Crc

crc@lists.oulu.fi

12 participants
4891 discussions

INVITATION TO THE KIEPPI SEMINAR TODAY 15-16 HALL 134b
by Seppo Vainio 15 Nov '07

15 Nov '07

Dear Scientist in the KIEPPI research building: Today we will have the third KIEPPI seminar. The place, time and the speakers of the seminar are indicated below. Your are all warmly welcome to this event. Tiina Hurskainen (Tiina.Hurskainen(a)oulu.fi) will host the seminar today. Place of the seminar: Hall 134B Time: 15.00-16.00 15.11. Hanna Alaoja (CRC): "Brain protection in heart surgery and stem cells in myocardial infarction - the chronic porcine models in Oulu" Johanna Uusimaa (CRC): "Clinical phenotypes and molecular genetics of mitochondrial diseases in childhood" Best scientific wishes, Seppo Vainio, PhD, Prof. Group leader of Biocenter Oulu Lab of Dev. Biol., Dept. of Med. Biochem. & Mol. Biol., Univ. of Oulu Mailing address: P.O.Box 5000, FIN-90014, University of Oulu, Finland Street address: Aapistie 5A, Rm.412, 90220, Oulu, FINLAND Tel.: 358-8-537 6084 Fax.: 358-8-537 6115 email: seppo.vainio(a)oulu.fi Lab:http://www.biocenter.oulu.fi/projects/vainio.html Biocenter Oulu homepage: http://www.biocenter.oulu.fi/

1 0

Fwd: [Ltkhkunta] FW: Roche/454 GS FLX genomisekvenaattori - esittelytilaisuus
by Tiina Hurskainen 14 Nov '07

14 Nov '07

> > > > >---------- >From: Kataja, Kari [mailto:kari.kataja@roche.com] >Sent: 12. marraskuuta 2007 14:16 >Subject: Roche/454 GS FLX genomisekvenaattori - esittelytilaisuus > >Arvoisa vastaanottaja, > >Tämä on kutsu Oulussa torstaina 29.11. klo 12 >pidettävään tilaisuuteen, jossa esittelemme >biotieteellistä tutkimusta kahden vuoden ajan >mullistaneen laitteen, GS FLX genomisekvensaattorin. > >GS FLX mahdollistaa laajan sovelluskirjon >monissa tutkimusalueissa. Nimensä mukaisesti >genomisekvenaattorilla on mahdollista >sekvensoida kokonaisten kasvien, hiivojen, >sienten ja virusten genomeja, mutta myös paljon >muuta. Tämä perustuu ainutlaatuiseen pitkän >lukupituuden, throughputin ja lukutarkkuuden >yhdistelmään. Allaolevassa taulukossa on >listattuna mahdollisia aplikaatioita. Linkit >johtavat sovellusten kuvauksiin ja julkaistuihin artikkeleihin. > >Vuoden 2005 syksyn lanseerauksen jälkeen, Rochen >/454 Life Sciencesn parallelsekvensaattoreita >on hankittu maailmanlaajuisesti yhteensä n. 100 >kpl. Tutkimuksen satona on julkaistu jo 100 >peer-reviewed artikkelia korkeatasoisissa >lehdissä, kuten Nature ja Science, joukossa mm. >Andrew Fire, v. 2006 lääketiete/fysiologia >Nobelin palkinnon saaja. Liitteenä on lokakuun julkaisuluettelo. > > > >Research Field > >Application > >Method > >Software > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050100>De >Novo<https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050100> >Sequencing > >Whole Genomes of Plants, Yeasts, Funghi, Bacteria, Viruses > >Shotgun Sequencing, Paired-End Sequencing, De Novo Assembly > >GS De Novo Assembler > >BACs, Fosmids, Plastids > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050200>Resequencing > >Whole Genomes of Human, Plants, Yeasts, Funghi, Bacteria, Viruses > >Shotgun Sequencing, Mapping to Reference Sequence > >GS Reference Mapper > >BACs, Fosmids > >Genomic rearrangements > >Paired-End Sequencing > >GS Reference Mapper > >Disease Associated Regions >(SNPs, indels) > >Shotgun Sequencing of Long-Range PCR Products > >GS Reference Mapper > >Amplicon Sequencing > >GS Amplicon Variant Analyzer > >Single Nucleotide Polymorphisms >(SNPs) > >Amplicon Sequencing > >GS Amplicon Variant Analyzer > >Somatic Mutations > >Amplicon Sequencing > >GS Amplicon Variant Analyzer > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050300>Transcriptome >Analysis > >Full-length transcripts > >Shotgun Sequencing > >GS De Novo Assembler > >Expressed Sequence Tags (ESTs) > >cDNA fragment sequencing > >3rd party software > >5'-Transcript Ends (5'-RATE) > >cDNA fragment sequencing > >3rd party software > >Multiplex Sequencing of Paired-End Ditags (Singapore MS-PET) > >cDNA fragment sequencing > >3rd party software > >Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) > >cDNA fragment sequencing > >3rd party software > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050400>Gene >Regulation Studies > >Small non coding RNAs > >cDNA fragment sequencing > >3rd party software > >Transcription Factor Binding Sites (ChIP-Sequencing) > >cDNA fragment sequencing > >3rd party software > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050500>Epigenetic >Changes > >DNA Methylation Pattern > >Amplicon Sequencing > >GS Amplicon Variant Analyzer > >Nucleosome Modifications > >DNA fragment sequencing > >3rd party software > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050600>Metagenomics >& Microbial Diversity > >Analysis of Environmental DNA > >Shotgun Sequencing > >3rd party software > >16S rRNA > >Amplicon Sequencing > >3rd party software > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/flx.jsp?id=050700>Paleogenomics > >Whole Genome Sequencing of Ancient DNA > >Shotgun sequencing > >GS Reference Mapper > > > >GS FLX:n nykykapasiteetilla sekvensoi yli 100 >miljoonaa emästä 7.5 tunnin ajolla - yhden >ihmisen työpanoksella, ilman ison mittakaavan >robotiikkaa. Käytännössä tämä massiivinen >kapasiteetti tarkoittaa esim. 4 Mb >bakteerigenomien sekvensointiprojektien >lyhenemistä useista kuukausista muutamiin >päiviin. Nyt on mahdollista toteuttaa >projekteja, jotka aikaisemmin olivat >ajallisesti, taloudellisesti ja henkilöresurssien puolesta mahdottomia. > >GS FLX:n tekniikka perustuu pyrosekvenointiin. >Selkeänä erona ja etuna muihin >parallelsekvensointilaitteisiin verrattuna on >yli kymmenkertainen lukupituus - yli 250bp. Tämä >ominaisuus on oleellinen paitsi de novo >sekvensoinnissa, niin kattavan ja oikean kuvan >saamiseksi myös monissa muissa sovelluksissa, >kuten sncRNA sekvensoinneissa. Muina valtteina >FLX:llä ovat mm. matala virhetaajuus (0,5%) ja pieni oversampling -vaatimus. > >Tässä on linkki www-sivuillemme, jossa voi >tutustua eri sovellutuksiin, teknologiaan >multimedia show'n muodossa, julkaistuihin artikkeleihin, jne. > ><https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/index.jsp>https://www.roche-applied-science.com/sis/sequencing/flx/index.jsp > > > >Helsingin Yliopiston Biotekniikan Instituutissa >genomisekvensaattori on ollut käytössä >joulukuusta 2006. Esittelytilaisuudessamme >sekvensointilaboratorion vetäjä Lars Paulin >kertoo laitteen käyttökokemuksista sekä instituutin palvelutoiminnoista. > > > >ILMOITTAUTUMINEN > >Esittelytilaisuus pidetään 29.11. klo 12-14:30 >Technopolis Kontinkankaassa, Kiviharjuntie 11. >Tilaisuuden jälkeen on tarjolla salaattibuffet. > >Ilmoittautua voi vastaamalla tähän sähköpostiin, >viimeistään tiistain 27.11. aikana. > >Tämän kutsun voi myös lähettää edelleen aiheesta kinnostuneille. > > > > > >Tervetuloa ! > > > > > >Ystävällisin terveisin, > > > >Kari Kataja > > > >Kari Kataja, DI >Avainasiakaspäällikkö > >Roche Diagnostics Oy >Sinimäentie 10 B >02630 Espoo > >Puh. (09) 5253 3361 / 041 5457902 (GSM) >Faksi (09) 5253 3351 ><mailto:kari.kataja@roche.com>mailto:kari.kataja@roche.com >www.roche-diagnostics.fi > >Uusi osoite ja puhelinnumero 23.11.2007 alkaen: > >PL 160, Klovinpellontie 3, 02181 Espoo, > >Puhelin 010 554 5803 > >Faksi 010 5545 5890 > >Kari Kataja, M.Sc. (Chem. Eng.) >Key Account Manager > >Roche Diagnostics Oy >Sinimäentie 10 B >02630 Espoo >FI-02630 Espoo, Finland >Phone: +358 9 5253 3361 / +358 41 5457902 (GSM) >Fax: +358 9 5253 3351 ><mailto:kari.kataja@roche.com>mailto:kari.kataja@roche.com >www.roche-diagnostics.fi > >New address as from 23 November 2007 > >P.O. Box 160, Klovinpellontie 3, FI-02181 Espoo, Finland > >Tel: +358 10 554 5803 > >Fax: +358 10 5545 5890 > >Confidentiality Note: This message is intended >only for the use of the named recipient(s) and >may contain confidential and/or proprietary >information. If you are not the intended >recipient, please contact the sender and delete >this message. Any unauthorized use of the >information contained in this message is prohibited > > > >_______________________________________________ >Ltkhkunta mailing list >Ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta

1 0

Viikkopalaveri!
by Tiina Hurskainen 12 Nov '07

12 Nov '07

Pidetään huomenna aamulla (tiistai 13.11.) klo 9 lyhyt viikkopalaveri aamukahvin yhteydessä. Aiheena mm. CRC:n puurojuhla. t. Tiina

1 0

MEDICAL SCHOOL RESEARCH CLUB TOMORROW 8.11.07
by Seppo Vainio 07 Nov '07

07 Nov '07

Dear fellows in Kieppi, CRC and Microbiology, This is just a reminder of the researhers meeting tomorrow. Attached the program for this event. The talks are free to all, Seppo Vainio

1 0

FW: [Ltkopettajat] Research club 8.11. klo 15-
by Seppo Vainio 02 Nov '07

02 Nov '07

Subject: [Ltkopettajat] Research club 8.11. klo 15- Hyvät senioritutkijat ja tutkimusryhmien johtajat Muistutan vielä 8.11.2007 klo 15.00 tutkijatapaamisesta Pyydän ilmoittamaan osallistumisesta 6.11.2007 mennessä (ruokailu). ystävällisin terveisin Eija Ruottinen RESEARCH CLUB MEETING OF THE SENIOR SCIENTISTS OF THE FACULTY OF MEDICINE Date Thursday, 08.11. 2007 Time 15.00- 18.00 Place of the seminar Hall 134 B, Aapistie 5 A Sign on for the meeting to Eija Ruottinen (eija.ruottinen(a)oulu.fi) until 6.11.2007 Opening & welcome by Seppo Vainio 15.00-15.20 Juha Veijola: "Risk for psychosis within the Northern Finland 1986 Birth Cohort 15.20-15.40 Johanna Myllyharju: "Enzymes regulating the hypoxia response" 15.40-16.00 Sohvi Hörkkö: "Protein carbamylation in atherogenesis" 16.00-16.20 Seppo Vainio: Genetic control of kidney organ size 16.20-16.40 Robert Winqvist: Mutations predisposing to breast cancer 16.40-17.00 About the research strategies of Pfizer Pia Eloranta, Head of Clinical Research 17.00-17.10 Faculty of Medicine research awards presented by Tuula Salo Closing words by Seppo Vainio 17.10- Get together at the lobby of Kieppi sponsored by Pfizer Buffet Welcome! Research club committee

1 0

INVITATION TO THE RESEARCH CLUB MEETING OF THE SENIOR SCIENTISTS OF THE FACULTY OF MEDICINE 8.11.07
by Seppo Vainio 25 Oct '07

25 Oct '07

Dear Senior scientists, PhDs and Post docs, You are warmly wellcome to the meeting of the scientists in the Medical School of University of Oulu. Please register by 5.11. to Eija Ruottinen (eija.ruottinen(a)oulu.fi). Yours, Seppo Vainio RESEARCH CLUB MEETING OF THE SENIOR SCIENTISTS OF THE FACULTY OF MEDICINE Date Thursday, 08.11. 2007 Time 15.00- 18.00 Place of the seminar Hall 134 B, Aapistie 5 A Sign on for the meeting to Eija Ruottinen (eija.ruottinen(a)oulu.fi) until 5.11.2007 Opening & welcome by Seppo Vainio 15.00-15.20 Juha Veijola: "Risk for psychosis within the Northern Finland 1986 Birth Cohort 15.20-15.40 Johanna Myllyharju: "Enzymes regulating the hypoxia response" 15.40-16.00 Sohvi Hörkkö: "Protein carbamylation in atherogenesis" 16.00-16.20 Seppo Vainio: Genetic control of kidney organ size 16.20-16.40 Robert Winqvist: Mutations predisposing to breast cancer 16.40-17.00 About the research strategies of Pfizer Pia Eloranta, Head of Clinical Research 17.00-17.10 Faculty of Medicine research awards presented by Tuula Salo Closing words by Seppo Vainio 17.10- Get together at the lobby of Kieppi sponsored by Pfizer Buffet Welcome! Research club committee Seppo Vainio, Seppo Alahuhta, Arja Rautio, Tuula Salo

1 0

INVITATION TO JOIN TOMORROW TO THE SECOND KIEPPI SEMINAR BY RIIKKA SÄYNÄJÄKANGAS 15-16
by Seppo Vainio 24 Oct '07

24 Oct '07

Dear research fellows, seniors and group leaders, PhD students, It is my pleasure to remind you about the second KIEPPI seminar that will take place tomorrow. This talk will be given by Riikka Säynäjäkangas from the Dept. of Microbiol. The place, time and title of the talk is indicated below. Your are all warmly wellcome to liste the talk of Riikka ! KIEPPI SEMINAR SERIES PROGRAM FOR FALL 2007 Contributing research units: Biocenter Oulu (BCO) Kieppi Res. Institution, Clinical Research Center (CRC) & Dept. of Microbiology Place of the seminar: Hall 134B Time: 15.00-16.00 25.10. Riikka Säynäjäkangas (Microbiology): " Differential gene expression in CD45+ para-aortic cells from chicken embryos" Yours, Seppo Seppo Vainio, PhD, Prof. Group leader of Biocenter Oulu Lab of Dev. Biol., Dept. of Med. Biochem. & Mol. Biol., Univ. of Oulu Mailing address: P.O.Box 5000, FIN-90014, University of Oulu, Finland Street address: Aapistie 5A, Rm.412, 90220, Oulu, FINLAND Tel.: 358-8-537 6084 Fax.: 358-8-537 6115 email: seppo.vainio(a)oulu.fi Lab:http://www.biocenter.oulu.fi/projects/vainio.html Biocenter Oulu homepage: http://www.biocenter.oulu.fi/

1 0

Fwd: [Ltkhkunta] Vieraileva luennoitsija torst. 25.10.2007
by Tiina Hurskainen 23 Oct '07

23 Oct '07

>X-Spam-Checker-Version: SpamAssassin 3.1.5 (2006-08-29) on sun3.oulu.fi >X-Spam-Level: >X-Spam-Status: No, score=-4.2 required=5.0 tests=ALL_TRUSTED,BAYES_00, > HTML_MESSAGE,TW_KH,TW_TK autolearn=ham version=3.1.5 >X-Virus-Scanned: amavisd-new at lists.oulu.fi >X-Original-To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >Delivered-To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >X-Virus-Scanned: amavisd-new at lists.oulu.fi >X-Mailer: QUALCOMM Windows Eudora Version 7.1.0.9 >Date: Tue, 23 Oct 2007 08:25:02 +0300 >To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >From: Marjatta Paloheimo <marjatta.paloheimo(a)oulu.fi> >Subject: [Ltkhkunta] Vieraileva luennoitsija torst. 25.10.2007 >X-BeenThere: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >X-Mailman-Version: 2.1.5 >List-Id: ltkhkunta.lists.oulu.fi >List-Unsubscribe: <http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta>, > <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=unsubscribe> >List-Archive: <http://lists.oulu.fi/mailman/private/ltkhkunta> >List-Post: <mailto:ltkhkunta@lists.oulu.fi> >List-Help: <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=help> >List-Subscribe: <http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta>, > <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=subscribe> >Sender: ltkhkunta-bounces(a)lists.oulu.fi > >Hei, > >Tervetuloa lastentautien klinikan >potilasmeetinkiin, jossa luennoi >kansainvälisesti arvostettu professori David Edwards Lontoosta. > >Aika: torstai 25.10.2007 klo 15.00 >Paikka: luentosali 12 > > Vieraileva luennoitsija > > Keskushermoston kehitys keskosilla > Professori David Edwards > Imperial College of London > > Tervetuloa! > > >_______________________________________________ >Ltkhkunta mailing list >Ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta

1 0

Fwd: [Ltkhkunta] Luento ihmisen kantasoluista tiistaina
by Tiina Hurskainen 22 Oct '07

22 Oct '07

>X-Spam-Checker-Version: SpamAssassin 3.1.5 (2006-08-29) on sun3.oulu.fi >X-Spam-Level: >X-Spam-Status: No, score=-4.2 required=5.0 tests=ALL_TRUSTED,BAYES_00,TW_KH, > TW_TK autolearn=ham version=3.1.5 >X-Virus-Scanned: amavisd-new at lists.oulu.fi >X-Original-To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >Delivered-To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >X-Virus-Scanned: amavisd-new at lists.oulu.fi >X-Mailer: QUALCOMM Windows Eudora Version 7.1.0.9 >Date: Mon, 22 Oct 2007 14:42:57 +0300 >To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >From: Pekka Kilpeläinen <pekka.t.kilpelainen(a)oulu.fi> >Cc: ltkopettajat(a)lists.oulu.fi >Subject: [Ltkhkunta] Luento ihmisen kantasoluista tiistaina >X-BeenThere: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >X-Mailman-Version: 2.1.5 >List-Id: ltkhkunta.lists.oulu.fi >List-Unsubscribe: <http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta>, > <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=unsubscribe> >List-Archive: <http://lists.oulu.fi/mailman/private/ltkhkunta> >List-Post: <mailto:ltkhkunta@lists.oulu.fi> >List-Help: <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=help> >List-Subscribe: <http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta>, > <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=subscribe> >Sender: ltkhkunta-bounces(a)lists.oulu.fi >X-MIME-Autoconverted: from quoted-printable to >8bit by cc.oulu.fi id l9MBgbm4008493 > >Hyvä vastaanottaja, > >Tämän viikon luento Biocenter Oulun >luentosarjassa saattaisi kiinnostaa >laboratorioidemme ulkopuoleltakin tulevia tutkijoita. > >Heli Skottman Tampereelta Regeasta (Institute >for Regenerative Medicine) luennoi tiistaina 23. >päivä ihmisten embryonaalisista kantasoluista ja niiden sovellutuksista. > >Luennon otsikko on: Derivation and applications >of human embryonic stem cell lines > >Luento pidetään päärakennuksen auditoriumissa (101A) > >Luento alkaa 14.45 ja kestää noin puolitoista tuntia. > >Koko luentosarjan ohjelmaa voi katsella osoitteessa: > >http://www.biocenter.oulu.fi/courses/graduate2007autumn.html > >Tervetuloa! > >Ystävällisin terveisin > >Pekka Kilpeläinen > > >Pekka Kilpeläinen, PhD >Coordinator of Biocenter Oulu Graduate School >University of Oulu, Biocenter Oulu >P.O. Box 5000 (Aapistie 5A) >FIN-90014 UNIVERSITY OF OULU >FINLAND > >Tel. + 358-8-537 6102 >Fax + 358-8-537 6115 >e-mail: pekka.t.kilpelainen(a)oulu.fi >BIOCENTER URL: http://www.biocenter.oulu.fi >(internal mail: Biocenter/5) > >_______________________________________________ >Ltkhkunta mailing list >Ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta

1 0

Fwd: [Ltkhkunta] Lectures in Modern Microscopy
by Tiina Hurskainen 22 Oct '07

22 Oct '07

>X-Spam-Checker-Version: SpamAssassin 3.1.5 (2006-08-29) on sun3.oulu.fi >X-Spam-Level: >X-Spam-Status: No, score=-3.0 required=5.0 tests=ALL_TRUSTED,BAYES_00, > HTML_90_100,HTML_MESSAGE,MIME_HTML_MOSTLY,TW_KH,TW_TK autolearn=ham > version=3.1.5 >X-Virus-Scanned: amavisd-new at lists.oulu.fi >X-Original-To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >Delivered-To: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >X-Virus-Scanned: amavisd-new at lists.oulu.fi >From: "Sinikka Eskelinen" <sinikka.eskelinen(a)oulu.fi> >To: <ltkhkunta(a)lists.oulu.fi> >Date: Mon, 22 Oct 2007 14:21:36 +0300 >X-Mailer: Microsoft Outlook Express 6.00.2900.3138 >X-Mailman-Approved-At: Mon, 22 Oct 2007 14:31:31 +0300 >Cc: Sinikka Eskelinen <sinikka.eskelinen(a)oulu.fi> >Subject: [Ltkhkunta] Lectures in Modern Microscopy >X-BeenThere: ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >X-Mailman-Version: 2.1.5 >List-Id: ltkhkunta.lists.oulu.fi >List-Unsubscribe: <http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta>, > <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=unsubscribe> >List-Archive: <http://lists.oulu.fi/mailman/private/ltkhkunta> >List-Post: <mailto:ltkhkunta@lists.oulu.fi> >List-Help: <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=help> >List-Subscribe: <http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta>, > <mailto:ltkhkunta-request@lists.oulu.fi?subject=subscribe> >Sender: ltkhkunta-bounces(a)lists.oulu.fi > >BIOCENTER <?xml:namespace prefix = st1 ns = >"urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" >/>OULU laboratory course:<?xml:namespace prefix >= o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" /> > > > >4th WORK SHOP ON > > > >VISUALISATION OF CELLS AND TISSUES BY LIGHT AND >ELECTRON MICROSCOPIC TECHNIQUES AND TOMOGRAPHIC METHODS > > > >Place Auditorium F101 >of the Department of Physiology and >the Biocenter Oulu Laboratories of the Main >Building of the Medical Campus, University of >Oulu, Aapistie 5A, P.O.Box 5000, FIN-90014 Oulu, Finland > >Time 24th to 26th October, 2007 > >Credits 1.5 ECTS units >for lectures and demonstrations 1 to 4; 0.3 ECTS units for lectures only. > >Organisers Biocenter Oulu Core >Facilities at the BCO Tissue Imaging Center and >the Departments of Medical Biochemistry and >Molecular Biology and Pathology, University of >Oulu, P.O. Box 5000, FIN-90014 University of Oulu, Finland > >Aim To get acquainted >with modern imaging technologies and collecting >of images of living and fixed cultured cells as >well as tissues using video microscope, laser >scanning confocal microscope, electron >microscope and optical tomography methods > >Information Sinikka Eskelinen, >Biocenter Oulu, Aapistie 5A, FIN-90014 >University of Oulu, Finland, tel. 358-8-537 >6101, fax 358-8-537 6115, e-mail ><mailto:sinikka.eskelinen@oulu.fi>sinikka.eskelinen(a)oulu.fi > >URL: <http://www.biocenter.oulu.fi/>http://www.biocenter.oulu.fi/ > > > >Registration Registration for lectures >recommended, registration for the demonstrations >obligatory. Only 16 students are accepted for >demonstrations. The application with a >short description of the research project should >be sent to Sinikka Eskelinen by September 28, >2007. Preference will be given to students whose >projects best benefit the topics of the demonstrations given during the course. > > > > > > > > >PROGRAM > > > > > >Wednesday, October 24th, 2007, Auditorium F101 >of the Department of Physiology of the Medical Campus, Aapistie 7 > >Chair persons: Sinikka Eskelinen, Raija Sormunen, Aki Manninen > > > >9.00 - 9.15 Opening words by Sinikka Eskelinen > > > >9.15 - 10.15 Live-cell imaging with EosFP and >other photoactivatable marker proteins of the GFP family > >Jörg Wiedenmann, School of Ocean & Earth >Science, University of Southampton National >Oceanography Centre, Southampton European Way, Southampton, U.K. > > > >10.15 - 11.15 Imaging Intracellular Signalling > >Michael Courtney, Molecular Signalling >Laboratory, Department of Neurobiology, A.I. >Virtanen Institute, University of Kuopio, Finland > >11.15 - 12.30 Lunch > > > >12.30 - 13.30 Optical projection tomography: 3D >microscopy of embryos and organs > >Jamie Davies, University of Edinburgh, Edinburgh, Scotland, U.K. > > > >13.30 - 14.30 Confocal microscopy of thick specimens > >Nathalie Garin, Microscopy, Imaging & Morphology >Facility, ISREC, Swiss Federal Institute of Technology in Lausanne, Switzerland > > > >14.30 - 15.00 Coffee > > > >15.00 - 16.00 Electron microscopic 3D imaging > >Willie Geerts, Electron Microscopy Group >Utrecht, University of Utrecth, The Netherlands > >16:00 16.15 Concluding remarks by Raija Sormunen > > > > > > > > > >Thursday and Friday, October 25th to 26th , 2007 > > > > > >Gathering in the meeting room 487B of Biocenter >Oulu, Aapistie 5A, 4th floor, at 8.45 a.m. on >Thursday and Friday morning for demonstrations. > > > >Demonstration groups: > > > >Group 1 > >1. Kirsi >Rilla Ph.D. Biomedicine/Kuopio > >2. Ilkka Pietilä M.Sc. Med.biochem. > >3. Fumi Suomi M.Sc. Biochemistry > >4. Satu Myllymäki B.Sc. Med.biochem > >5. Sanna Sillankorva M.Sc. Bioprocessing > > > > > >Group 2 > >6. Katja Anttila M.Sc. Biology > >7. Elina Kiiskilä B.Sc. Anatomy > >8. Mari Aikio M.Sc. Med.biochem > >9. Tuomas Huttunen Med.Cand. Med.biochem. > >10. Henrika Honkanen M.Sc. Anatomy > > > >Group 3 > >11. Antti Rivinoja M.Sc. Biochemistry > >12. Anniina Vihervaara M.Sc. Turku, Biotech > >13. Meng Wang Dipl.Eng Dept.Elect Eng > >14. Timo Ruuska M.Sc. Surgery/CRC > >15. Matti Kinnunen D.Sc.(Tech) Optoelectronics > > > >Group 4 > >16. Antti Salo M.Sc. Biochemistry > >17. Tiina Kantola M.Sc. Pathology > >18. Anne Kunnari M.Sc. Internal med > >19. Veli-Pekka Ronkainen M.Sc. Physiology > >20. Marjut Tuominen B.Sc. Med biochem > > > >Demonstrations 1 -4: > > >Thursday > > > >Hours > >1st group > >2nd group > >3rd group > >4th group > >9 - 12 > >Confocal microscopy 1 > >Confocal microscopy 2 > >Live cell imaging 1&2 > >Electron microscopy > >12 - 13 > >lunch > >lunch > >lunch > >lunch > >13 - 16 > >Electron microscopy > >Confocal microscopy 1 > >Confocal microscopy 2 > >Live cell imaging 1&2 > > > >Friday > > > >Hours > >1st group > >2nd group > >3rd group > >4th group > >9 - 12 > >Live cell imaging 1&2 > >Electron microscopy > >Confocal microscopy 1 > >Confocal microscopy 2 > >12 - 13 > >lunch > >lunch > >lunch > >lunch > >13 - 16 > >Confocal microscopy 2 > >Live cell imaging 1&2 > >Electron microscopy > >Confocal microscopy 1 > > > >Demonstrations: > >1. Olympus confocal microscope 1: visualisation >of thick specimens, room 423A > >Teacher: Nathalie Garin, Lauri Eklund, Mikko Nokkonen > >2. Olympus confocal microscope 2 equipped with >second laser: photoactivatable marker proteins in living cells, room 422A > >Teacher: Jörg Wiedenmann, Aki Manninen, Mikko Nokkonen > >3. Live cell imaging 1 using Olympus inverted >microscope and Okolab chamber: long term cell >culture and wound healing, room 421A > >Teacher: Terhi Teräväinen and Riikka Wirkkala > >Live cell imaging 2 using Olympus Cell M system: >visualisation of cell organelles and >cytoskeletal components in living cells, room 419A >Teacher: Sinikka Eskelinen and Linda Rosberg > >4. Electron microscopy: 3D tomography of EM >images, room 337B (microcomputer class) > >Teacher: Willie Geerts, Raija Sormunen >Sinikka Eskelinen, Ph.D. >Coordinator >Biocenter Oulu >University of Oulu >mailing address: >P.O.Box 5000, FIN-90014 University of Oulu >Finland >street address: >Aapistie 5A, FIN-90220 Oulu >Tel. 358-8-5376101 >Fax 358-8-5376115 >e-mail <mailto:sinikka.eskelinen@oulu.fi>sinikka.eskelinen(a)oulu.fi >BIOCENTER <http://www.biocenter.oulu.fi>URL:http://www.biocenter.oulu.fi >_______________________________________________ >Ltkhkunta mailing list >Ltkhkunta(a)lists.oulu.fi >http://lists.oulu.fi/mailman/listinfo/ltkhkunta

1 0

Jump to page:

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

Crc