Biolaitos

biolaitos@lists.oulu.fi

10 participants
4520 discussions

PhD possibility in Jyväskylä: Neurospora evolutionary genetics
by Heikki Helanterä 02 Dec '21

02 Dec '21

Hi all, see information below for a very exciting Phd possibility in Ilkka Kronholm's group in Jyväskylä! Heikki From: Kronholm, Ilkka <ilkka.kronholm(a)jyu.fi> Sent: torstai 2. joulukuuta 2021 18.20 >>>>>>>>>>>>>>>>> Department of Biological and Environmental Science at the University of Jyväskylä, has a call open to recruit 3 students into doctoral program of the department. The position is for 4 years, starting from August 2022. The annual salary for a Doctoral Researcher will be approximately 28 000 EUR (gross income, including holiday bonus). The application to the doctoral programme is a two stage process. There are several projects available, including mine (see description below), not all of them are related to evolutionary biology. In the first round the applicant selects a project (only one) that they are interested in. The deadline for the first round is January 14th 2022. Apply using the electronic application form found here: https://tinyurl.com/5999y729 After the application deadline, the main supervisor of each project will select one best candidate for their project. These top candidates will be asked to write a 2-page long research plan on the thesis topic and will be interviewed by a committee of the doctoral program. Decision on the positions will be made by March 31, 2022. More information can be found at: https://tinyurl.com/bdfappn4 Please read it carefully. The candidate is expected to have, or is about to obtain, a Master's degree in a relevant discipline. I know the application process to the doctoral school is laborious, but please consider applying if you are interested in the project. About my group: My group studies evolutionary genetics focusing on adaptation and mutation. Projects going on in the lab include the role of epigenetic changes in adaptation, mutations and their effects, parental effects (in fungi) and their role in adaptation, quantitative genetics of thermal performance, and adaptation in fluctuating environments. We use mainly fungal experimental systems: the filamentous fungus Neurospora crassa, and fission yeast. Fungi are very good genetic model systems, and with fission yeast it is possible to do experimental evolution. Sometimes we also use computer simulations to investigate how evolution works. Otherwise we use the methods and theory of population and quantitative genetics. More information about the lab can be found at: ikronholm.net The project: Traditionally population genetics has been concerned only with DNA sequence changes. However, in recent years it has been revealed that certain epigenetic modifications, such as DNA methylation, can be transmitted from one generation to the next in some contexts, particularly in plants. The aim of this project is to develop population genetic methods for the analysis of methylation variation data. In particular, the goal is to compare different methods of calculating divergence in methylation patterns and examine how to use methylation information in population genetic analyses. Second goal is to investigate the patterns of DNA methylation variation in the filamentous fungus Neurospora crassa that is being collected in our group, and to test hypotheses of about the role of methylation variation in publicly available data from plants. There is also some room to tailor the project according to interests of the candidate. For example looking at different aspects Neurospora population genetics such as recombination, natural selection, particularly for structural variants. The project will be mostly computational in nature, and a successful candidate should have a strong interest in population genetics and evolutionary biology. A background in evolutionary biology, population genetics, bioinformatics or a related discipline is an advantage, as are some programming skills such as R or python, and familiarity with unix/linux. Previous experience with fungi is not required. About Jyväskylä and Finland: Finland has a high standard of living, with free schooling (also in English), affordable childcare, good family benefits, and healthcare. Jyväskylä is located in central Finland in the Finnish lakeland, and has excellent opportunities for different nature, outdoor, and sports activities. The city of Jyväskylä is a major educational center and the city has a large student population. As such there is a vibrant cultural scene in the city. To find useful information about the University of Jyväskylä, the City of Jyväskylä and living in Finland, see the international staff guide: https://www.jyu.fi/en/workwithus/international-staff-guide For further details or any questions, please contact: Ilkka Kronholm Academy Research Fellow Biological and Environmental Science University of Jyväskylä, Finland ilkka.kronholm(a)jyu.fi<mailto:ilkka.kronholm@jyu.fi> @kronholmlab Kind regards, Ilkka Kronholm

1 0

VL: Open PhD position in the University of Turku, Finland
by Seppo Rytkönen 02 Dec '21

02 Dec '21

Hei tiedosksi jatkokoulutuspaikka turkkusesta sr ------------------------------------------------------------- Seppo Rytkönen, Oulu ------------------------------------------------------------- ________________________________ Lähettäjä: Tapio Eeva <teeva(a)utu.fi> Lähetetty: maanantai 13. syyskuuta 2021 17.43 Vastaanottaja: Seppo Rytkönen <seppo.rytkonen(a)oulu.fi> Kopio: Miia Rainio <miikoi(a)utu.fi> Aihe: RE: Open PhD position in the University of Turku, Finland Hei, Meillä on auki yksi ekotoksikologiaan ja lintuihin liittyvä jatkokoulutuspaikka. Voisitko kierrättää oheista hakemusta OU:ssa sopivaksi katsomallasi tavalla :) Kiitos! Tapio Eeva Department of Biology FI-20014 University of Turku Finland -----Original Message----- From: Miia Rainio <miikoi(a)utu.fi<mailto:miikoi@utu.fi>> Sent: maanantai 13. syyskuuta 2021 12.47 To: suvi.k.ruuskanen(a)jyu.fi<mailto:suvi.k.ruuskanen@jyu.fi>; carita.lindstedt-kareksela(a)helsinki.fi<mailto:carita.lindstedt-kareksela@helsinki.fi>; thomas.lilley(a)helsinki.fi<mailto:thomas.lilley@helsinki.fi>; leena.m.lindstrom(a)jyu.fi<mailto:leena.m.lindstrom@jyu.fi>; aigi.margus(a)jyu.fi<mailto:aigi.margus@jyu.fi>; silvia.espin(a)um.es<mailto:silvia.espin@um.es>; asa.berglund(a)umu.se<mailto:asa.berglund@umu.se>; caroline.isaksson(a)biol.lu.se<mailto:caroline.isaksson@biol.lu.se>; Jouni Sorvari <jousor(a)utu.fi<mailto:jousor@utu.fi>>; sylvie.massemin(a)iphc.cnrs.fr<mailto:sylvie.massemin@iphc.cnrs.fr>; anne.charmantier(a)cefe.cnrs.fr<mailto:anne.charmantier@cefe.cnrs.fr>; vinkler1(a)natur.cuni.cz<mailto:vinkler1@natur.cuni.cz>; rutealexandra(a)gmail.com<mailto:rutealexandra@gmail.com>; Carlos Gomez Gallego <carlos.gomezgallego(a)uef.fi<mailto:carlos.gomezgallego@uef.fi>>; marcel.eens(a)uantwerpen.be<mailto:marcel.eens@uantwerpen.be>; mirella.kanerva(a)gmail.com<mailto:mirella.kanerva@gmail.com> Cc: Tapio Eeva <teeva(a)utu.fi<mailto:teeva@utu.fi>> Subject: Open PhD position in the University of Turku, Finland Dear colleagues, We have an interesting open PhD position in the field of ecotoxicology "Pollution-related bird-microbiome associations" in the Department of Biology, University of Turku (Finland) starting from the 1st of January 2022. Please, feel free to circulate the advertisement (attached) for anyone who could be interested. Further details, please contact: Tapio Eeva (teeva(a)utu.fi<mailto:teeva@utu.fi>) or Miia Rainio (miikoi(a)utu.fi<mailto:miikoi@utu.fi>) Thank you for your help! Best regards, Miia ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ PhD, Miia Rainio Post-doc researcher Title of Docent in Ecophysiology Department of Biology FI-20014 University of Turku FINLAND

1 0

Opinnäytetöiden ohjaajille tärkeä Laturi -koulutus
by Minna Vanhatalo 02 Dec '21

02 Dec '21

Hei, muistuttaisin kaikkia LuK-tutkielmia ja graduja ohjaavia, jos vain aikataulu antaa myöten, osallistumaan tämänpäiväiseen Laturi -koulutukseen. Käsittääkseni jatkossa opiskelijat ja ohjaajat täyttävät järjestelmään lopputöiden palautukseen ja tarkastukseen tarvittavat taustatiedot (ei enää esityslomakkeita tarkastajiksi study.scienceen). terv. Minna Lyhyt koulutus/info -tilaisuus pidetään suomeksi 2.12. klo 14.15 - 15.45 Teamsissa. Join on your computer or mobile app Click here to join the meeting<https://teams.microsoft.com/l/meetup-join/19%3ameeting_ZWExMDJkMWMtMzBjMS00…>

1 0

VL: Tehtävämuutoksia HR:ssä
by Jouni Aspi 01 Dec '21

01 Dec '21

Tiedoksi. Jouni Lähettäjä: Harri Pakkanen <Harri.Pakkanen(a)oulu.fi> Lähetetty: keskiviikko 1. joulukuuta 2021 10.14 Vastaanottaja: Anita Aikio <Anita.Aikio(a)oulu.fi>; Marko Huttula <Marko.Huttula(a)oulu.fi>; Jouni Aspi <Jouni.Aspi(a)oulu.fi>; Jarkko Saarinen <jarkko.saarinen(a)oulu.fi>; Juha Vaara <juha.vaara(a)oulu.fi>; Mikko Sillanpää <Mikko.Sillanpaa(a)oulu.fi> Kopio: Maarit Järvenpää <Maarit.Jarvenpaa(a)oulu.fi> Aihe: Tehtävämuutoksia HR:ssä Hyvät yksikönjohtajat, Uusi henkilöstöassistentti Laura Kettunen on aloittanut työt yliopistolla tämän viikon maanantaina. Hän ottaa vastuulleen Luonnontieteellisen tiedekunnan HR assistentin tehtävät. Häneen voitte siis olla jatkossa yhteydessä kun tarvitsette HR Assistentin apua. Charlotta Rahikainen on siirtynyt toisen tiedekunnan rekrytointisuunnittelijaksi ja nyt LuTK:n osalta rekrytointisuunnittelijana toimii Tea Södö. Häneen voitte olla yhteydessä kun esim. Saimassa haluatte paikkoja julkaista. Luonnollisesti minunkin kautta tietoa Lauralle tai Tealle kulkee. Terv Harri

1 0

VL: [Yo-opettajat] Salitekniikka yksinkertaistuu / The lecture hall av technology will be simplified
by Lumi Viljakainen 30 Nov '21

30 Nov '21

Lähettäjä: yo-opettajat-bounces(a)lists.oulu.fi <yo-opettajat-bounces(a)lists.oulu.fi> Puolesta Paula Vaskuri Lähetetty: tiistai 30. marraskuuta 2021 14.45 Vastaanottaja: 'yo-opettajat' <yo-opettajat(a)lists.oulu.fi> Aihe: [Yo-opettajat] Salitekniikka yksinkertaistuu / The lecture hall av technology will be simplified Välitän viestiä luokkien av-vasrustelun uudistuksista / Please, find the news about reform of av technology in lecture rooms. Salitekniikka yksinkertaistuu: omat kannettavat käyttöön, salikoneet poistuvat Pandemian jälkeisessä ajassa meillä on uusia tarpeita opetuksen ja tapahtumien järjestämiseen. Yliopiston saleissa parannetaan AV-tekniikkaa niin, että lähtevän ja tulevan äänen ja kuvan laatu olisi aiempaa parempi ja toiminta salissa aiempaa helpompaa ja yksinkertaisempaa. Tästä syystä saleissa tehdään seuraavia uudistuksia: * Salikoneet poistuvat asteittain saleista, joissa niitä yhä on. Kaikki saleissa olevat koneet kerätään pois viimeistään kesällä 2022. * Jatkossa opetukseen ja tapahtumiin käytetään kunkin omaa kannettavaa tietokonetta tai lainakannettavaa tulossa olevasta laitelainaamosta. Laitelainaamosta tiedotetaan erikseen vielä tämän loppuvuoden aikana. * Saleihin asennetaan yleiskameroita ja kattomikrofoneja sekä kaiuttimet. Tällä varmistetaan kuvan ja äänen laadukas lähetys ja vastaanotto. * Laitelainaamoon tulee myöhemmin saataville myös muita salitekniikkaa täydentäviä laitteita, kuten dokumenttikameroita, webbikameroita ja pöytämikrofoneja. * Salitekniikan käytön koulutusta järjestetään laajalti työpajamaisina tapahtumina vuonna 2022. The lecture hall av technology will be simplified: use your own laptop, the computers from lecture halls will be removed In the post-pandemic period, we have new needs for teaching and organizing events. AV technology will be improved in the university halls. The quality of the outgoing and incoming sound as well as video and presentation will be better than before. Using the devices in the hall will be easier and simpler, too. For this reason, the halls will be renovated during the rest of the year and next year: * The classroom computers are gradually leaving the classrooms and lecture halls where they are still present. All machines in the lecture halls will be collected no later than summer 2022. * In the future, own laptops or borrowed laptops will be used for teaching and events. The equipment lending closet will be announced separately later this year. * Lecture room cameras and ceiling microphones as well as speakers will be installed in the halls. This ensures high quality picture and sound transmission and reception. * Other equipment that complements the lecture hall technology, such as document cameras, webcams and desktop microphones, will also be available at the equipment lending closet in the near future. * Training in the use of classroom technology will be organized in the form of workshops in 2022. Kari Keinänen Tietohallintojohtaja Oulun yliopisto Puh. +358 29 448 3067 PL 8000, 90014 OULUN YLIOPISTO www.oulu.fi<http://www.oulu.fi/yliopisto> | www.oulu.fi/th<http://www.oulu.fi/th> Uutinen on myös Patiossa / You can find same information in Patio, too Suomeksi<https://patio.oulu.fi/fi/uutiset/salitekniikka-yksinkertaistuu-omat-kannett…> In English<https://patio.oulu.fi/en/news/lecture-hall-av-technology-will-be-simplified…>

1 0

Priyanka Trivedin väitöslahjakeräys/ Money-collection for Priyanka Trivedis gift
by Taina Uusitalo 30 Nov '21

30 Nov '21

Hei, Priyanka Trivedi väittelee 10.12.2021 klo 12. Tilaisuus pidetään kasvitieteellisellä puutarhalla. Lahjakeräys on B107 in vitron laboratoriossa. Keräykseen voi osallistua 8.12.-21 asti. Ystävällisin terveisin, Taina Uusitalo p. 0503507198 Hi All, Priyanka Trivedi will defence her thesis on 10.12.2021 at 12 o´clock. The dissertation will be held at the Botanical Gardens. Money-collection for her present is in B107 in vitro-lab. The collection time is until 8.12.-21. With Best Regards, Taina Uusitalo

1 0

Biologian tutkinto-ohjelman Missä mennään -tilaisuus 14.12. klo 12.00-13.00
by Lumi Viljakainen 29 Nov '21

29 Nov '21

English info is arranged for ECOGEN students (separate e-mail) Tervetuloa Biologian tutkinto-ohjelman opiskelijoille järjestämään Missä mennään -tilaisuuteen 14.12. klo 12.00-13.00. Tilaisuudessa käsitellään mm. seuraavia asioita: * killan keräämä palaute lähi-/etäopetuksesta * kevään opetusten järjestäminen * Peppi & HOPS * graduprosessin uudistaminen Tilaisuus järjestetään zoomissa: https://oulu.zoom.us/j/62847853045 Terveisin, Lumi Viljakainen Biologian tutkinto-ohjelman vastuuhenkilö

1 0

VL: open lectureship Lund
by Vatka, Emma O 29 Nov '21

29 Nov '21

Hi, An open position of Senior University Lecturer in Lund. https://lu.varbi.com/en/what:job/jobID:443387/type:job/where:4/apply:1 - Emma Lähettäjä: owner-egru-list(a)helsinki.fi <owner-egru-list(a)helsinki.fi> Puolesta Merilä, Juha Lähetetty: sunnuntai 28. marraskuuta 2021 3.09 Vastaanottaja: EGRU LIST <egru-list(a)helsinki.fi> Aihe: [egru-list] FW: open lectureship Lund Juha Merilä Ecological Genetics Research Unit Organismal and Evolutionary Biology Research Programme Faculty Biological & Environmental Sciences University of Helsinki Finland juha.merila(a)helsinki.fi<mailto:juha.merila@helsinki.fi> Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=cZJ7ifQAAAAJ&hl=en Publons: https://publons.com/author/341551/juha-merila#profile From: Christer Brönmark <christer.bronmark(a)biol.lu.se<mailto:christer.bronmark@biol.lu.se>> Date: Friday 26. November 2021 at 20.40 To: "Merilä, Juha" <juha.merila(a)helsinki.fi<mailto:juha.merila@helsinki.fi>> Subject: open lectureship Hej Juha I hope all is well with you! Everything is fine here in Lund, today even the sun is shining! We have announced a position as senior lecturer in Aquatic Ecology and it would be great if you could pass on the information about this to potential candidates in your neighbourhood. Thanks! Have a nice weekend! Christer https://lu.varbi.com/en/what:job/jobID:443387/type:job/where:4/apply:1 [Image removed by sender.]<https://lu.varbi.com/en/what:job/jobID:443387/type:job/where:4/apply:1> Senior University Lecturer in Aquatic Ecology<https://lu.varbi.com/en/what:job/jobID:443387/type:job/where:4/apply:1> lu.varbi.com At the Department of Biology, we perform fundamental research in a number of different areas, ranging from processes at the molecular level to interactions in ecosystems, and from the genetic code to behaviour. We also perform research on a number of applied topics, such as conservation biology, pes __________________________________________ Christer Brönmark Professor Aquatic Ecology, Department of Biology Lund University, Sweden Tel Work: +46-46-222 3702, Cell phone: 073-08 155 48 http://www.biology.lu.se/christer-bronmark Have you seen our book? [Image removed by sender.] The 3rd edition of "The Biology of Lakes and Ponds" http://www.oup.com/academic/product/9780198713609

1 0

Master's seminar 1.12.
by Juhani Hopkins 29 Nov '21

29 Nov '21

https://oulu.zoom.us/j/66787207738 Please remember to sign in to Zoom with your full name. If you don't, I can't register your attendance. 14.15. Emma Ojanen 14.35 Wille-Pekka Lepo 15.20 Tuuli Kumpula Mesozooplankton community composition in the northern and southern Benguela Current upwelling system Pohjaeläinyhteisöjen monimuotoisuus jokiverkostossa - latvapurot biodiversiteetin ylläpitäjinä? Metsäpeuran (Rangifer tarandus fennicus) vasojen säilyvyys Kainuun populaatiossa Henna Karhunen Tuuli Kumpula Jukka Aho Plan Result Plan Timo Muotka Timo Muotka Timo Muotka Kaisa-Leena Huttunen, Maya Dalby, Holger Auel Kaisa-Leena Huttunen, Timo Muotka Seppo Rytkönen, Antti Paasivaara

1 0

EI ENÄÄ FW: LuK-tutkielman palautus Laturikatkon aikana
by Minna Vanhatalo 26 Nov '21

26 Nov '21

Hei, kanditöitä ei enää oteta vastaan alla olevan ohjeistuksen mukaisesti ellei ole kyse kandiksi valmistumisesta joulukuussa. Tällaiset kandiopiskelijat ottakaa minuun heti yhteyttä. Odotamme uuden Laturin avautumista 1.12. ja sen mukana tulevia uusia ohjeita opiskelijoille ja kandityön ohjaajille. Vasta sen jälkeen aloitetaan töiden lataaminen ja hyväksyminen Laturi 2:ssa. terv. Minna From: Minna Vanhatalo Sent: torstai 21. lokakuuta 2021 9.49 To: biology-students(a)lists.oulu.fi Subject: LuK-tutkielman palautus Laturikatkon aikana Importance: High LuK-tutkielman palautus Laturikatko aikana Lähetä tämä ohjeviesti myös pääohjaajallesi, jotta voitte yhdessä täyttää julkaisulomakkeeseen kuuluvat tiedot (ohjaajasi, kandityön lopullinen nimi suomeksi ja tarkastajien nimet) siinä vaiheessa kun kandityösi on valmis. Päivää ja allekirjoita täyttämäsi julkaisulomake. Merkitse julkaisusopimukseen, että käytät Urkund -plagioinnintunnistusta. Moodlen Turnit ei ole vielä käytössä. Liitä tiivistelmä LuK-tutkielmasi alkuun kansilehden jälkeen. Nähtävästi tuo sama teksti pitää laittaa aikanaan Laturi 2.0:aan kun se aukeaa. Tee Muuntajan ohjeiden mukaisesti kandityöstä ja kirjaston julkaisulomakkeesta (kandityön viimeiseksi liitteeksi) yksi PDF/A-tiedosto https://muuntaja.oulu.fi/. Tuo julkaisulomakkeen laittaminen samaan tiedostoon ei vaikuta mitenkään kandityösi mahdollisiin varsinaisiin liitteisiin tai sivunumerointiin (numerointia ei muuteta yms.) Varmista ohjaajaltasi, että hänellä on Urkund -käyttöoikeudet aktivoituna (ohjeet löytyvät alla olevasta nettilinkistä), ennen kuin lähetät PDF/A tiedoston Urkundiin, muuten raportti ei mene hänelle. Sen jälkeen laita työ plagioinnintunnistukseen https://www.oulu.fi/urkund/ ja laita pääohjaajasi tarkastajaksi, jolle työ lähtee tarkastukseen sähköpostitse. Lähetä tämän sivuston Työn lähettäminen<https://appelsiini.oulu.fi/uadr/urkund_lomake.html> kautta. Ei Laturin kautta. PDF/A tiedoston nimi ei saa ylittää 20 merkkiä. Merkitse tiedostosi nimi selkeästi: SukunimiLuKbiol Jos sukunimesi on pitempi, lyhennä muista sanoista muutama kirjain Ohjaajasi ja toinen tarkastaja lähettävät tuon PDF/A tiedoston sekä kandityön arvostelulomakkeen study.science -lähipalveluihin. Käyttökatkon jälkeen lataat työsi Laturi 2.0 järjestelmään (ei haittaa vaikka työ olisi sitä ennen jo hyväksytty). Tästä tulee erikseen Kirjaston ohjeistus, kun järjestelmä avautuu. terv. Minna

1 0

Jump to page:

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

2003

Biolaitos