Hei,
olin viime viikolla vierailulla Biologian laitoksella kasvitieteen
puolella. Paikalla olivat Laura Jaakola ja Marko Suokas. Meillä on ollut
keskustelua sekvensointireaktioiden puhdistamisesta ja robotiikan
hyödyntämisestä tässä yhteydessä. Kuulin, että sinä vastaat
perinnöllisyystieteen puolella sekvensoinnista. Laura uskoi teidän puolella
olevan myös kiinnostusta aiheeseen.
Reagenssit, joista olemme puhuneet, ovat Agencourtin
(Beckman Coulterin omistama). Puhdistus tapahtuu magneettibeadien avulla.
Beadit ovat hyvin pieniä, noin 1 um, jolloin sitomiskapasiteetti on suuri ja liuos
pysyy myös tästä syystä homogeenisena, eikä sedimentoitumista tapahdu. Prosessi
tapahtuu magneettileyillä, joissa muodostuu rengasmainen pelletti ja
epäpuhtaudet voidaan helposti pipetoida kuopan pohjalta. Puhdistus tehdään samalla
levyllä, jossa pcr reaktio ja tuotteet voidaan myös injektoida ABIlle tältä
levyltä adapterin avulla. Menetelmä on erittäin tehokas ja sen avulla päästään
alhaisiin BigDye konsentraatioihin. Tulokset ovat myös tasalaatuisia ja ja
lukupituus hyvä. Nämä ovat varmasti tärkeita asioita sekvensointipalvelulle.
Ohessa data sheet CleanSeq kitistä ja lisää infoa löytyy Agencourtin
sivuilta www.agencourt.com
Toivottavasti sinulla olisi hetki aikaa tutustua tähän ja
voitaisiin keskustella asiasta lisää.
Ystävällisin terveisin
Marja-Leena Hellman
Marja-Leena Hellman
Tuoteryhmäpäällikkö
Ordior Oy
Konalantie
00390 Helsinki
Puh: 09 530 80014
Matkapuhelin: 040 537 6966