Moi,
Auli Karhu pyysi kyselemään sekvensointiongelmista meillä. Biomedicumissa useammalla ryhmällä ja ilmeisesti myös Viikissä on kiinnitetty huomiota vääriin heterotsygootteihin suorasekvensoinnissa (esim. sama näyte ajettu 4 kertaa, eri nukleotideja heterotsygoottisena eri toistoissa: lähes joka kerta eri tulokset) ja tuplapiikkeihin klooneissa. Usein muutos on ollut G=>A tai C=>T (kirottua!), ja ongelma viittaa siihen, että vika on kemikaaleissa. Siellä on käytössä v3.1 kuten useimmilla meistäkin kai on. Jos olette huomannut jotain vastaavaa täällä, ottakaa yst. yhteyttä Auliin (auli.karhu@helsinki.fi) mahd. pian, aikovat pitää palaveria asiasta huomenna firman kanssa.
Minna
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = Minna Ruokonen = = Department of Biology = = University of Oulu = = POB 3000 = = FIN-90014 University of Oulu = = FINLAND = = = = minna.ruokonen@oulu.fi = = +358-(0)8-553 1802 (office) = = +358-(0)8-553 1061 (fax) = = +358-(0)40-7355770 (mobile) = = = = = = = = = = = = = = = = = = =