Biolaitos

biolaitos@lists.oulu.fi

10 participants
4520 discussions

Invitation to thesis defense
by Mukta Joshi 15 Apr '24

15 Apr '24

Hello everyone, I would like to invite you all to the public defense of my doctoral thesis this Friday, 19th of April, at auditorium IT116. The official thesis announcement and the link for remote following can be found here - https://www.oulu.fi/en/theses/interface-phylogenetics-and-population-geneti… The link to electronic version of thesis is here - https://urn.fi/URN:NBN:fi:oulu-202403122187 Best regards, Mukta

1 0

Biology Thursday seminar 18th Apr on site - a double session on genomics with Bengt Hansson & Marianne Espeland
by Heikki Helanterä 15 Apr '24

15 Apr '24

Dear colleagues, this week's Biology Thursday seminar will a special double session, on site in room L9, 12:15 on 18th April - there will be two talks ca. 30 minutes each and plenty of time for discussion! Our speakers are: Prof. Bengt Hansson, Univ. Lund, Sweden: Sex chromosomes and their role in speciation https://portal.research.lu.se/en/persons/bengt-hansson-2 https://scholar.google.se/citations?user=npvVvnYAAAAJ&hl=sv and Dr. Marianne Espeland, Leibniz Institute for the Analysis of Biodiversity Change : Target enrichment and whole genome sequencing for Lepidoptera phylogenomics: Museum specimens and beyond https://bonn.leibniz-lib.de/en/zfmk/marianne-espeland https://scholar.google.com/citations?user=tKU5uHwAAAAJ&hl=en Note that on Friday 19th April Prof. Hansson will also be the opponent in Mukta Joshi's PhD thesis defence: https://www.oulu.fi/en/theses/interface-phylogenetics-and-population-geneti… See you on Thursday, Heikki

1 0

Thank you to everyone!
by Nga Nguyen 15 Apr '24

15 Apr '24

Dear everyone, Thank you very much for all the care and support during my PhD journey and on my defense on Friday. You inspired, taught, encouraged, and comforted me through these years that helped me grow up a lot. My sincerest thanks for always being there for me. Also thank you so much for the wonderful, suspiring, and lovely gifts, I really love them. Thank you again and wish you all the best. Best regards, Nga

1 0

FW: 2 PhD student positions StockholmU - evolutionary/population genomics in plants
by Heikki Helanterä 15 Apr '24

15 Apr '24

Very interesting PhD opportunities in Stockholm with application deadline next week– see below! Cheers, Heikki From: Pyhäjärvi, Tanja <tanja.pyhajarvi(a)helsinki.fi> Sent: maanantai 15. huhtikuuta 2024 10.30 Subject: Fwd: 2 PhD student positions StockholmU - evolutionary/population genomics in plants Feel free to forward to potential interested students. Tanja Slotte’s lab is a great opportunity! Tanja Välitetty viesti alkaa: Lähettäjä: Tanja Slotte <Tanja.Slotte(a)su.se<mailto:Tanja.Slotte@su.se>> Aihe: 2 PhD student positions StockholmU - evolutionary/population genomics in plants Päivämäärä: 9. huhtikuuta 2024 klo 15.46.49 UTC+3 Vastaanottaja: Pyhäjärvi, Tanja <tanja.pyhajarvi(a)helsinki.fi<mailto:tanja.pyhajarvi@helsinki.fi>> Dear Tanja, I was wondering if you might be able to help spreading the information below on two open PhD student positions to potential candidates - that would be greatly appreciated! There are currently two open PhD student positions in my group at Stockholm University, associated with two recently funded projects: 1. Convergent evolution and loss of distyly - genetic causes and genomic consequences - funded by the Swedish Research Council Ad: https://shorturl.at/acvFX 2. Unlocking genetic variation for climate adaptation of crops - funded by Formas Ad: https://shorturl.at/orCY6 The application deadline is April 23, 2024 for both positions (applications should be submitted through the Stockholm University system - see link from ad). For both positions, we are looking for candidates with a strong interest and training in population/evolutionary genomics. For more details, see the complete ads and attached flyers. Feel free to share with potential candidates! All the best, Tanja Tanja Slotte Professor Department of Ecology, Environment and Plant Sciences (DEEP) Stockholm University 106 91 Stockholm E-mail: tanja.slotte(a)su.se<mailto:tanja.slotte@su.se>

1 0

Maisteriseminaari 17. huhtikuuta / Master seminar 17th April
by Veli-Matti Pakanen 15 Apr '24

15 Apr '24

Heippa kaikille, Seuraava maisteriseminaari on keskiviikkona 17. huhtikuuta. Muistakaa kirjautua zoomiin omalla nimellä. Suoritusta ei voida kirjata muuten. Hello everyone, The next master’s seminar will be on Wednesday 17th of April. Remember to use your name in zoom. https://oulu.zoom.us/j/64668752013 Time Speaker Title Opponent Plan/ Result Professor Supervisors 14:15 Camilla Reinikainen Purojen uoma- ja valuma-aluekunnostusten vaikutukset virtavesien sammalten monimuotoisuuteen ja yhteisökoostumukseen Taika Lehtimäki Results Timo Muotka Jussi Jyväsjärvi ja Joel Nyberg 15:00 Taika Lehtimäki Uoma- ja valuma-aluekunnostusten yhdys- ja erillisvaikutukset purojen pohjaeläimiin Anni Mäntymäki Results Timo Muotka Joel Nyberg, Jussi Jyväsjärvi

1 0

No unit meeting 12th Apr / ei yksikköpalaveria 12.4.
by Heikki Helanterä 11 Apr '24

11 Apr '24

Instead - remember to attend Nga's PhD defence at noon, room IT115: https://www.oulu.fi/en/theses/towards-comprehensive-understanding-fruit-dev… Cheers, Heikki =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358 50 4700 545

1 0

Gradupaikkaseminaarin esitelmät Moodlessa
by Veli-Matti Pakanen 11 Apr '24

11 Apr '24

Heippa kaikille! Viime viikolla pidetyn gradupaikkaseminaarin esitelmät löytyvät Moodles maisteriseminaarin sivujen aikataulusta tekijän nimen mukaan. Käykäähän katsomassa, jos ette päässeet kuuntelemaan esityksiä! Terveisin, Vellu

1 0

REMINDER: Biology Thursday seminar 3pm, Prof. Paula Mulo on regulation of photosynthesis
by Heikki Helanterä 11 Apr '24

11 Apr '24

Dear colleagues, please remember that Biology Thursday seminar continues today 11th April at 3pm, on site in room SÄ110 - please note unusual time and room! Our speaker will be Prof. Paula Mulo from the University of Turku, on "New insights into regulation of photosynthesis: Chloroplast acetyltransferases and acetylation of chloroplast proteins" (abstract below) More on her research at: https://www.utu.fi/fi/ihmiset/paula-mulo Also remember that Prof. Mulo will be the opponent for Nga Nguyen's thesis defence on Friday 12th, at noon: https://www.oulu.fi/en/theses/towards-comprehensive-understanding-fruit-dev… See you in the seminar, Heikki New insights into regulation of photosynthesis: Chloroplast acetyltransferases and acetylation of chloroplast proteins Paula Mulo Department of Life Technologies, University of Turku, 20520 Turku, Finland pmulo(a)utu.fi<mailto:pmulo@utu.fi> Acetylation is one of the most common chemical modifications, and it affects a variety of molecules ranging from metabolites to proteins. Recent development of enrichment techniques and mass spectrometry has revealed that acetylation is a prevalent modification also in plants, and that in addition to cytosolic and nuclear proteins also numerous chloroplast proteins are targets of N-terminal and/or lysine acetylation. We have recently characterized a chloroplasts-localized family of GNAT acetyltransferases in Arabidopsis thaliana. The GNAT enzymes are unique among the acetyltransferase enzymes as they possess dual protein acetylation activity, i.e. they catalyze acetylation of the N-terminal amino acid as well as acetylation of the integral lysine residues of the protein. Our results show that each GNAT enzyme has distinct specificity in terms of favored substrates, and that they play unique roles in the accumulation of specific plant metabolites. Depletion of GNAT2 has marked effects on the acetylation level of several chloroplast proteins, organization of thylakoid protein complexes and photosynthetic properties of plants. Specifically, formation of the Photosystem I-LHCII complex is prevented in the gnat2 knock-out plants, which results in impaired balancing of the light energy between the photosystems (state transitions). Moreover, loss of GNAT2 severely disturbs light-dependent dynamics of thylakoid stacking. Altogether, our results indicate that chloroplast acetyltransferases are new and important regulators of photosynthetic light harvesting with a marked impact on the growth and metabolism of plants. Koskela et al. 2018 Plant Cell 30, 1695-1709; Bienvenut et al. 2020 Mol Syst Biol 16:e9464; Koskela et al. 2020 Photosynth Res, 145, 15-30; Rantala et al. 2022 Plant Cell Physiol 63,1205-1214; Ivanauskaite et al. 2023 Plant Cell Physiol 64, 549-563. =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358 50 4700 545

1 0

FW: Interest on Food 2.0 Valio Leading company program / Business Finland?
by Heikki Helanterä 10 Apr '24

10 Apr '24

Hi all, Valio Food 2.0 Business Finland program is looking for collaborative partners across the University. See the attached, and let me know if interested. Note that their RDI needs (page 5 in the attachment) have many keywords that are broad and general, and linked to a lot of the research ongoing or planned at our unit (Measuring and modeling biodiversity, carbon cycles, water management, gene technologies, remote sensing to name a few. Cheers, Heikki) From: Samuli Urpelainen <samuli.urpelainen(a)oulu.fi> Sent: maanantai 8. huhtikuuta 2024 14.39 To: Heikki Helanterä <Heikki.Helantera(a)oulu.fi>; Ville-Veikko Telkki <ville-veikko.telkki(a)oulu.fi>; Marko Huttula <Marko.Huttula(a)oulu.fi> Subject: FW: Interest on Food 2.0 Valio Leading company program Importance: High Hei! Tiedustelisin olisiko tutkimusyksiköissänne kiinnostusta tai tulokulmaa Valion BF veturiohjelmaan osallistumisesta. Alla hieman lisätietoja. Voitte laittee kyselyä eteenpäin mahdollisesti kiinnostuneille tutkijoille. ystävällisin terveisin, Samuli From: Petri Leukkunen <petri.leukkunen(a)oulu.fi<mailto:petri.leukkunen@oulu.fi>> Date: Friday 5. April 2024 at 10.22 Subject: Interest on Food 2.0 Valio Leading company program Hello everyone, You probably know about Valio’s Business Finland funded program Food 2.0. The program roadmap is attached to this email. My role at Oulu University Innovation Centre is to help to coordinate collaboration with the program. Now I want to collect our interests to the program. Based on your answers, I will send Valio their ecosystem membership form that summarizes collaboration interests from our university. To indicate interest, simply reply to this email, can you please indicate theme(s) (presented on the Roadmap slide 4) that are of interest to you. Simple yes or no is enough, but if you can, please elaborate the interest (see also slide 5 to see more detailed RDI needs). List of themes: 1. Future products * yes/no * our interest: 2. Technology transformation * yes/no * our interest: 3. Regenerative production * yes/no * our interest: 4. Circular economy & resource efficiency. * yes/no * our interest: Email list is not exhaustive, so please inform the colleagues that have potential interest in the Food 2.0 program. Ystävällisin terveisin, Petri Leukkunen Petri Leukkunen, Customer Manager University of Oulu University Innovation Centre PO Box 4300, FI-90014 University of Oulu, FINLAND (Visiting address: Erkki Koiso-Kanttilan katu 11) +358 504 351 184 LinkedIn<https://www.linkedin.com/in/petri-leukkunen> Follow University Innovation Centre: Blog<https://www.innoblogi.com/>, Twitter<https://twitter.com/UICOulu> & LinkedIn<https://www.linkedin.com/company/universityinnovationcentre> University of Oulu website<https://www.oulu.fi/> This email and possible attachment are confidential. If you're not the right recipient of this e-mail, please notify the sender and destroy this message with possible attachments. Thank you.

1 0

Public lecture 22.4. and Scientific lecture 23.4. events by Marc-André Selosse on Soil microbes and Climate Change
by Saija Ahonen 10 Apr '24

10 Apr '24

For anyone interested in soil microbes and climate change see below (sorry, the below text is only in Finnish, but the events are in English) ________________________________ Erillään katoamme -hankkeemme järjestää Puistokatu 4:ssä, Tieteen ja toivon talolle Helsingissä maanantaina 22.4. klo 17.30 maaperämikrobien merkitystä luotaavan illan The Invisible Supports the Visible – Soil microbes and Climate Change. Kutsua saa jakaa! Tieteellisestä luennosta lopussa. Illan pääpuhujana toimii ranskalainen maaperäaktiivi, mykologi ja evoluutiobiologi, professori Marc-André Selosse. Hän puhuu maaperämikrobien perustavasta merkityksestä ilmastonmuutoksessa ja avaa joukkosukupuuton ajatusta maaperästä käsin. Ranskassa ilmastonmuutos näkyy hälyttävänä kuivuutena ja kuumuutena, kokonaisten ekosysteemien romahtamisena. Paneelikeskustelussa suuntaamme kohti kaupunkiympäristöjä. Keski-Euroopassa suuret kaupungit ovat käynnistäneet laajoja vehreyttämisohjelmia ilmastonmuutoksen pakottamana. Keskusteluun liittyvät maisema-arkkitehti Varpu Mikola, mikrobiyhteisöekologi Aki Sinkkonen ja kuvataiteilija Visa Suonpää. Moderaattorina toimii kuvataiteilija Nina Rantala. Usein ajattelemme, että asia koskee jotain meistä kaukana olevaa, mutta asiat on ratkaistava myös lähellä, kaupungeissa, missä suuri osa ihmisistä asuu. Illan kantavana teemana on keskustella siitä, miten voimme toimia yhdessä maaperämikrobien kanssa ja mitkä voisivat olla ne uudet käytännöt, jotka ottavat huomioon maaperämikrobien monimuotoisuuden. Tämä nostaa esiin myös vanhojen ikimetsien merkityksen luonnon varmuusvarastona ja korostaa kaiken yhteenkietoutumista. Tilaisuuden järjestää monialainen Apart We Shall Perish, Erillään katoamme -työryhmä ja tilaisuus on osa tieteellisen tiedon jalkauttamishanketta ja sitä tukee Maj ja Tor Nesslingin säätiö. Tilaisuus on englanninkielinen ja sitä on mahdollista seurata myös etänä. Ilmoittaudu tilaisuuteen tästä<https://docs.google.com/forms/d/1APCEMhdBa41Uu_NoBgd5-pxD2tpIHa7ntHnLzJDkTf…>. Tilaisuuteen on ilmoittautuminen, jotta olemme ajan tasalla osallistujamäärästä. Emme kuitenkaan kerää ilmoittautuneiden tietoja. Maaperän puolesta tehtävää työtämme voit seurata @apartweshallperish <https://www.instagram.com/apartweshallperish/> instatililtämme. Lisätietoja Nina Rantala, ninarantalastudio(a)gmail.com<mailto:ninarantalastudio@gmail.com>. The Invisible Supports the Visible – Soil microbes and Climate Change 17:00 kahvitarjoilu 17:30 Avaussanat 17:40 Marc-André Selossen alustus (45 min.) 18:25 Panelistit esittäytyvät 18:40 Keskustelu alkaa 19:10 Yleisöä otetaan mukaan 19:30 Tilaisuus päättyy ... Marc-André Selosse pitää lisäksi Helsingin yliopistossa ti 23.4. klo 14–16 tieteellisen luennon Viikki Soil Science Seminaarissa Viikin kampuksella, luentosali B6. Aiheena Mycorrhizal networks: cooperation or cheating? Luentoa voi seurata myös etänä Teams:issä. Linkki tässä<https://teams.microsoft.com/l/meetup-join/19%3ameeting_MmFhMjE2NjgtZmI0Yi00…>. Lisätietoa osallistujista: Marc-André Selosse kuuluu Ranskan viitatuimpiin luonnontieteilijöihin ja toimii professorina Ranskan Luonnonhistoriallisen museon ja Sorbonnen yliopiston yhteisessä instituutissa The Institute of Systematics, Evolution, Biodiversity. Hän on kirjoittanut useita suurelle yleisölle suunnattuja kirjoja ja puhuu tieteen uudelleen järjestymisestä uusien haasteiden edessä. Hän on perehtynyt laajasti mahdollisuuksiin toimia mikrobien kanssa niin maa- ja metsätaloudessa, kuin kaupunkiympäristössä. Maisema-arkkitehti Varpu Mikola Nomaji maisema-arkkitehdit Oy:stä pyrkii löytämään innovatiivisia, ekologisia tapoja suunnitella ja ajatella kaupunkiympäristöä. Mikola on tehnyt mm. Kalasatamaan tulevan Grün in der Mitte -kaupunkikorttelin vihersuunnittelun, joka sisältää mikrometsän. Luonnonvarakeskuksen (LUKE) johtava tutkija Aki Sinkkonen tähtää työssään globaalisti merkittävien haasteiden ratkaisuun. Hän vetää hankkeita, joissa tavoitteena on kaupunkien viheralueiden laadun parantaminen ja mikrobiyhteisöjen huomioiminen ihmisten terveyden edistäjinä. Hänen osaamisalaansa on myös elinympäristön pilaantumisen ekologia ja puhdistaminen kasvien ja mikrobien avulla. Kuvataiteilija Visa Suonpää vetää Erillään katoamme hanketta yhdessä kuvataiteilija Nina Rantalan kanssa. Hanke pohjaa heidän kokemukseensa regeneratiivisista viljelymetodeista, joilla he luovat siltaa vanhojen metsien ja köyhtyneen kaupunkimaaperän välille. Taiteilijat työskentelivät kevään 2023 Pariisissa tutustuen laajasti kaupungin vehreyttämisohjelmaan. Suonpää tunnetaan taiteilijaduo IC-98:n toisena jäsenenä. Monialainen Erillään katoamme -hanke tähtää maaperän tunnustamiseen aktiivisena, elävänä entiteettinä. Sen toimintaan kuuluu osallistava, yhteisöllinen toiminta, joka pyrkii luomaan ja vahvistamaan huolenpidon kulttuuria ja kanssatoimimista yhdessä maaperän kanssa. Lämpimästi tervetuloa, Nina Rantala ja Erillään katoamme -tiimi -- Nina Rantala Visual Artist MA +358 50 30 42 924 ninarantalastudio(a)gmail.com<mailto:ninarantalastudio@gmail.com> www.ninarantala.com<http://www.ninarantala.com> Instagram @tukanaltatuulee<https://www.instagram.com/tukanaltatuulee/?hl=fi> @apartweshallperish<https://www.instagram.com/apartweshallperish/> Current projects: Erillään katoamme / Apart we shall perish, Project about importance of soil microbes, @apartweshallperish, FI / FRA Communal public artwork Luonnonmaa familyhouse, Naantali, FI Sensoryrooms, Tyks Compass Hospital, Turku, FI

1 0

Jump to page:

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

2003

Biolaitos