern Finland Birth Cohort Eye study Research Unit: PEDEGO Supervisor: Johanna Liinamaa Best wishes, Mirja ------------------------------------------------------------------------------------------------------ Mirja Peltola, PhD, BSc (Tech.) Koordinaattori | Coordinator Oulun yliopisto | University of Oulu Terveys- ja biotieteiden tohtoriohjelma | Health and Biosciences Doctoral Programme Tel. 0294 48 5447 PO Box 5000, FI-90014 OULUN YLIOPISTO (Aapistie 5A, Room 476B) www.oulu.fi<http://www.oulu.fi/yliopisto>

1 0

Research Funding from Sony
by Jaana Liimatainen 20 Aug '21

20 Aug '21

Dear Researcher Sony Faculty Innovation Award program provides up to $100K USD* in funds to conduct pioneering research in a wide range of areas in Information technology or Devices and Material, including e.g. Brain Technology and Digital Health. More info in https://www.sony.com/en/SonyInfo/research-award-program/#FacultyInnovationA…. Deadline for applications is 15.9.2021. Cheers, Jaana Jaana O. Liimatainen, PhD Coordinator Faculty of Medicine Aapistie 5A FIN-90220 University of Oulu tel. +358 294 487 459 mobile +358 50 590 4561 Jaana.Liimatainen[at]oulu.fi

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

Crc August 2021