Crc March 2020

crc@lists.oulu.fi

13 participants
71 discussions

FW: FICAN North cancer research collaboration afternoon 28.4.2020
by Katja Riipinen 09 Mar '20

09 Mar '20

Tiedoksi From: Koivunen Jussi <Jussi.Koivunen(a)ppshp.fi> Sent: maanantai 9. maaliskuuta 2020 14.40 To: Katja Riipinen <katja.riipinen(a)oulu.fi> Subject: VL: FICAN North cancer research collaboration afternoon 28.4.2020 Olemme järjestämässä syöpätutkimuksen yhteistyöiltapäivää 28.4.20 klo 13-16, paikkana OYS/TesLab. Tavoitteena lisätä tutkimusyhteistyötä ja sen mahdollisuuksia alueellamme. We are organizing a cancer research collaboration afternoon at OYS/TestLab 28.4.20 1-4 pm. The goal of the meeting is to increase collaboration and cancer research possibilities in the area. Ilmoittautuminen/registration: https://link.webropolsurveys.com/S/5AD2FFE607EE6728 [FICAN NORTH-logo] FICAN North cancer research collaboration day 28.4.2020 OYS TestLab 12:30-13:00 Coffee and registration 13:00-13:10 Welcome - Dean of Education, Prof Riitta Kaarteenaho, University of Oulu - Manager, Testing and Innovations, Timo Alalääkkölä, OYS TestLab - Consultant Jussi Koivunen, PPSHP/oncology, FICAN North 13:10-13:30 Survey to cancer researcher at FICAN North, results - Dean of Education, Prof Riitta Kaarteenaho, University of Oulu - Manager of research services Minna Mäkiniemi, PPSHP 13:30-14:15 Clinical perspectives on future of cancer research - Consultant Jussi Koivunen, PPSHP/oncology, FICAN North - Prof Markus Mäkinen, University of Oulu/Pathology - Prof Juha Saarnio, PPSHP/gastrointestinal surgery 14:15-14:30 Coffee 14:30-15:15 Future of basic cancer research - Group Leader Katri Pylkäs, University of Oulu - Prof Aki Manninen, University of Oulu - Project Manager Pia Nyberg, Biobank Borealis 15:15-15:45 Collaboration with medical industry - MSD - Roche 15:45-16:00 Closing

1 0

Reminder: FinGMice RoadShow in Oulu 13.3.2020 klo 12-
by Mirja Peltola 09 Mar '20

09 Mar '20

[cid:image003.jpg@01D5F61F.AE41E1F0] a network within Finnish universities providing services and expertise in generation and analysis of genetically modified mice Organizes: Tips and tricks for successful in vivo modelling https://www.oulu.fi/sites/default/files/content/FinGMice.pdf March 13, 2020, in H1091 (Dentopolis) 12:00 Welcome and General overview of the FinGMice network Reetta Hinttala, University of Oulu 12:20 FinnDisMice, mouse models for Finnish Disease Heritage Satu Kuure, University of Helsinki 12:40 Phenotyping services offered by Turku Center for Disease modelling (TCDM) Petra Sipilä, University of Turku 13:00 Finnish Centre for Laboratory Animal Pathology (FCLAP) Jere Linden, University of Helsinki 13:20 Discussion 13:30 Coffee break sponsored by ImmunoDiagnostic Oy 14:00 Non-mammalian model organisms in research Prof. Howy Jacobs, University of Tampere 14:30 Discussion 14:40 Neurophenotyping services Prof. Heikki Tanila, University of Eastern Finland 15:00 Mouse imaging: from light microscopy to ultrastructural details Mika Kaakinen, University of Oulu 15:20 Transmembrane prolyl 4-hydroxylase, an enzyme of unknown function - what have we learned from a mouse model? Prof. Johanna Myllyharju, University of Oulu 15:50 Discussion 16:00 Closing Supported by the Health and Biosciences Doctoral Programme of the University of Oulu Field specific credits can be earned according to UniOGS recommendations (attending to 10 scientific seminars: 0,5ECTS) (https://www.oulu.fi/uniogs/recommendations_of_ects) Feel free to distribute this announcement further. WELCOME! Kind regards, Reetta Reetta Hinttala, Associate Prof, coordinator Finnish EMMA node, Transgenic core facility, Biocenter Oulu PEDEGO, Pediatric neurology, Faculty of Medicine University of Oulu Finland reetta.hinttala(a)oulu.fi<mailto:reetta.hinttala@oulu.fi>

1 0

FW: Kontinkangas Seminar on Thursday 12.3. at 15.00 in H1091
by Katja Riipinen 09 Mar '20

09 Mar '20

Tiedoksi From: Pirkko Huhtala <pirkko.huhtala(a)oulu.fi> Sent: maanantai 9. maaliskuuta 2020 8.56 To: fbmm(a)lists.oulu.fi; ltk-all <ltk-all(a)oulu.fi>; 'bco-staff(a)lists.oulu.fi' <bco-staff(a)lists.oulu.fi> Cc: Mirjami Jutila <Mirjami.Jutila(a)oulu.fi>; Tuire Salonurmi <Tuire.Salonurmi(a)oulu.fi> Subject: Kontinkangas Seminar on Thursday 12.3. at 15.00 in H1091 On Thursday March 12 Kontinkangas Research Seminar: The speaker is a new professor on the campus, Professor Caglar Elbuken (VTT, FMED, FBMM): "Two-phase flow microfluidics: Digital biosensing and particle synthesis". Seminar room H1091 (dentistry) 15.00-16 Coffee is served during networking session 30 min before presentation time. Welcome everybody! Information about prof. Elbuken´s previous research topic: http://unam.bilkent.edu.tr/~celbuken/ Kontinkangas Morning Seminars 8.45-9.15, coffee and networking 8.30- , Kontinkangas Tellus Stage, Aapistie 7A 26.3. Jarkko Koivunen, FBMM: High Content Imaging in Kontinkangas 2.4. Simo Saarakkala, FMED, Infotech 29.4. Sylvain Sebert, FMED: The LongITools project 13.5. Laura Huilaja, FMED, OYS: Ihotauteja pintaa syvemmältä 20.5. Reetta Hinttala, FMED: The function of Nhlrc2 in neuronal precursor cells of FINCA mice Kontinkangas Research Seminars 12.3. Professor Caglar Elbuken (VTT, FMED, FBMM): Two-phase flow microfluidics: Digital biosensing and particle synthesis". Seminar room H1091 (dentistry) 15.00-16. 23.4. BCO Day, Leena Palotie Auditorium 101A 22.5. Presentations by Honorary doctorates Professor Maiken Nedergaard, Professor Mats Paulsson and Nobel laureate Professor Sir Peter Ratcliffe, 9.30-12, Leena Palotie Auditorium 101A 28.5. Prof. Claus Storgaard Sørensen, Biotech Research & Innovation centre, University of Copenhagen, Denmark, 15.00-16, F202 12.6. Erikka Loftfield, Nutritional Epidemiology, National Cancer Institute, US, 15.00-16 15.6. Anastassios Pittas, Division of Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Tufts University, US, 15.00-16 Coffee is served during networking session 30 min before presentation time. Welcome everybody! In addition, there will be Brown Bag seminars and Storytime events (to be announced separately). Kind regards Pirkko Huhtala Pirkko Huhtala, Ph.D. Coordinator Biocenter Oulu University of Oulu Mailing address: P.O.Box 5000, FIN-90014 University of Oulu Finland Street address: 476B, Aapistie 5A, FIN-90220 Oulu Tel. sis/int. 486101, ulk./Ext. 0294 486101 Tel. +358-294 486101 e-mail pirkko.huhtala(a)oulu.fi<mailto:pirkko.huhtala@oulu.fi> www.oulu.fi/biocenter<http://www.oulu.fi/biocenter>

1 0

10x Genomics - a free educational scientific seminar on Thursday, March 19th at Kieppi 487B seminar room
by Jaana Liimatainen 05 Mar '20

05 Mar '20

Dear all, Karolinska Institutet and 10x Genomics are pleased to invite you to a free educational scientific seminar event on Thursday, March 19th at Kieppi Building, Aapistie 5A, University of Oulu. We welcome researchers with an interest in single cell (Gene Expression) analysis and spatial transcriptomics. Single cell sequencing has revolutionized life science research leading to a deeper understanding of biological processes in health and disease. Rapid technology advances are enabling large-scale projects for resolving single cell populations from 100s to millions of cells in a given study. In this seminar, we will introduce a combined workflow with optimized sample preparation and demonstrate a variety of single cell applications. Recent advances have progressed from Single Cell Genomics to encompass spatial profiling of Gene Expression. We will give a brief introduction to the latest 10X Genomics innovation from Spatial Transcriptomics all anchored with scientific examples, based on a selection of more than 500 published articles related to 10X Genomics solutions. To attend our free scientific event please register by clicking on the following link: Scientific Seminar at University of Oulu<https://sl.10xgenomics.com/t/11209/c/0bad527e-6c18-45d1-93e0-0e8e6ead032b/N…> Please feel to forward the invite to anyone that you think might benefit from our event. Let us know if you have any questions. We look forward to seeing you on March 19th in Oulu. Kind regards, Chadia Chadia Toukoki, Ph.D. Inside Sales Northern Europe chadia.toukoki(a)10xgenomics.com<mailto:chadia.toukoki@10xgenomics.com> 10x Genomics(r) Office +49 (0) 6131 6027622 Mobile +49 (0) 175 258 33 37 Crown Business Center Key Point II Office Space, Units F-07 & F-08 Schipholweg 103 If you would like to be kept up-to-date on 10x conference and new product information, as well as receive 10x-pert Workshop and User Group Meeting invitations, click here to manage your email preferences<https://sl.10xgenomics.com/t/11209/c/0bad527e-6c18-45d1-93e0-0e8e6ead032b/N…>. You can unsubscribe at any time.

1 0

Keskustelutilaisuus sote-tietojen toisiokäyttö ja osaamiskeskittymät 6.4.2020 OYS:ssa
by Katja Riipinen 04 Mar '20

04 Mar '20

Tervetuloa keskustelutilaisuuteen sote-tietojen toisiokäytöstä STM toteuttaa yhdessä yliopistokaupunkien kanssa alueellisten keskustelutilaisuuksien sarjan sote-tiedon toisiokäytöstä, tiedolla johtamisen mahdollistavasta lainsäädännöstä ja kansallisista osaamiskeskittymistä ja niiden välisestä yhteistyöstä. Tilaisuuksien tavoitteena on jakaa tietoa ja kerätä alueiden asiantuntijoiden näkemyksiä kansallisesta kehityksestä. Tilaisuuksissa käsitellään sote-tietojen tutkimus- ja kehityskäyttöä, tiedolla johtamista sekä perustettujen tai perusteilla olevien osaamiskeskittymien (genomi-, syöpä-, neuro- ja lääkekehityskeskus) ja biopankkien valmistelun etenemistä ja yhteistyön mahdollisuuksia. Tilaisuus on suunnattu kaikille asiasta kiinnostuneille. Oulun keskustelutilaisuus järjestetään maanantaina 6.4.2020 Oulun yliopistollisessa sairaalassa luentosalissa 10. Myös etäosallistuminen Skypen välityksellä on mahdollista. Tilaisuus ja tarjoilut ovat maksuttomia. Tilaisuuteen Ilmoittautuminen alla olevasta linkistä viimeistään maanantaina 30.3. https://link.webropolsurveys.com/S/01A4E48CA7D3B291 Toisiokäyttö 9.00 Aamukahvi 9.30 Tilaisuuden avaus - Jukka Lähesmaa, STM ja Miia Turpeinen, OYS 9.35 Yksilöllistetty lääketiede - kokonaisuus - Tuula Helander, STM 9.50 Toisiolaki ja kansallinen toimeenpano - Jukka Lähesmaa ja Juhana Valo, STM ja Antti Piirainen, Findata 9.55 Keskustelua 10.30 Alueen näkökulma toisiokäyttöön Tietosuoja- Anttoni Lehto ja Kaisa Mutenia, OYS Tietohallinnon näkökulma - Marko Pylkkänen, OYS Tutkimus ja aineistopalvelut - Minna Mäkiniemi ja Nita Mäenpää, OYS Opetus - Terhi Nevala, OYS 11.30-12.15 Lounas 12.15 Yksilöllistetty lääketiede - kokonaisuus - Tuula Helander, STM 12.35 Neurokeskus - Kari Majamaa ja Anne Remes, OY ja OYS 13.00 FICAN North - Jussi Koivunen, OYS 13.25 Geneettisen tiedon hyödyntäminen - Jukka Moilanen, OYS 13.50 Biopankki Borealis - Raisa Serpi, OYS 14.15-14.35 Kahvitauko 14.35 Profilaatio digitaalisen terveyden teemassa - Simo Saarakkala, OY 15.00 Digi-HTA: digitaalisten ratkaisujen arviointi ja suositukset - Jarmo Reponen, OY 15.25 HyteAiro: Digitaalisen terveysdatan käytännöt ja kansallisen analytiikkaosaamisverkoston perustaminen - Satu Väinämö, OY 15.50 Keskustelua 16.00 Tilaisuuden päätös * Lue lisää sosiaali- ja terveystietojen toissijaisesta käytöstä<https://stm.fi/sote-tiedon-hyodyntaminen> * Lue lisää kansallisista osaamiskeskittymistä<https://stm.fi/yksilollistetty-laaketiede> Lisätietoja: Minna Mäkiniemi Tutkimuspalvelupäällikkö, FT Tutkimuspalvelut N5 132 Oulun yliopistollinen sairaala Puh. 08 315 5181 / 040 773 1529 [cid:image002.jpg@01D57F5A.1062C3F0]

1 0

Quest lecture tomorrow March 5 - "Deep Learning for OA imaging" by Dr. Valentina Pedoia
by Katja Riipinen 04 Mar '20

04 Mar '20

FYI: On the 5th of March 2020 (Thursday), Assistant professor Valentina Pedoia from the University of California San Francisco will give a presentation "Deep Learning for OA imaging". Time: 5.3.2020 at 13:30 Location: Lecture room P117, Kontinkangas Campus Valentina Pedoia, PhD is an Assistant Professor in the Radiology and Biomedical Imaging Department at the University of California San Francisco (UCSF). Her main research interest in developing algorithms for advanced computer vision and machine learning with the aim of improving the usage of non-invasive imaging as diagnostic and prognostic tools.Her research focus is on exploring the role of deep learning and multidimensional data analysis in the extraction of contributors to osteoarthritis (OA), by studying analytics to model the complex interactions between morphological, biochemical and biomechanical aspects of the knee joint as a whole; deep learning convolutional neural network for musculoskeletal tissue segmentation and biomarkers discovery for outcome prediction and disease trajectory. https://profiles.ucsf.edu/valentina.pedoia Best regards, Katja ---------------------------------------------------------------- Katja Riipinen, PhD (Genet.), BHSc Koordinaattori | Coordinator Medical Research Center Oulu<https://www.oulu.fi/mrc/> | MRC Oulu Tel. 0294 48 5909, Mobile +358 50 472 9414 PO Box 5000, FI-90014 OULUN YLIOPISTO (Aapistie 5A, Room 347B) www.oulu.fi<http://www.oulu.fi/yliopisto> [cid:image001.png@01D5F22A.A648E140]

1 0

FW: Updated instructions for travellers due to Corona virus
by Antti Haapalainen 04 Mar '20

04 Mar '20

From: Pirkko Huhtala <pirkko.huhtala(a)oulu.fi> Sent: 4. maaliskuutata 2020 12:59 To: 'bco-staff(a)lists.oulu.fi' <bco-staff(a)lists.oulu.fi>; fbmm(a)lists.oulu.fi; ltk-all <ltk-all(a)oulu.fi> Subject: Updated instructions for travellers due to Corona virus Dear all, please note the updated instructions about traveling to and from the Corona virus epidemic areas for University personnel and students, and visitors! https://patio.oulu.fi/fi/uutiset/koronavirus-covid-19-tarkennetut-ohjeet-43… https://patio.oulu.fi/en/news/corona-virus-covid-19-updated-instructions-4t… Pirkko Huhtala, Ph.D. Coordinator Biocenter Oulu University of Oulu Mailing address: P.O.Box 5000, FIN-90014 University of Oulu Finland Street address: 476B, Aapistie 5A, FIN-90220 Oulu Tel. sis/int. 486101, ulk./Ext. 0294 486101 Tel. +358-294 486101 e-mail pirkko.huhtala(a)oulu.fi<mailto:pirkko.huhtala@oulu.fi> www.oulu.fi/biocenter<http://www.oulu.fi/biocenter>

1 0

FW: Post doc position in University of Helsinki
by Antti Haapalainen 04 Mar '20

04 Mar '20

From: Pirkko Huhtala <pirkko.huhtala(a)oulu.fi> Sent: 4. maaliskuutata 2020 8:42 To: fbmm(a)lists.oulu.fi; ltk-all <ltk-all(a)oulu.fi>; 'bco-staff(a)lists.oulu.fi' <bco-staff(a)lists.oulu.fi>; bco(a)lists.oulu.fi Subject: Post doc position in University of Helsinki FYI Post doc position in University of Helsinki. Kuure laboratory invites applications for a position of POSTDOCTORAL RESEARCHER IN FinnDisMice PROJECT _ _ _ Satu Kuure, PhD GM-Unit at HiLIFE / STEMM Research Program, Faculty of Medicine University of Helsinki Finland tel: +358 2941 59395 cell: +358 40 7706242

1 0

MRC Oulu News - March 6 - Public defence of doctoral dissertation
by Katja Riipinen 03 Mar '20

03 Mar '20

MRC Oulu Hello everyone, On Friday March 6th, there will be the following public defence of doctoral dissertation: Deep learning for knee osteoarthritis diagnosis and progression prediction from plain radiographs and clinical data<http://jultika.oulu.fi/Record/isbn978-952-62-2552-4> Doctoral candidate: Master of Science Aleksei Tiulpin Date: 6 March 2020, starting at 12.00 Location: Auditorium P117, the faculty of Medicine, University of Oulu (Aapistie 5B) Opponent: Assistant professor Valentina Pedoia, University of California, San Francisco Custos: Professor Simo Saarakkala, University of Oulu Thesis: http://jultika.oulu.fi/Record/isbn978-952-62-2552-4 Feel free to distribute this announcement further. Best regards, Katja ---------------------------------------------------------------- Katja Riipinen Koordinaattori | Coordinator Medical Research Center Oulu<https://www.oulu.fi/mrc/> | MRC Oulu Tel. 0294 48 5909, Mobile +358 50 472 9414 PO Box 5000, FI-90014 OULUN YLIOPISTO (Aapistie 5A, Room 347B) www.oulu.fi<http://www.oulu.fi/yliopisto> [cid:image001.png@01D5F17D.6FDE18D0]

1 0

Mitä uutta lasten, nuorten ja aikuisten lihavuudesta – lihavuuden Käypä hoito -suositus käyttöön /koulutus 22.4.
by Meri Rova 03 Mar '20

03 Mar '20

Tiedoksenne ja eteenpäin välitettäväksi: Terveyden ja hyvinvoinnin laitos (THL), Suomalaisen Lääkäriseuran Duodecimin Käypä hoito -yksikkö ja Suomen Lihavuustutkijat ry järjestävät koulutuksen keskiviikkona 22.4. aiheena lasten, nuorten ja aikuisten lihavuus. Koulutus on tarkoitettu terveydenhuollon ammattilaisille perusterveydenhuollosta erikoissairaanhoitoon sekä kaikille toimijoille, jotka edistävät terveyttä ja painonhallintaa tukevien elintapojen toteutumista. Koulutuksessa käsitellään päivitettyä Lihavuuden Käypä hoito -suositusta, joka sisältää lasten, nuorten ja aikuisten lihavuuden ehkäisyn ja hoidon. Lisäksi päivän aikana käydään läpi elintapaneuvontaa ja lihavuuden puheeksi ottamista, kansallisia ravitsemussuosituksia eri-ikäisille ja lihavuuden ehkäisyä yhteiskunnallisesta näkökulmasta. Koulutusta on mahdollista seurata myös verkossa livenä. Lisätietoa THL:n sivuilla / tapahtumat: Mitä uutta lasten, nuorten ja aikuisten lihavuudesta – lihavuuden Käypä hoito -suositus käyttöön<https://thl.fi/fi/ajankohtaista/tapahtumat/tapahtumakalenteri/-/event/56011…> Ystävällisin terveisin – Kind regards Meri Rova Viestintäasiantuntija, FT | Communications Specialist, PhD Oulun yliopisto | University of Oulu Viestintä, markkinointi ja yhteiskuntasuhteet | Communications, Marketing and Public Affairs Tel. +358-(0)50 464 3361 PO Box 5000, FI-90014 OULUN YLIOPISTO www.oulu.fi<http://www.oulu.fi/yliopisto> [cid:image002.jpg@01D5F175.83F1B0A0] Follow us on Facebook<https://www.facebook.com/unioulu/>, Instagram<https://www.instagram.com/unioulu/?hl=fi>, Linkedin<https://www.linkedin.com/school/university-of-oulu/> and Twitter<https://twitter.com/unioulu>. The content of this message is confidential. If you are not a recipient indicated or intended in this message or you think this message may have been addressed to you in error, please inform us by an email reply and then delete the message. In such case it is forbidden to copy, forward, or in any way reveal the contents of this message to anyone.

1 0

2026

2025

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

2010

2009

2008

2007

2006

2005

2004

Crc March 2020