Eurooppalainen biologisen tiedon tutkimusinfrastruktuuri ELIXIR ja Euroopan bioinformatiikan yhteisö järjestävät maailmanlaajuisen COVID-19 Biohackathonin 5.4.-11.4.2020.

Biohackathonin tavoitteena on ponnistella yhdessä ja luoda työkaluja COVID-19-analyysejä varten. Biohackathon johtaa helpompaan datan saatavuuteen, protokolliin, analyysityökaluihin, ennusteisiin sopivista proteiineista jne. Hackathoniin osallistujat ajavat myös muutoksia ei-julkista tai vaikeasti saatavilla olevaa dataa koskeviin politiikkoihin.

Kaikki ovat tervetulleita osallistumaan hackathoniin. Tämä on hyvä mahdollisuus yliopistojen, ammattikorkeakoulujen ja tutkimuslaitosten tutkijoille ja CSC:n asiantuntijoille yhdistää voimat, hyödyntää asiantuntemustaan ja toimia pandemiaa vastaan. Lisäksi tämä hackathon tarjoaa suomalaistutkijoille hyvän mahdollisuuden verkostoitua kansainväliseen kehittäjä- ja data-analyytikkoyhteisön kanssa.

CSC tukee tätä hackathonia tarjoamalla osallistujien käyttöön pilvilaskentaa ja tallennuskapasiteettia.

• cPouta IaaS pilvipalvelu
• Allas objektitallennuspalvelu
• Rahti konttitekniikkaan perustuva pilvipalvelu
• CWL workflow execution pipeline on Rahti*
• Galaxy pulsar service via cPouta*

* valmisteltavana

Uudet osallistujat voivat rekisteröityä ottamalla yhteyttä tapahtuman järjestäjiin. Lisätietoja ja järjestäjien yhteystiedot löytyvät sivulta https://github.com/virtual-biohackathons/covid-19-bh20

Lisätietoja CSC:ltä

Shubham Kapoor
Team Lead, Cloud Solutions
puh. +358-504284065
s-posti  shubham.kapoor@csc.fi

Tommi Nyrönen
Program Director
ELIXIR node Finland
puh: +358503819511
s-posti tommi.nyronen@csc.fi

In English:

The ELIXIR & European Bioinformatics Communities are organising the Global COVID-19 Biohackathon on 5.-11.4.2020. 

The goal of the biohackathon is to create a cohesive effort and work on tooling for COVID-19 analysis. This biohackathon will lead to more readily data accessibility, protocols, computational analysis tools, protein predictions etc. The participants will also push for policy change where it comes to non-public or hard to access data.

Anyone can join and contribute. This is a good opportunity for researchers in universities, universities of applied sciences and research institutions and CSC’s specialists to join forces, utilise their expertise and fight against the pandemic. Also this provides Finnish researchers a way to connect to global developer and data analyst community.

CSC participates in this hackathon by offering access to its state-of-the-art cloud computing and data lake services for hackathon participants.

• cPouta IaaS cloud service access
• Allas Object Storage service access
• Rahti Container cloud service access
• CWL workflow execution pipeline on Rahti*
• Galaxy pulsar service via cPouta

* under preparation

For new registrations, one needs to contact the organising team. More information and contact details of organising team are at https://github.com/virtual-biohackathons/covid-19-bh20.

More information at CSC

Shubham Kapoor
Team Lead, Cloud Solutions
Tel: +358-504284065
E-mail  shubham.kapoor@csc.fi

Tommi Nyrönen
Program Director
ELIXIR node Finland
Mobile: +358503819511
tommi.nyronen@csc.fi