histoni November 2008

histoni@lists.oulu.fi

22 participants
64 discussions

Pro gradu projects
by Inari Kursula 24 Nov '08

24 Nov '08

Pro gradu projects There are projects available for 1-2 M. Sc. thesis students in the group of Inari Kursula at the Department of Biochemistry, University of Oulu. My research group is interested in how proteins recognize and bind to each other and how various processes in the cell, in particular within the cytoskeleton, are regulated. Structure determination using X-ray crystallography in order to see and understand the atomic details of proteins and their interactions is our main goal, but complementary biophysical and biochemical methods are being used to characterize the proteins of interest and their complexes. In particular, we are studying proteins participating in the regulation of actin filament dynamics in parasites, such as the apicomplexan malaria-causing species Plasmodium. Malaria is one of the largest world-wide health threats. Plasmodium use their actin filament cytoskeleton for both motility and host cell recognition and invasion. The cytoskeleton of Apicomplexa displays drastic differences to that of higher eukaryotes and is, therefore, an attractive target for anti- malarial research. We have recently determined the structure of profilin from Plasmodium falciparum [Kursula, I. et al. (2008) Structure, 16: 1638-1648]. This structure reveals striking differences to all other profilins, including the mammalian ones, and serves as a starting point in understanding how actin filament dynamics in these parasites are regulated. Our current work is focusing on the characterization of the interactions between Plasmodium profilin, actin, and formins, as well as actin depolymerizing factors from these parasites. Please contact me for further details about possible projects! Inari Kursula office: BK324 e-mail: inari.kursula(a)oulu.fi ------------------------------------------------------------ Inari Kursula, Ph. D. Department of Biochemistry University of Oulu Finland http://www.biochem.oulu.fi/tutkimus/ikursula/ http://cc.oulu.fi/~inkursul/ ------------------------------------------------------------

1 0

FW: [Bco] Väitöskirjatyöntekijän paikka arkeologisessa genetiikassa
by Tuomo Glumoff 24 Nov '08

24 Nov '08

-----Original Message----- From: bco-bounces(a)lists.oulu.fi [mailto:bco-bounces@lists.oulu.fi] On Behalf Of Anita Tienhaara Sent: 24. marraskuuta 2008 13:41 To: FinBioNet(a)sender-01.it.helsinki.fi Subject: [Bco] Väitöskirjatyöntekijän paikka arkeologisessa genetiikassa Väitöskirjatyöntekijän paikka arkeologisessa genetiikassa vuosille 2009-2012 Suomen Akatemian rahoittamassa, arkeologisen genetiikan alaan kuuluvassa tutkimushankkeessa FINNISH ARCHAEOGENETICS: Genetic ancestries and breeding strategies of Finnish indigenous cattle and sheep and their utilization in South-Western Finland on paikka väitöskirjatyöntekijälle vuosille 2009-2012. Arkeologiset ja historialliset aineistot naudan ja lampaiden luista, kuiduista ja nahkanäytteistä tarjoavat mahdollisuuden tutkia genetiikan menetelmin kotieläinten historiaa ja hyödyntämistä. Tässä monitieteisessä tutkimushankkeessa tarkastellaan naudan ja lampaan esihistoriaa Lounais-Suomessa muinais-DNA- analyysein. Muinais-DNA eristetään pääasiallisesti luu- ja hammasnäytteistä. Tutkimusta koordinoi MTT (Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus) ja siinä tehdään yhteistyötä Turun yliopiston arkeologian laitoksen ja Tukholman yliopiston arkeologisen tutkimuslaboratorion kanssa. Väitöskirjatyöntekijä työskentelee pääosin MTT:n Biotekniikka-ja elintarviketutkimuksen yksikössä Jokioisilla, mutta laboratorioanalyysejä tehdään myös muissa yhteistyölaboratorioissa, mahdollisesti muun muassa Tukholman yliopistossa, muinais-DNA-analyysien luonteen vuoksi. Työn voi aloittaa vuoden 2009 alussa. Väitöskirjatyöntekijältä edellytetään soveltuvaa korkeakoulututkintoa, vahvaa osaamista molekyyligenetiikan tutkimusmenetelmistä ja molekyyli- ja populaatiogenetiikan perusteiden hallintaa sekä kiinnostusta ratkaista monitieteisen tutkimushankeen tutkimushaasteita. Lisätietoja hankkeen vastuullinen johtaja, erikoistutkija Juha Kantanen, juha.kantanen(a)mtt.fi , puhelin 040 350 9633. Hakemukset palkkatoivomuksineen 5.12.2008 mennessä osoitteella: johtaja Eeva-Liisa Ryhänen, MTT, kirjaamo, 31600 Jokioinen. Hakemuksia ei palauteta. ---------------------------------------- This message was sent to you by FinBioNet Anita Tienhaara Institute of Biotechnology P.O.Box 56 (Viikinkaari 9) FIN-00014 University of Helsinki, Finland tel +358-9-191 59656 fax +358-9-191 59550 email anita.tienhaara(a)helsinki.fi www.finbionet.fi

1 0

Inventaariota la 29.11., ilmoittautuminen
by Susanna Teppo 24 Nov '08

24 Nov '08

Hellou Jotta mahdollinen kevät-excumme olisi turvattu, osallistumme inventaarioon ensi lauantaina klo 13 eteenpäin Kellon S-marketissa. Lähdeppä siis tekemään kivaa työtä itsesi ja muiden histonien hyväksi. Homma kestää 18-19 saakka riippuen väkimäärästä. Inventaarin jälkeen mennään pizzalle, Histoni maksaa osan kuluista! Ilmoittautua voi minulle mielellään pian ja viimeistään torstain aikana. Kyyditys perille. Tarvittaessa Histoni maksaa kimppakyydittäjän bensakulut. Paikalle on matkaa n. 15km. -Susanna

2 1

Next event for international student info
by Lloyd Ruddock 21 Nov '08

21 Nov '08

Hi, do you wish to know -how is your right to work with a student status in Finland, -how you can renew your residence permit and if a graduate can apply for one, -how is your right to drive a car in Finland and for how long you can use a licence from your country, -how you can apply for a personal identity number? Police and Register Office promised to answer these and your other questions next Thursday, 27.11. at 15-17.00. The info is located in the Oulu city center, in the Oulu University of Applied Sciences Rector's office, Albertinkuja 20, Auditorium 221, 2nd floor. You can find the location on the map here http://kartta.ouka.fi/web/Default.aspx?layers=Opaskartta&cp=13268,69520&z=2& title=OAMK%3B%20Rehtorin%20toimisto&language=fin Info Events are organised for the international students by the project Promoting the Higher Education Institutions of Oulu Internationally. It is EU-funded project lasting 1.3.2008-31.7.2009.

1 0

New courses
by Lloyd Ruddock 19 Nov '08

19 Nov '08

Dear all, There are two new MSc level courses that have recently started that there seems to be some confusion about. 1) Orientation to Research Work. The new Orientation to research work course (12-20 credits or 12-18 credits for international MSc) in part replaces the old course Laboratory practice II in the new system. Students undertake a combination of Laboratory practice II (or equivalent) and/or periods of research work in research group(s). As well as gaining experience of the practical work required to undertake research, this course is also designed to allow students to make an informed decision about the right place to do a Pro Gradu project i.e. students are advised to do one month in the lab they are thinking about doing the Pro Gradu in as part of Orientation to research work. There is no set timetable for the research work and the students can do the work in any research group and are advised to spend at least 1 month in a group outside the department. Groups are free to advertise their projects for example via Histoni´s email list. When doing work in a research group, each student will make direct contact with the group leader and a mutual agreement made for the research period. A full-time working week (40 hours) gives 1.5 credits for the student. A maximum of 6 credits (four full-time working weeks) can be awarded for working in one research group. The research work can be either full-time or part-time. For example, working 1 day a week for 10 weeks would earn 3 credits. It is up to individual group leaders to decide if and how students should report the results e.g. a written report or a presentation. A formal report (työselostus) is not required. Any time taken by the student to prepare the report must be included in working time. After the research period the group leader is required to write a short statement on a card provided by the student, naming the subject of research, the dates over which the work was done, the number of hours worked and proposed credits to be awarded (40 hour work = 1.5 credits, op). Group leaders should be careful not to over- or under-credit the work done. Any credits should be in multiples of 0.5 credits. There is no requirement to notify the course convenor (Jari) in advance of the work It is possible also to get credits for this course by undertaking the Laboratory practice II exercises (Biokemia II exercises). These are typically 1 week in length and are an excellent way to learn new techniques. Since these require a written report one full-time working week plus written report gives 2 credits for the student. Students should sign up for these exercises in advance on the notice board. There is no grading for this course, just credits for appropriate level of work. 2) Dissertation. The new optional Dissertation course (18 credits) is a major review of the literature. The credits awarded are equivalent of 12 weeks full time work by the student. The student should make direct contact with the group leader they wish to supervise them (this can be within the department or beyond), who should be a recognised expert in the field. There are no formal requirements for style, length etc, but students and supervisors are advised to chose a style from an appropriate journal which would publish comprehensive reviews in the field. As a guide many comprehensive reviews are 15 to 30,000 words in length with 250-300 references. Students are advised that this course does not have to be done as a solid 12 week block, that the workload can be spread over an extended timeperiod and hence it makes an excellent way to balance workload over a longer period of time. Students are also advised that the dissertation requires in-depth knowledge and understanding of a subject. Furthermore, English for Biochemists II or English for Biochemists III are strongly recommended before undertaking the dissertation. Students are also advised that plagarism has been a problem with similar courses run elsewhere and that plagarism will not be tolerated in any manner. Supervisors are advised that this task should not be entered into lightly, supervising a dissertation properly will require a large amount of work in providing guidance and reading drafts of the work. Occasionally I would expect a dissertation to be sufficiently good so as to be submitted to a journal as a comprehensive review (it happens in other places with similar courses) - a nice bonus for student and supervisor. There is grading for disertations, on the 0-5 scale. Grading will be similar to that for the Pro Gradu project except that the supervisor will be one of the two examiners. A detailed marking scheme should appear on the departmental web site in the next couple of weeks. I am course convenor. My task is to provide advice in choosing a topic and/or supervisor and to help in any cases where disputes arise between student and supervisor I hope these explanations help. Best wishes, Lloyd

1 0

Sports - badminton Wed 26.11.2008 already 13-14
by Olli Niemitalo 19 Nov '08

19 Nov '08

Histoni's badminton on Wednesday 26.11.2008 is already 13-14, court 6. -olli ---------- Forwarded message ---------- From: Markku Saarela <Markku.Saarela(a)oulu.fi> Date: Wed, Nov 19, 2008 at 12:41 PM Subject: sulkisvuoro To: Olli Niemitalo <o(a)iki.fi> Hei! Ensi viikolla ke 26.11. HIS:n sulkisvuoro jo klo 13-14 (kentällä 6). Terv. Markku Saarela Liikuntasuunnittelija Oulun yliopisto Opetus- ja opiskelijapalvelut PL 8100, 90014 Oulun yliopisto puh. 08-5534029 telefax: 08-5534051 s-posti: markku.saarela(a)oulu.fi

1 0

Kiitokset Pikkujouluista !
by Jari Heikkinen 19 Nov '08

19 Nov '08

Laitoksen puolesta lausun lämpimät kiitokset Histonille työmyyrineen viihtyisistä pikkujouluista. Tila oli kodikas, kotijouluruoka erityisen monipuolista ja maittavaa sekä ohjelma mieleenpainuva. terv, jari ps. erityiskiitokset myös arpajaisten onnettarelle :) Jari Heikkinen E-Mail jari.heikkinen(a)oulu.fi Department of biochemistry Office phone +358-8-5531208 University of Oulu FAX +358-8-5531141 P.O.B 3000 Home phone +358-8-5546519 FIN-90014 UNIVERSITY OF OULU Mobile phone 0400-380535 Oulu, Finland

1 0

Vanhan tutkinnon opiskelijat
by Tuula Koret 19 Nov '08

19 Nov '08

MUISTUTUS Nyt on aika miettiä kevään opiskelijaseminaarien aikoja. Noudatamme syksyllä käyttöön otettua 2 seminaaria / kerta systeemiä. Jos aiot pitää seminaarisi keväällä 2009, ilmoita minulle mahdollisimman pian ( viimeistään 30.11. ) sinulle sopiva päivä ja mahdollinen varapäivä, niin minä järjestelen niitä niin että tuo syksyn käytäntö toteutuu. Seminaarilista vahvistetaan joulukuussa, jonka jälkeen ilmoittautumisia keväälle ei oteta vastaan. Vapaana olevia opiskelijaseminaaripäiviä. Muista 2 seminaaria / kerta. 28.1. (toinen esitys), 4.2., 11.2., 18.2., 25.2., 4.3., 11.3., 18.3., 1.4., 22.4., 29.4., 6.5., 13.5., 20.5. Aikaisemmin ilmoittautuneiden toiveet olen jo ottanut huomioon ja ilmoittelen myöhemmin tarkemmat päivät. Tuula Koret Opintoasiainsihteeri Oulun Yliopisto, Biokemian laitos PL 3000 90014 Oulun ylipoisto p. +358-(0)8-5531166 f. +358-(0)8-5531141 e. Tuula.koret (at) oulu.fi

1 0

Liikuntatiedote #22 / 18.11.2008
by Olli Niemitalo 18 Nov '08

18 Nov '08

LIIKUNTATIEDOTE N:o 22 / 18.11.2008 VUOROJEN PERUUNTUMISIA Oamk/Soten liikuntasalivuorot (bailatino, pumppi, kuntotrimmi) joudutaan perumaan ke 19.11. , kun liikuntasali on talon omassa käytössä. Pahoittelemme katkosta ja ennen kaikkea myöhäistä tiedotusta. Oamk/Liiken jumppavuoro (Flow Motion) on peruttu to 4.12., jolloin liikuntasali on talon omassa käytössä. SULKAPALLOKISAT Sulkapallokisat yliopistolaisille ja Oamkin opiskelijoille Linnanmaan liikuntahallilla (Virkakatu 1) ke 3.12. (kaksinpelit) ja to 4.12. (nelinpelit) iltapäivällä. Sarjat: miehet harr.sarja ja kilpasarja (luokkapelaajat), naiset harr.sarja ja kilpasarja, nelinpelit. Ilmoitt. liik.suunnittelijalle, e-mail: markku.saarela(a)oulu.fi tai puh. 5534029 viim. to 27.11. Osall.maksu (palloraha) 4 euroa maksetaan paikalla. (Sporttipassia ei tarvita.). Mitalit sarjojen kolmelle parhaalle. KEVÄTKAUDEN SPINNING ("kuntopyörä-aerobic") Kevätkauden spinningtunnit ajalla 13.1.-12.5.2009 tiistaisin klo 19-20 Kuntokeskus SATS Caritaksessa ( Kapellimestarinkatu 4, 90150 Oulu, puh. 0103099390). Tunnin ohjauksesta vastaavat SATSin ohjaajat ja tunti rakentuu SATS cycling-tuntien mukaisesti. Kevätkauden kortti sporttipassilla (18 krt) vain 40 euroa (vain 2,20 euroa / kerta) ja ilman sporttipassia 50 euroa. Kortteja riittää 36 ensimmäiselle ja sen voi ostaa ma 1.12. alkaen klo 9-15 opiskelija-palveluista Linnanmaalta käteisellä/pankkikortilla tai Mukon (Maunonkatu 2) virastomestarilta käteisellä. Opiskelija- tai henkilökuntakortti esitettävä maksettaessa. Kortti lainattavissa / siirrettävissä yliopistolaiselle / Oamkilaiselle. UUSI HIERONTASOPIMUS Uusi edullinen hierontayhteistyötarjous sporttipassille. Oulun korkeakoululiikunta ja Oulun hieroja-akatemia ovat tehneet sopparin sporttipassialennetuista hierontapalveluista. Tutustu tarkemmin sisältöön osoitteessa www.oulunkorkeakoululiikunta.fi. Markku Saarela Liikuntasuunnittelija puh. 5534029, 044-7881670 markku.saarela(a)oulu.fi

1 0

Gradujen otsikot
by Tuula Koret 18 Nov '08

18 Nov '08

Jos gradusi otsikko on suomeksi lähetä minulle myös englannin kielinen otsikko Oodia varten. Tuula Koret Opintoasiainsihteeri Oulun Yliopisto, Biokemian laitos PL 3000 90014 Oulun ylipoisto p. +358-(0)8-5531166 f. +358-(0)8-5531141 e. Tuula.koret (at) oulu.fi

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

histoni November 2008