Biolaitos

biolaitos@lists.oulu.fi

10 participants
4520 discussions

REMINDER Biology Thursday seminar TODAY ON SITE Prof. Teppo Hiltunen on Experimental microbial ecology and evolution
by Heikki Helanterä 30 Mar '23

30 Mar '23

Dear colleagues, remember today's Biology Thursday seminar: on site, 30th March, at 12:15 in the room AT115A. Our speaker is Prof. Teppo Hiltunen from the University of Turku, on "Experimental microbial ecology and evolution". Teppo is a professor of genetics and physiology at the Department of Biology in Turku, and a PI at the Multidisciplinary Center of Excellence in Antimicrobial Resistance Research. He works at the interface of ecology and evolution, e.g. on how ecological species interactions affect evolution in experimental microbial systems, and their implications all the way to ecosystem processes and matters of practical urgency such as the evolution of antibiotic resistance. More on his research at: https://www.utu.fi/en/people/teppo-hiltunen See you soon, Heikki =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358-40-7507 334 =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358-40-7507 334

1 0

Fwd: Permanent Lab Tech Position
by Jouni Aspi 27 Mar '23

27 Mar '23

Fyi. ________________________________ Kohteesta: Love Dalén <love.dalen(a)zoologi.su.se> Lähetetty: maanantaina 27. maaliskuuta 2023 klo 14.07 Vastaanottaja: Love Dalén <love.dalen(a)zoologi.su.se> Aihe: Permanent Lab Tech Position Dear colleagues, We are hiring a laboratory technician for a permanent position at the Centre for Palaeogenetics in Stockholm. If you know of any suitable candidates looking for this kind of job, it would highly appreciated if you can forward them this email. Please note that the deadline is on March 31st, so only a few days from now. The link to advertisement and application system is here: https://www.su.se/english/about-the-university/work-at-su/available-jobs?rm… --------------------------- On a related note, we also have several other open positions at CPG (multiple postdocs, a PhD student, bioinformatician etc). In case you know of any suitable candidates for these kinds of postions, links to all the the ads are here: https://palaeogenetics.com/opportunities/ --------------------------- With kind regards, Love Dalén

1 0

Biology Thursday seminar 30.3. Prof. Teppo Hiltunen on Experimental microbial ecology and evolution
by Heikki Helanterä 27 Mar '23

27 Mar '23

Dear colleagues, Biology Thursday seminar continues on site on 30th March, at 12:15 in the room AT115A. Our speaker is Prof. Teppo Hiltunen from the University of Turku, on "Experimental microbial ecology and evolution". Teppo is a professor of genetics and physiology at the Department of Biology in Turku, and a PI at the Multidisciplinary Center of Excellence in Antimicrobial Resistance Research. He works at the interface of ecology and evolution, e.g. on how ecological species interactions affect evolution in experimental microbial systems, and their implications all the way to ecosystem processes and matters of practical urgency such as the evolution of antibiotic resistance. More on is research at: https://www.utu.fi/en/people/teppo-hiltunen See you on Thursday, Heikki =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358-40-7507 334

1 0

Maisteriseminaari 29.3. / Master's seminar 29.3.
by Veli-Matti Pakanen 27 Mar '23

27 Mar '23

Heippa, Seuraava maisteriseminaari on 29.3. Muistakaa kirjautua zoomiin omalla nimellä. Suoritusta ei voida kirjata muuten. Hello, The next master’s seminar will be on 29.3. Remember to use your name in zoom. https://oulu.zoom.us/j/64668752013 Time Speaker Title Opponent Plan/ Result Professor Supervisors 14.15 Emma Koskinen Ravinnepitoisuuksien nousun vaikutukset tuottavuuteen arktisissa jokiekosysteemeissä Milla Niiranen Results Annu Ruotsalainen Kaisa-Leena Huttunen, Kaisa-Riikka Mustonen 15:00 Milla Niiranen Lumipeitteen paksuuden ja poron laidunnuksen vaikutus boreaalisen suon hiilenkiertoon. Emma Koskinen Results Timo Muotka Maria Väisänen, Noora Kantola

1 0

Gradupaikkaseminaarin esitykset /Presentations from the Master thesis subject seminar
by Veli-Matti Pakanen 24 Mar '23

24 Mar '23

[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png] Heikki Helanterä_MScProjecTopicsMar23(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…> [https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Marko Mutanen_graduaiheet(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…>[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Emma Vatka_Tit_studies_project_work_2023(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…>[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Heli Jutila_ plankton etc.(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…>[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Sari Luste_Eurofins(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…>[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Ralf Wistbacka_Flying squirrel_gulls etc.(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…>[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Veli-Mat… Pakanen_Waders and ticks(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…>[https://res.cdn.office.net/assets/mail/file-icon/png/pdf_16x16.png]Vojtech Kubelka _ Volunteer shorebird fieldwork opportunity in Finland 2023(1).pdf<https://unioulu-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/vpakanen_univ_yo_oulu_fi/E…> Heippa kaikille, Meillä oli keskiviikkona mielenkiintoinen gradupaikkaseminaari. Tässä linkit esityksiin. Tutustukaa ja lähetä esittäjille kysymyksiä, jos aiheet kiinnostavat. Heidän yhteistietonsa ovat esillä myös alla. Hello everyone, We had an interesting master thesis subject seminar on wednesday. Here are links to the presentations. Have a look and send further questions to the presenters if the subjects seem interesting. Their contact details are listed below. Hyvää viikonloppua / good weekend to everyone! Vellu Time table for presentations 14:15-14:25 Marko Mutanen Oulun yliopisto Marko.mutanen(a)oulu.fi 14:25-14:35 Heikki Helanterä Oulun yliopisto Heikki.helantera(a)oulu.fi 14:35-14:45 Sari Luste Eurofins Ahma Oy SariLuste(a)eurofins.fi 15:45-14:55 Emma Vatka Oulun yliopisto emma.vatka(a)oulu.fi 14:55-15:05 Anu Eskelinen Oulun yliopisto Anu.eskelinen(a)oulu.fi 15:05-15:15 Ralf Wistbacka Oulun yliopisto ralf(a)wbe.fi 15:15-15:25 Veli-Matti Pakanen Oulun yliopisto veli-matti.pakanen(a)oulu.fi 15:25-15:35 Heli Jutila Pohjanmaan vesi ja ympäristö heli.jutila(a)pvy.fi 15:35-15:45 15:45-15:55

1 0

VL: JTF-hakujen aikataulu - ilmoita investointihankkeet 10.4.2023 mennessä
by Jouni Aspi 24 Mar '23

24 Mar '23

Tiedoksi Jouni Lähettäjä: Päivi Tomperi <Paivi.Tomperi(a)oulu.fi> Lähetetty: perjantai 24. maaliskuuta 2023 8.35 JTF-hakujen aikataulu - ilmoita investointihankkeet JTF-hakujen avautuminen viivästyy näillä näkymin huhtikuun loppuun. Haku tulee olemaan jatkuva ja rahoittajilla tulee olemaan vuoden 2023 aikana kolme käsittelyynottopäivää, joista ensimmäinen on tämänhetkisen tiedon mukaan 12.5. JTF-haussa haettavat yliopiston investointi-/tutkimusinfra-/tutkimuslaitteistohankkeet on ilmoitettava webropol-lomakkeella <https://link.webropol.com/s/JTFinvestoinnit> 10.4. mennessä yliopiston omarahoitukseen liittyvän vastinrahoituksen kartoittamista varten. Lisätietoja investointien vastinrahoitustilanteesta toimitetaan hankevalmistelijoille viikolla 16 (17.4. - ). * Jos hankkeessa on mukana sekä kehittämis- että investointiosio, on pääsääntöisesti rahoitusta haettava rinnakkaisilla EURA-hakemuksilla: kehittämisosio haetaan pääsääntöisesti flat rate 40-kustannusmallilla ja investointiosio flat rate 1,5 -kustannusmallilla. Hakemuksissa on tuotava selkeästi esille, että hakemukset ovat rinnakkaisia toisilleen ja toteutus kytkeytyy toisiinsa (myös hakemusnumerot ilmaistava). Tällaisissa tapauksissa hankkeen investointiosio on ilmoitettava ym. webropol<https://link.webropol.com/s/JTFinvestoinnit>-lomakkeella 10.4. mennessä. Hakemuksia voi valmistella ennakoivasti jo nyt. Hakulomake valmistuu vasta 21.4. Yliopiston aikataulu: * viimeistään 10.4. toimitetaan webropol <https://link.webropol.com/s/JTFinvestoinnit> -lomakkeella tiedot kaikista JTF-hakuun suunnattavista investointi-/tutkimusinfra-hakemuksista yliopiston omarahoitukseen liittyvän vastinrahoituksen kartoittamista varten * JTF-haku avautunee EURAssa 21.4., jolloin hakemuksen pääsee avaamaan ja tietoja syöttämään * JTF-hakuun jätettävät hakemukset priorisoidaan rahoittajan pyynnöstä. Priorisointi tehdään ensin tiedekunnissa ja sitten yliopiston arviointiryhmän toimesta. * priorisointia varten varsinaiset EURA-hakemukset toimitetaan 2.5. mennessä pdf:nä osoitteeseen rakennerahastot(a)oulu.fi<mailto:rakennerahastot@oulu.fi>. Syksyn käsittelyyn ottopäiviin jätettävät hakemukset priorisoidaan myöhemmin tiedotettavan aikataulun mukaisesti lähellä käsittelyynottopäiviä (31.8. ja 30.11.). * kaikki yliopiston EURA-hakemukset allekirjoittaa Emma Pirilä päivää ennen DL:a. OIA-ohjelmiin kytkeytyvien JTF-hakemusten aikatauluista on tiedotettu hankevalmistelijoita erikseen. Hankekorttien DL on 10.4. Lisätietoja saa Johanna Ekiltä. terveisin Päivi

1 0

Yksilölliset opintojärjestely, huomioitavaa
by Minna Vanhatalo 23 Mar '23

23 Mar '23

Edelleenvälitetty viesti. terv. Minna Huomioitavaa yksilöllisiä opintojärjestelyjä käsiteltäessä * Koulutuspalvelut/koulutuksen lähipalvelut/tiedekuntien työntekijät eivät saa kerätä eivätkä tallentaa tietoja opiskelijoiden yksilöllistä opintojärjestelyistä mihinkään. * Mikäli koulutuspalveluissa/koulutuksen lähipalveluissa/tiedekuntien työntekijöillä on listoja opiskelijoiden yksilöllisistä järjestelyistä opintojen aikana, tulee ne tuhota viipymättä. Yksilöllisten opintojärjestelyiden prosessin kuvaus Yliopiston velvollisuus on tarjota opiskelijalle erilaisia tukitoimia opiskeluun<https://www.oulu.fi/fi/opiskelijalle/opiskelun-tuki-ja-yhteystiedot-opiskel…>, jos hänen terveydentilansa näin edellyttää. Opiskelijalla on mahdollisuus saada suositus yksilöllisistä opintojärjestelyistä yliopiston opintopsykologilta avoimelta vastaanottoajalta. Saadakseen suosituksen, opiskelijalla tulee olla tarvittavat todistukset esim. lääkärintodistus, jonka hän näyttää opintopsykologille. Terveydentilaa ei siis arvioida yliopistossa vaan suositus tehdään ulkopuolisen asiantuntijan lausunnon pohjalta. Opintopsykologi laatii opiskelijalle suosituksen yksilöllisistä opintojärjestelyistä. Suositukset tallennetaan opintopsykologien omiin järjestelmiin. * Kun opiskelija tarvitsee tukitoimia opintojaksolla, hän lähtökohtaisesti näyttää suositusta opettajalle kasvotusten tai esim. videopuhelun kautta. Jos tämä ei ole mahdollista, opiskelija voi lähettää suosituksen käyttämällä yliopiston turvasähköpostia <https://ict.oulu.fi/16813/#send_from> ("kirjattu kirje"). Vastaanottaja ei saa tallentaa suositusta mihinkään. Turvasähköposti tuhoutuu automaattisesti 30 vuorokauden kuluttua. * Kun opiskelija on näyttänyt suosituksen opettajalle, he sopivat yhdessä yksilöllisten järjestelyjen toteuttamisesta opintojaksolla. Opiskelija ei välttämättä tarvitse tukitoimia kaikilla kursseilla, vaan hän ottaa asian esille silloin, kun hän tarvitsee niitä. * Opiskelijan suostumuksella opettaja voi pyytää opintopsykologilta vahvistuksen, että opiskelijalle on laadittu suositus. Vesa-Matti Sarenius johtaja Koulutuspalvelut

1 0

Ei yksikköpalaveria huomenna (Pe 24.3) / No unit meeting tomorrow (Fri 24.3)
by Jouni Aspi 23 Mar '23

23 Mar '23

Ei siis yksikköpalaveria koska huomenna on Emmin väitös (https://www.oulu.fi/fi/vaitokset/mannyn-pinus-sylvestris-l-sopeutumisen-aik…). Not unit meeting because tomorrow is Emmi's dissertation (https://www.oulu.fi/en/theses/variation-gene-expression-and-dna-methylation…) Jouni

1 0

Biology Thursday seminar 23rd March: Carl Gunnar Fossdal on plant epigenetics
by Heikki Helanterä 23 Mar '23

23 Mar '23

Dear colleagues, Biology Thursday seminar will continue this week with an on-site seminar by Prof. Carl Gunnar Fossdal from the Norwegian Institute of Bioeconomy Research NIBIO, on "Epigenetic memory of the temperature conditions in Norway spruce and Woodland strawberry" (abstract below). The seminar will take place in room MA335, at 12:15 on 23rd March and will be hosted by Emmi Alakärppä. For more on Prof. Fossdal's research, see: https://www.nibio.no/en/employees/carl-gunnar-fossdal See you in the seminar, Heikki Epigenetic memory induced by elevated temperature conditions in the Gymnosperm Norway spruce and the Angiosperm Woodland strawberry Igor Yakovlev1, Yupeng Zhang1, Marcos Viejo Somoano2, Paal Krokene1, Paul Grini4, Jorunn Elisabeth Olsen3, Carl Gunnar Fossdal1 1 Norwegian Institute of Bioeconomy Research (NIBIO), Department of Plant Molecular Biology, Ås, NORWAY 2University of Santiago de Compostela, Department of Functional Biology, SPAIN 3Norwegian University of Life Sciences, Faculty of Biosciences, Ås, NORWAY 4Norwegian Food Research Institute, Department of Breeding and genetics, Ås, NORWAY 4. EVOGENE, Department of Biosciences University of Oslo, Norway Elevated temperature sum during asexual and sexual propagation induce a lasting impact on the phenotype resulting in the formation of epitypes (i.e genetically alike but phenotypically different plants) in the gymnosperm Norway spruce and angiosperm Woodland strawberry. To understand how epigenetic mechanisms may shape phenotypic variation we probed if epigenetic memory involves stable DNA methylation marks (i.e. epitype differences) changes through the annual cycle. Well-defined clonal epitypes with a stable epigenetic memory of the temperature sum experienced during embryogenesis were used. In these, the epigenetic memory is retained year after year and affects the timing of bud set, frost tolerance and bud burst significantly between epitypes. The DNA methylation pattern differences in the two epitypes over the annual cycle was studied. There were large methylation differences for specific genes, indicating specific epigenetic mark changes. Some genes were stably differential methylated for months. Two ARGONAUTE-like genes were differentially methylated between epitypes throughout entire yearly cycle in an epitype specific manner. The differences between Norway spruce epitypes is also associated with significant transcriptional change, including differentially expression of small RNAs. Similarly, we observed indications of an epigenetic memory response to temperature change during reproduction in five Woodland strawberry ecotypes (observed as altered flowering time, stolon production and petiole length under common garden conditions), this response was detected in some of the ecotypes studied. However, significant methylome and transcriptome changes were induced by temperature conditions during asexual reproduction in Woodland strawberry for all ecotypes. =============================================== Heikki Helanterä Professor Ekologian ja genetiikan tutkimusyksikkö / Ecology and Genetics Research Unit Oulun Yliopisto / University of Oulu / Finland heikki.helantera(a)oulu.fi<mailto:heikki.helantera@oulu.fi> +358-40-7507 334

1 1

Kari Taulavuori menehtynyt /Kari Taulavuori deceased
by Jouni Aspi 20 Mar '23

20 Mar '23

Hei kaikki / Dear all Erja Taulavuori ilmoitti minulle tänään, että pitkäaikainen työyhteisömme jäsen Kari Taulavuori on menehtynyt äkillisesti 10. maaliskuuta. Yksikön ja tiedekunnan surunvalittelut on lähetetty omaisilla. Erja Taulavuori announced me today that our former long term staff member Kari Taulavuori has deceased on 10th of March. Our condolences has been sent to the relatives Jouni

1 0

Jump to page:

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

2003

Biolaitos