Genetics September 2007

genetics@lists.oulu.fi

2 participants
4 discussions

DNA Baser? (fwd)
by Minna Ruokonen 25 Sep '07

25 Sep '07

Hi, see message below. Tommi is asking if anyone has used program DNA Baser for sequence editing and has some experiences to share. Cheers, Minna ---------- Forwarded message ---------- Date: Mon, 24 Sep 2007 16:23:56 +0300 From: Tommi Nyman <Tommi.Nyman(a)joensuu.fi> To: Minna Ruokonen <minna.ruokonen(a)oulu.fi> Subject: DNA Baser? Tere! Pitäisi löytää BioEdit:iä parempi kohtuuhintainen vaihtoehto Sequencherille... Onko sinulla kokemusta DNA Baser -ohjelmasta (http://www.dnabaser.com), tai tiedätkö ketään, joka on sitä käyttänyt? Onko muita vaihtoehtoja? t., Tmi ---------------------------------------------------------------------------------------------------- Tommi Nyman Faculty of Biosciences University of Joensuu P.O. Box 111, FI-80101 Joensuu Finland Phone: +358 (0)40 520 6540 (mobile) / +358 (0)13 251 3582 (office) E-mail: Tommi.Nyman(a)joensuu.fi Homepage: http://www.joensuu.fi/biologia/nyman ----------------------------------------------------------------------------------------------------

1 0

Biohitin seminaari (fwd)
by Minna Ruokonen 20 Sep '07

20 Sep '07

Hei, Muistutus: Biohitin pipetointiseminaariin ilmoittautuminen päättyy huomenna. Ohjelma liitteenä. terv. Minna = = = = = = = = = = = = = = = = = = = Minna Ruokonen = = Department of Biology = = POB 3000 = = FIN-90014 University of Oulu = = FINLAND = = = = minna.ruokonen(at)oulu.fi = = +358-(0)8-553 1807 (office) = = +358-(0)8-553 1061 (fax) = = = = cc.oulu.fi/~mruokone/ = = www.flcrp.org = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ---------- Forwarded message ---------- Date: Thu, 20 Sep 2007 12:55:09 +0300 From: "Hirvonen, Essi" <Essi.Hirvonen(a)biohit.com> To: minna.ruokonen(a)oulu.fi Subject: Biohitin seminaari Hei Minna, Biologian laitokselta on ilmoittautunut vasta muutama henkilö. Liitteenä vielä kutsu, olisi mukavaa, jos useampi pääsisi osallistumaan. Terveisin, Essi Hirvonen Product Specialist, Biohit Oyj Laippatie 1, FI-00880 Helsinki, Finland Tel: +358 9 773 86 258 Mobile: +358 400 485 140 Fax: +358 773 86 204 essi.hirvonen(a)biohit.com www.biohit.com <http://www.biohit.com> www.pipettitohtori.fi <http://www.pipettitohtori.fi> www.gastropanel.net <http://www.gastropanel.net/> --- Biohit - Innovating for Health

1 0

Biohitin seminaari Linnanmaalla tiistaina 25.9 (fwd)
by Minna Ruokonen 15 Sep '07

15 Sep '07

Hei, Biohitin pipetointiseminaarin ohjelma. Hi, programme for Biohit's pipetting seminar. Minna = = = = = = = = = = = = = = = = = = = Minna Ruokonen = = Department of Biology = = POB 3000 = = FIN-90014 University of Oulu = = FINLAND = = = = minna.ruokonen(at)oulu.fi = = +358-(0)8-553 1807 (office) = = +358-(0)8-553 1061 (fax) = = = = cc.oulu.fi/~mruokone/ = = www.flcrp.org = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ---------- Forwarded message ---------- Date: Fri, 14 Sep 2007 15:30:29 +0300 From: "Hirvonen, Essi" <Essi.Hirvonen(a)biohit.com> To: minna.ruokonen(a)oulu.fi Subject: Biohitin seminaari Linnanmaalla tiistaina 25.9 Hei Minna! Liitteessä kutsu seminaariimme. Toivottavasti biologian laitokselta pääsisi mukaan paljon väkeä. Terveisin, Essi Essi Hirvonen Product Specialist, Biohit Oyj Laippatie 1, FI-00880 Helsinki, Finland Tel: +358 9 773 86 258 Mobile: +358 400 485 140 Fax: +358 773 86 204 essi.hirvonen(a)biohit.com www.biohit.com <http://www.biohit.com> www.pipettitohtori.fi <http://www.pipettitohtori.fi> www.gastropanel.net <http://www.gastropanel.net/> --- Biohit - Innovating for Health

1 0

Biol4-palvelimen lakkautus
by Jouni Aspi 14 Sep '07

14 Sep '07

Uuden tietohallinnon kanssa tehtävän sopimuksen mukaan: "Toimialuepalveluun liittymisen myötä biologian laitoksen oma Windows-toimialue lakkautetaan, laitoksen palvelimet ajetaan alas ja niiden kautta saadut palvelut siirretään tietohallinnon toimialuepalveluun". Tämä tarkoittaa siis, että myös perimän tiedostopalvelin (Biol4), jossa monilla on sekvenssitiedostoja, Abi-ajoja etc. lakkautetaan. Sinne tallennetut aineistot pitäisi siis aktiivikäyttäjien siirtää muualle. Palvelimella näkyy olevan myös kansioita henkilöillä, jotka eivät enää työskentele laitoksella (ks: liite). Näille henkilöille pitäisi varmaan myös tiedottaa palvelimen lopettamisesta. Uuden sopimuksen mukaan: "Toimialuepalvelussa kaikille henkilökuntaan kuuluville varataan 3,0 GB:n käyttäjäkohtainen levytila kotihakemistoa varten". Eli kaikki saavat 3 Gigaa tallennustilaa tietohallinnon palvelimelle, jonne tietoja Biol4-palvemilelta voi siirtää. Tuolla palvelimella olevat tiedot nauhavarmistetaan päivittäin, joten se on turvallinen säilytyspaikka (turvallisempi kuin se Biol4). Tosin monella on Biol4-palvelimella tietoa enemmän kuin 3 Gigaa, joten uudelle palvelimelle ne eivät välttämättä sovi. Lisätilasta palvelimella täytyy maksaa. Koska nykyisin siirrettävien kovalevyjen hinta alkaa olla n 100 euroa/300 gigaa, niin ehkä työryhmien kannattaisi harkita sellaisen hankkimista jos Biol4-palvemilla olevia tietoja halutaan säilyttää. Toinen vaihtoehto lienee tietojen polttaminen DVD-levyille. Palvelinta ei ajeta alas heti sopimuksen solmimisen jälkeen, mutta ehkä kannattaa alkaa jo miettiä tietojen siirtoa muualle palvelimelta. Jouni _____________________________________ Dr. Jouni Aspi Docent, Senior Curator Department of Biology, Zoological Museum P.O. Box 3000, FIN-90014 University of Oulu, FINLAND tel: +358-8-5531214; fax: +358-8-5531061 e-mail: jouni.aspi(a)oulu.fi _____________________________________

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

2003

2002

Genetics September 2007